團隊介紹 

　　中國農業(yè)科學院（深圳）農業(yè)基因組研究所（簡稱“基因組所”）程時鋒團隊主要從事植物比較進化基因組學、作物群體遺傳學,、及關鍵性狀遺傳解析等研究工作,。發(fā)起和主持全球“谷-豆”基因組國際聯盟協助組（http://www.g3rp.com/）,，并建立以“小麥”和“豌豆”為標桿的禾本科及豆科模式研究對象,。在圍繞“植物是如何獲得新性狀及其遺傳演化分子機制解析”這一科學問題中,，從物種水平(Phylogenomics),、群體水平(Population Genetics),、以及關鍵表型性狀的泛組學等不同時空維度的策略中展開研究工作，建立起了植物trait-based的進化基因組學研究方法,、作物群體gene-trait關聯和連鎖基因發(fā)現和解析體系,。

　　主要課題包括：（1）“谷-豆”國際基因組聯盟計劃（http://www.g3rp.com/）下的禾本科作物和豆科豆類比較基因組和群體基因組；（2）結瘤生物固氮分支N2-fixing Root Nodule Symbiosis祖先新性狀起源與多樣性演化的基因表達表觀調控機制,；（3）C4高光合大規(guī)模比較進化基因組學,，及其起源和平行演化的分子機制。并陸續(xù)開展基因組大數據指導下的,、圍繞地方適應性,、氮/碳藕聯和高效等方面的作物新品種選育、培育等分子育種及應用工作,。團隊先后參與完成了多個重大項目,，相關研究成果以第一或通訊作者(含共同)發(fā)表在Science（2篇）、CELL,、Nature Biotechnology,、Plant Cell等雜志10篇，共發(fā)表SCI論文40余篇,，他引10000余次,。多篇文章被F1000重點推薦,，多次主持國際學術研討會并作報告。目前擁有團隊成員15名,，主要來自計算機科學,、基因組學,、生物信息學,、植物分子生物學、進化與群體遺傳學等多個學科,。

 

　　招聘需求 

　　1. 植物進化基因組,、多組學和群體遺傳信息大數據分析科研助理3名；

　　2. 生物信息學算法開發(fā)博士后1名,；

　　3. 生物信息學算法開發(fā)工程師1名,；

　　4．田間育種專員2名。

　　

　　研究工作包括：

　　1．生信分析或算法/工具開發(fā)

　?。?）基因組功能元件,、序列模型預測深度學習算法、流程開發(fā),；

　?。?）植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進化基因組學方法構建；

　?。?）開發(fā)群體遺傳學單倍型多樣性挖掘及基因發(fā)現新方法,；

　　（4）開發(fā)群體基因組大的結構性變異(pan-sv),、泛基因(pan-genome),、以及基于變異矩陣的全基因組關聯分析（GWAS）方法；

　?。?）利用深度學習等算法整合基因大數據,，開發(fā)表征量化可視化方法，開發(fā)數據庫,，建設網站在線分析工具,。

　　

　　2. 田間育種專員 （1）作物田間實驗設計、規(guī)劃和管理,；

　?。?）作物表型鑒定、組織/核酸/材料提取等樣本文庫制備,。

　　

　　申請條件 

　　1. 科研助理

　?。?）985/211本科畢業(yè)，生物信息學或計算機專業(yè),；

　　熟練使用Linux系統(tǒng),，至少熟練掌握Perl,、Python、R,、C/C++,、JAVA等語言中的兩種；

　　有相關計算機,、生物信息工作經驗或以第一作者發(fā)表文章者優(yōu)先,。

　　

　　2. 博士后

　　（1）博士學位,，數學,、計算機科學、數理統(tǒng)計,、生物信息學,、物理學、基因組學等相關專業(yè),；熟練使用Linux系統(tǒng),，至少熟練掌握Perl、Python,、R,、C/C++、JAVA等語言中的兩種,；

　?。?）勤于思考，能獨立開展課題研究,，學術態(tài)度嚴謹,，善于團隊合作；

　?。?）良好的溝通能力和中英文科技寫作能力,；

　　（4）不超過35周歲,，近3年在國際學術刊物以第一作者發(fā)表過或即將發(fā)表SCI論文,。

　　

　　3. 田間育種專員

　　（1）碩士及以上學歷,，育種相關專業(yè),，具有作物（小麥優(yōu)先）育種相關的理論知識；

　?。?）1年以上從事作物育種的工作經驗,，如作物品種的選育；

　　（3）具有一定的計算機運用能力,，能獨立完成相關數據收集,、錄入和分析；

　?。?）工作認真,，有責任感，執(zhí)行力強,，工作效率高,；良好的溝通能力和團隊協作能力；

　?。?）英語寫作和口語優(yōu)秀者,，優(yōu)先考慮。

 

　　申請方式 

　　申請者請將個人簡歷（包含教育經歷,、研究經歷、論文發(fā)表）,、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected],，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請職位名稱”。我們會仔細分析并保密所有申請資料,，并在收到申請的一個月內與初審合格者電話或E-mail聯系,，安排面試；資格審查未通過者,，不再另行告知,。

　　

　　相關待遇 

　　1.博士后

　　（1）按照深圳市,、大鵬新區(qū)相關規(guī)定,，博士后在站期間享受在站博士后生活補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準,，目前為稅后60萬元（分兩年發(fā)放）,。

　　（2）按照研究所的相關規(guī)定提供博士后的工資,、五險一金和績效待遇,。

　　（3）博士后人員進站后,，可選擇落戶深圳市,，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶，并且享受深圳市和大鵬新區(qū)的新引進人才生活補貼,，具體金額以政府最新規(guī)定為準,，目前為稅后共計6萬元（分兩年發(fā)放）。

　　（4）博士后出站后留深工作且符合條件的,，可被認定為深圳市后備級高層次人才,，獲得人才獎勵，認定標準和獎勵金額以政府最新規(guī)定為準,。

　　

　　2.科研助理,、田間育種專員

　　薪資待遇面議，相關社會保險及公積金按照深圳市有關規(guī)定執(zhí)行,。

 

　　程時鋒代表論文

　　1. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.

　　2. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S?. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.

　　3. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

　　4. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.

　　5. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

　　6. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into repro