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Nature Commun. | 基因組所研究揭示蓖麻重要農(nóng)業(yè)性狀

2019-08-14 04:31:00來源:

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  近日,基因組所崔鵬課題組應用重測序方法揭示了蓖麻重要農(nóng)業(yè)性狀,,研究成果《Sequencing of Chinese castorlines reveals genetic signatures of selection and yield-associated loci》發(fā)表在《Nature Communication(自然通訊)》上,。崔鵬課題組通過對405份蓖麻材料重測序揭示了農(nóng)業(yè)性狀相關(guān)的候選基因以及蓖麻馴化和地理分化過程中的一些選擇位點。

  

  目前,,Next Generation Sequencing技術(shù)成本降低,,基于全基因組重測序的分析方法逐漸完善,已有多種作物進行了基于全基因組重測序的馴化位點,、農(nóng)業(yè)性狀關(guān)聯(lián)基因位點相關(guān)的研究,,驗證了基因組重測序是研究作物農(nóng)業(yè)性狀相關(guān)基因的有效手段。

  蓖麻是一年或多年生大戟科雙子葉植物,,蓖麻籽含油量可達40%-50%,,蓖麻油因其特殊的理化性質(zhì)是重要的工業(yè)用油,經(jīng)過裂解,、氧化,、硫化等處理后,可以用于醫(yī)藥分散劑,,油漆涂料,,工業(yè)航空潤滑油、化妝品等,。目前工業(yè)缺口巨大,。

  

  研究中利用變異數(shù)據(jù)進行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),發(fā)現(xiàn)了九個重要農(nóng)藝性狀的候選基組區(qū)域或基因,;通過群體遺傳研究,,發(fā)現(xiàn)國內(nèi)的蓖麻品種分布具有區(qū)域性特點,例如從中國南部到北部,,蓖麻表現(xiàn)出果穗從容易裂開到不容易裂開,、穗高由高降低等顯著趨勢。利用蓖麻的區(qū)域性特點,,找到了基因組區(qū)域上與蓖麻分布相關(guān)的受選擇區(qū)域,,將這些受選擇區(qū)域與GWAS結(jié)果相結(jié)合后,找到了受選擇性狀的在基因組上的具體受選擇位點。在自然界野生狀態(tài)下,,果穗在一定時期開裂,,種子跳出,是有利于繁殖的性狀,,大豆,,擬南芥都有關(guān)于這一性狀的深入研究。但是這種性狀對較大規(guī)模種植,,甚至是初步的人工種植的收獲過程,,都是不利的。 研究中發(fā)現(xiàn)裂果相關(guān)基因在蓖麻南北地理分布中被選擇,,這也暗示了北方蓖麻受到了更大的選擇壓力,。 

  

  文章鏈接:https://doi.org/10.1038/s41467-019-11228-3

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