研究所簡介

　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心）創(chuàng)建于2014年，是農(nóng)業(yè)農(nóng)村部和中國農(nóng)科院在科技體制改革的背景下,，整合農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究力量在深圳成立的新型研究所。

　　成立以來,，基因組所深入貫徹落實(shí)習(xí)近平總書記“四個(gè)面向”“兩個(gè)一流”指示精神，深入開展科研自主權(quán)改革試點(diǎn)工作,，被列為中國農(nóng)科院現(xiàn)代院所改革的“試驗(yàn)田”,，建設(shè)了由中國農(nóng)科院與深圳市主管領(lǐng)導(dǎo)任共同理事長的理事會(huì)；組建了包含中科院院士和國家杰青等50余位高層次人才在內(nèi)的近600人的研究隊(duì)伍,；建設(shè)了以組學(xué)技術(shù)為核心,、輻射農(nóng)業(yè)、食品和生態(tài)方向的學(xué)科體系,，獲批“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心”“ 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)基因數(shù)據(jù)分析重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”等創(chuàng)新載體,；在包括 Science、Nature,、Cell 等頂級(jí)期刊在內(nèi)的雜志上發(fā)表SCI論文300多篇,，以基因組設(shè)計(jì)育種育成國審、省審新品種20余個(gè),，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)等研究領(lǐng)域占據(jù)世界前沿,。2020年自然指數(shù)排名全國農(nóng)業(yè)類科研院所第一名，多項(xiàng)成果入選“‘十三五’農(nóng)業(yè)科技十大標(biāo)志性成果”“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)十大進(jìn)展”,。

　　基因組所聯(lián)合深圳市相關(guān)部門提出了“深圳國際食品谷”,，規(guī)劃已得到市政府批準(zhǔn)，將構(gòu)建農(nóng)業(yè)食品產(chǎn)學(xué)研協(xié)作生態(tài),，做出科技推動(dòng)農(nóng)業(yè)食品產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)的先行示范,。

　　課題組簡介

　　阮玨課題組，主要研究領(lǐng)域?yàn)楦咄繙y序技術(shù)下的生物信息學(xué)算法研發(fā)和應(yīng)用,。團(tuán)隊(duì)研究方向主要包括全基因組組裝算法,、極低頻點(diǎn)突變檢測、基因組結(jié)構(gòu)變異檢測,、DNA存儲(chǔ)技術(shù),、以及基因組分析技術(shù)開發(fā)。1）研發(fā)計(jì)算效率極高的三代長序列組裝算法,，以降低大型復(fù)雜基因組組裝對計(jì)算資源的巨大需求；2）為提高結(jié)構(gòu)變異的檢測準(zhǔn)確性和敏感性，開發(fā)高效算法,；3）為針對性提高基因組極低頻突變測序的檢測效率與數(shù)據(jù)利用率,，開發(fā)新型高效測序檢測技術(shù)；4）實(shí)現(xiàn)產(chǎn)學(xué)研結(jié)合,，將基因組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到科研項(xiàng)目,，輔助解決重大科研問題。

　　課題組長阮玨,，研究員,，博士生導(dǎo)師，組學(xué)技術(shù)研究中心主任,，國家優(yōu)秀青年基金獲得者,，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部“杰出青年農(nóng)業(yè)科學(xué)家”,；主要研究領(lǐng)域?yàn)榛蚪M序列比對與序列組裝,參與開發(fā)MAQ,、SAMTools、SOAPdenovo,、Pseudo-sanger,、Rainbow、Novobreak,、SAMRTdenovo,、WTDBG等算法軟件，還設(shè)計(jì)開發(fā)了Droplet-CirSeq,、EasyMF,、O2N-Seq等測序方法。學(xué)術(shù)論文發(fā)表在Nature,、Nature Methods,、Nature Genetics、Genome Research,、Nature Communications,、Bioinformatics等期刊，累計(jì)他引超過14,000次,。（http://baixile.com/rcpy/nkyrc/zgnykxynkyctszcljrcrxzalblcl/230318.htm）

　　項(xiàng)目簡介

　　“國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃--新型生物納米孔測序技術(shù)的研發(fā)及測序儀的研制”針對新型納米孔測序電信號(hào)的特點(diǎn),，引入序列組成結(jié)構(gòu)對堿基過孔速度影響的先驗(yàn)?zāi)Ｐ停夯胺指?預(yù)測”的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),，擴(kuò)展識(shí)別堿基的字符空間,，設(shè)計(jì)出高效準(zhǔn)確的解碼算法，將新型納米孔測序儀產(chǎn)出的電信號(hào)解碼為終端用戶可用的堿基序列,。

　　深圳市基礎(chǔ)研究機(jī)構(gòu)“多組學(xué)算法研發(fā)”任務(wù),，以“從基因組學(xué)到表型組學(xué)”為核心設(shè)計(jì)思路,，在強(qiáng)化基因組學(xué)算法的基礎(chǔ)上，突破組學(xué)核心算法技術(shù),。創(chuàng)新復(fù)雜基因組分析技術(shù),，突破超大基因組和多倍體基因組的拼接算法，開發(fā)基于圖論的結(jié)構(gòu)變異檢測算法,、多組學(xué)數(shù)據(jù)基因注釋整合算法,，輕設(shè)施表型組圖像識(shí)別算法等一系列組學(xué)算法技術(shù)，初步建成國際農(nóng)業(yè)組學(xué)算法研發(fā)中心,。

　　招聘需求

　　現(xiàn)針對以上兩項(xiàng)任務(wù),，面向社會(huì)公開招聘序列分析算法研發(fā)、深度學(xué)習(xí)算法開發(fā),、測序?qū)嶒?yàn)方法研發(fā)等方向的研究人員3~5名,，共同參與項(xiàng)目開發(fā)。

　　崗位要求

　　本科（含）以上學(xué)歷,； 身體健康,，年齡在35周歲以下； 熟悉掌握分析算法研發(fā),，深度學(xué)習(xí)編程,，測序?qū)嶒?yàn)研發(fā)等技術(shù)之一； 滿足以下條件的研究人員優(yōu)先：

　　1）知名算法軟件或?qū)嶒?yàn)技術(shù)主要開發(fā)者,；

　　2）有基因組學(xué)/生物信息學(xué)背景（或經(jīng)驗(yàn)）者,；

　　3）有深度學(xué)習(xí)背景（或經(jīng)驗(yàn)）者；

　　4）程序設(shè)計(jì)大賽獲獎(jiǎng)?wù)撸?/span>

　　5）獨(dú)立開發(fā)較大規(guī)模程序代碼者,。

　　相關(guān)待遇

　　稅前月薪8000~25000元,，根據(jù)能力和經(jīng)驗(yàn)面議； 相關(guān)社會(huì)保險(xiǎn)公積金及其他符合人才政策的待遇按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行,； 其他：

　　1）鼓勵(lì)以一作或通訊作者發(fā)表學(xué)術(shù)論文,；

　　2）提供科研晉升通道。

　　應(yīng)聘方式

　　請將個(gè)人簡歷以電子郵件形式發(fā)送到：[email protected],，郵件主題為“應(yīng)聘+姓名”,，個(gè)人簡歷應(yīng)包含教育背景、工作經(jīng)歷,、研究成果等,。應(yīng)聘材料請壓縮成一個(gè)zip文件以附件發(fā)送。所有應(yīng)聘材料我們會(huì)仔細(xì)分析并保密,，一旦候選人確定后,，將邀請您進(jìn)行面試。

　　聯(lián)系方式

　　阮玨 <[email protected]>,、謝欣 <[email protected]>