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科研進(jìn)展| 基因組所協(xié)同創(chuàng)新研究發(fā)現(xiàn)植物株形調(diào)控新機制

2020-07-16 06:10:00來源:

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  7月13日,,國際學(xué)術(shù)期刊《自然-植物(Nature Plants)》在線發(fā)表了中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所(以下簡稱“基因組所”)與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜所等單位的協(xié)同創(chuàng)新研究成果。這篇題為“Regulation of plant architecture by a new histone acetyltransferasetargeting gene bodies”的研究成果,,通過研究TCP家族的CYC/TB1類轉(zhuǎn)錄因子—黃瓜卷須身份基因TEN調(diào)控卷須發(fā)育和運動的分子機制,,為基因內(nèi)部結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子是如何調(diào)控基因表達(dá)這一基礎(chǔ)的科學(xué)問題提供了一個重要的解答,。

  在真核生物中,,許多重要的發(fā)育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子被發(fā)現(xiàn)能夠結(jié)合到基因內(nèi)部。目前,,轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合啟動子或遠(yuǎn)端的增強子調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的機制已經(jīng)比較清楚,,但其結(jié)合到基因內(nèi)部調(diào)控基因表達(dá)的分子機制卻知之甚少。研究團(tuán)隊先是研究克隆了控制黃瓜卷須發(fā)育的身份基因TEN,,并揭示了黃瓜卷須的同源器官是側(cè)枝——這一曾經(jīng)困擾達(dá)爾文的植物發(fā)育學(xué)謎題,。

  接著,,通過對TEN調(diào)控卷須的形態(tài)發(fā)育和運動能力的分子機制研究,研究團(tuán)隊揭示了TEN通過直接調(diào)控乙烯的合成來控制卷須的形態(tài)和攀援,。研究發(fā)現(xiàn),,TEN是一個新型的多功能轉(zhuǎn)錄因子,其C端負(fù)責(zé)結(jié)合到下游靶標(biāo)的基因內(nèi)增強子上,,其N端結(jié)構(gòu)域是一類全新的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶,,主要乙酰化修飾組蛋白H3的球體區(qū)域,,維持染色質(zhì)開放,,從而激活靶標(biāo)基因表達(dá)。TCP家族的CYC / TB1類轉(zhuǎn)錄因子在作物株型調(diào)控中起著核心作用,。該團(tuán)隊通過分析TEN在玉米中的同源基因TB1,,發(fā)現(xiàn)TB1通過相同的機制結(jié)合到關(guān)鍵靶標(biāo)的基因內(nèi)增強子激活基因表達(dá);因此揭示了CYC/TB1類轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)調(diào)控新機制,。

  TEN binds to intragenicenhancers of its target genes

  進(jìn)一步針對人類中增強子結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子—HSF-1和ERα的全基因組結(jié)合數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,研究人員推測,,在真核生物中,,組蛋白球體區(qū)域乙酰化有可能是基因內(nèi)部增強子表達(dá)調(diào)控的一個保守機制,。該研究成果為揭示轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合到基因內(nèi)部如何調(diào)控基因表達(dá)的科學(xué)問題提出了新的見解,,也為深入認(rèn)識株型發(fā)育的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了重要的突破,并可直接用于培育輕簡化栽培的黃瓜新品種,。

  該論文的第一作者中國農(nóng)科院蔬菜花卉研究所楊學(xué)勇研究員,、基因組所閆健斌研究員和西北農(nóng)林科技大學(xué)畢業(yè)博士生張震。通訊作者為基因組所黃三文研究員,。該研究得到了國家自然科學(xué)重點基金,、國家自然科學(xué)基金面上項目、國家重點研發(fā)計劃等項目的資助,。

  原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41477-020-0715-2

  

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