研究所簡介

　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心）創(chuàng)建于2014年，是農(nóng)業(yè)農(nóng)村部和中國農(nóng)科院在科技體制改革的背景下,，整合農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究力量在深圳成立的新型研究所,。

　　成立以來，基因組所深入貫徹落實習(xí)近平總書記“四個面向”“兩個一流”指示精神,，深入開展科研自主權(quán)改革試點工作,，被列為中國農(nóng)科院現(xiàn)代院所改革的“試驗田”，建設(shè)了由中國農(nóng)科院與深圳市主管領(lǐng)導(dǎo)任共同理事長的理事會,；組建了包含中科院院士和國家杰青等50余位高層次人才在內(nèi)的近600人的研究隊伍,；建設(shè)了以組學(xué)技術(shù)為核心、輻射農(nóng)業(yè),、食品和生態(tài)方向的學(xué)科體系,，獲批“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心”“ 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)基因數(shù)據(jù)分析重點實驗室”等創(chuàng)新載體；在包括 Science,、Nature,、Cell 等頂級期刊在內(nèi)的雜志上發(fā)表SCI論文300多篇，以基因組設(shè)計育種育成國審,、省審新品種20余個,，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)等研究領(lǐng)域占據(jù)世界前沿。2020年自然指數(shù)排名全國農(nóng)業(yè)類科研院所第一名,，多項成果入選“‘十三五’農(nóng)業(yè)科技十大標志性成果”“中國生命科學(xué)十大進展”“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)十大進展”,。

　　基因組所聯(lián)合深圳市相關(guān)部門提出了“深圳國際食品谷”，規(guī)劃已得到市政府批準,，將構(gòu)建農(nóng)業(yè)食品產(chǎn)學(xué)研協(xié)作生態(tài),，做出科技推動農(nóng)業(yè)食品產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型升級的先行示范。

　　課題組簡介

　　阮玨課題組,，主要研究領(lǐng)域為高通量測序技術(shù)下的生物信息學(xué)算法研發(fā)和應(yīng)用,。團隊研究方向主要包括全基因組組裝算法、極低頻點突變檢測,、基因組結(jié)構(gòu)變異檢測,、DNA存儲技術(shù)、以及基因組分析技術(shù)開發(fā),。1）研發(fā)計算效率極高的三代長序列組裝算法,，以降低大型復(fù)雜基因組組裝對計算資源的巨大需求；2）為提高結(jié)構(gòu)變異的檢測準確性和敏感性,，開發(fā)高效算法,；3）為針對性提高基因組極低頻突變測序的檢測效率與數(shù)據(jù)利用率，開發(fā)新型高效測序檢測技術(shù)；4）實現(xiàn)產(chǎn)學(xué)研結(jié)合,，將基因組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到科研項目,，輔助解決重大科研問題。

　　課題組長阮玨,，研究員,，博士生導(dǎo)師，組學(xué)技術(shù)研究中心主任,，國家優(yōu)秀青年基金獲得者,，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部“杰出青年農(nóng)業(yè)科學(xué)家”,；主要研究領(lǐng)域為基因組序列比對與序列組裝,參與開發(fā)MAQ,、SAMTools,、SOAPdenovo,、Pseudo-sanger、Rainbow,、Novobreak,、SAMRTdenovo、WTDBG等算法軟件,，還設(shè)計開發(fā)了Droplet-CirSeq,、EasyMF、O2N-Seq等測序方法,。學(xué)術(shù)論文發(fā)表在Nature,、Nature Methods、Nature Genetics,、Genome Research,、Nature Communications、Bioinformatics等期刊,，累計他引超過14,000次,。（http://baixile.com/rcpy/nkyrc/zgnykxynkyctszcljrcrxzalblcl/230318.htm）

　　項目簡介

　　“國家重點研發(fā)計劃--新型生物納米孔測序技術(shù)的研發(fā)及測序儀的研制”針對新型納米孔測序電信號的特點，引入序列組成結(jié)構(gòu)對堿基過孔速度影響的先驗?zāi)Ｐ?，泛化“分?預(yù)測”的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),，擴展識別堿基的字符空間，設(shè)計出高效準確的解碼算法,，將新型納米孔測序儀產(chǎn)出的電信號解碼為終端用戶可用的堿基序列,。

　　深圳市基礎(chǔ)研究機構(gòu)“多組學(xué)算法研發(fā)”任務(wù)，以“從基因組學(xué)到表型組學(xué)”為核心設(shè)計思路,，在強化基因組學(xué)算法的基礎(chǔ)上,，突破組學(xué)核心算法技術(shù)。創(chuàng)新復(fù)雜基因組分析技術(shù)，突破超大基因組和多倍體基因組的拼接算法,，開發(fā)基于圖論的結(jié)構(gòu)變異檢測算法,、多組學(xué)數(shù)據(jù)基因注釋整合算法，輕設(shè)施表型組圖像識別算法等一系列組學(xué)算法技術(shù),，初步建成國際農(nóng)業(yè)組學(xué)算法研發(fā)中心,。

　　招聘需求

　　現(xiàn)針對以上兩項任務(wù)，面向社會公開招聘序列分析算法研發(fā),、深度學(xué)習(xí)算法開發(fā),、測序?qū)嶒灧椒ㄑ邪l(fā)等方向的研究人員3~5名，共同參與項目開發(fā),。

　　崗位要求

　　本科（含）以上學(xué)歷,； 身體健康，年齡在35周歲以下,； 熟悉掌握分析算法研發(fā),，深度學(xué)習(xí)編程，測序?qū)嶒炑邪l(fā)等技術(shù)之一,； 滿足以下條件的研究人員優(yōu)先：

　　1）知名算法軟件或?qū)嶒灱夹g(shù)主要開發(fā)者,；

　　2）有基因組學(xué)/生物信息學(xué)背景（或經(jīng)驗）者；

　　3）有深度學(xué)習(xí)背景（或經(jīng)驗）者,；

　　4）程序設(shè)計大賽獲獎?wù)撸?/span>

　　5）獨立開發(fā)較大規(guī)模程序代碼者,。

　　相關(guān)待遇

　　稅前月薪8000~25000元，根據(jù)能力和經(jīng)驗面議,； 相關(guān)社會保險公積金及其他符合人才政策的待遇按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行,； 其他：

　　1）鼓勵以一作或通訊作者發(fā)表學(xué)術(shù)論文；

　　2）提供科研晉升通道,。

　　應(yīng)聘方式

　　請將個人簡歷以電子郵件形式發(fā)送到：[email protected],，郵件主題為“應(yīng)聘+姓名”，個人簡歷應(yīng)包含教育背景,、工作經(jīng)歷,、研究成果等。應(yīng)聘材料請壓縮成一個zip文件以附件發(fā)送,。所有應(yīng)聘材料我們會仔細分析并保密,，一旦候選人確定后，將邀請您進行面試,。

　　聯(lián)系方式

　　阮玨 <[email protected]>,、謝欣 <[email protected]>