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基因組所與多家單位聯(lián)合首次揭示入侵中國(guó)草地貪夜蛾生物型遺傳背景和抗藥性特征

2019-10-23 12:00:00來源:

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  10月21日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(以下簡(jiǎn)稱“基因組所”)生態(tài)基因組學(xué)中心與中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,、英國(guó)蘭卡斯特大學(xué),、法國(guó)蒙彼利埃大學(xué)等多家單位聯(lián)合發(fā)布了高質(zhì)量草地貪夜蛾基因組序列,首次從基因組層面揭示入侵我國(guó)的草地貪夜蛾群體的生物型遺傳背景和抗藥性特征,,研究成果在線發(fā)表于BioRxiv上,。

  

  圖1. 入侵中國(guó)的草地貪夜蛾為玉米型遺傳背景為主導(dǎo)的種群

  

  該研究通過Illumina、PacBio,、Hi-C等高通量測(cè)序技術(shù),,構(gòu)建了一套染色體水平的高質(zhì)量草地貪夜蛾基因組序列,contig N50達(dá)到5.6 M,,是目前為止組裝質(zhì)量最好的草地貪夜蛾基因組序列,。進(jìn)一步對(duì)我國(guó)16省(市,、自治區(qū))的105份樣品進(jìn)行了重測(cè)序,,揭示入侵我國(guó)的草地貪夜蛾為一種以玉米型遺傳背景為主導(dǎo)的“雜交型”;抗性相關(guān)基因掃描檢測(cè)發(fā)現(xiàn)入侵中國(guó)群體對(duì)傳統(tǒng)有機(jī)磷類農(nóng)藥,、有機(jī)氯類農(nóng)藥和擬除蟲菊酯類農(nóng)藥具有較高的抗性基因變異頻率,,而沒有檢測(cè)到對(duì)新型酰胺類農(nóng)藥和Bt毒素抗性基因變異位點(diǎn),預(yù)示對(duì)相關(guān)傳統(tǒng)農(nóng)藥抗性風(fēng)險(xiǎn)很高,。而生測(cè)結(jié)果也證實(shí)對(duì)有機(jī)磷和擬除蟲菊酯類農(nóng)藥具有較高的抗性,,而對(duì)新型酰胺類農(nóng)藥和Bt毒素比較敏感。

  

  圖2. 入侵中國(guó)的草地貪夜蛾對(duì)有機(jī)磷等農(nóng)藥抗性較高

  

  這一研究成果表明有機(jī)磷類農(nóng)藥,、有機(jī)氯類農(nóng)藥和擬除蟲菊酯類等傳統(tǒng)農(nóng)藥目前不宜用于入侵中國(guó)草地貪夜蛾的防治,,而酰胺類農(nóng)藥、Bt毒素和Bt作物可以有效防治草地貪夜蛾,。這一成果的取得對(duì)草地貪夜蛾的科學(xué)防控具有重要指導(dǎo)意義,。基因組所助理研究員張磊和植保所博士后張丹丹等為文章的第一作者,,蕭玉濤研究員,、吳孔明院士、錢萬強(qiáng)研究員和樊偉研究員為文章的共同通訊作者,。

 

      文章鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/813154v1

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