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在希望的田野上,書寫我們的夢想

夏日炎炎,廣袤田野生機(jī)盎然。麥田里,成熟的麥穗在陽光的照射下顯得格外金黃,瓜田里,碧綠的西瓜已成熟落蒂,在這個成熟與收獲的季節(jié),基因組所深圳研究生院的莘莘學(xué)子也將從田野里出發(fā),走向廣闊的人生。


這個畢業(yè)季,我們邀請了三位畢業(yè)生代表,與我們共同分享他們在基因組所的成長故事和他們在田間的追夢之旅。


胡勇:“做一個新時代農(nóng)民”

姓名:胡勇

研究方向:生物信息整合與模擬

導(dǎo)師:黃三文

發(fā)表論文情況:以共同第一作者在Cell上發(fā)表論文一篇

[1] WU Y*, LI D*, HU Y*, LI H, RAMSTEIN G P, ZHOU S, ZHANG X, BAO Z, ZHANG Y, SONG B, ZHOU Y, ZHOU Y, GAGNON E, S?RKINEN T, KNAPP S, ZHANG C, ST?DLER T, BUCKLER E S, HUANG S#, 2023. Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding. Cell [J]. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.008. (共同第一作者)

畢業(yè)去向:留所讀博



我從小在農(nóng)村長大,我的父母都是農(nóng)民。每當(dāng)農(nóng)忙的時候,放學(xué)后我就得立刻回家?guī)兔Ω苫睢S幸淮危覀兏畹咀痈畹搅送砩?點(diǎn),我感到又餓又累,腰都直不起來了。那時候,農(nóng)用機(jī)械還沒有普及,我們村里也沒有割稻機(jī),只能靠人工一點(diǎn)點(diǎn)地割。后來,我們終于有了割稻機(jī),幾個人的工作在不到1個小時內(nèi)就完成了,那是我第一次對科技改變農(nóng)業(yè)有了深刻的印象。


之后,出于對農(nóng)業(yè)的興趣,我選擇了學(xué)習(xí)生物專業(yè)。在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)畢業(yè)后,我決定來深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所深造,并成為了深圳研究生院成立后的第一屆研究生。我有幸加入了黃三文課題組從事生物信息學(xué)的研究。課題組就像一個大家庭,大家相互學(xué)習(xí)和成長,在學(xué)術(shù)交流中相互啟發(fā),在相處中建立了深厚的友誼。


在導(dǎo)師黃三文研究員和吳瑤瑤師姐的指導(dǎo)下,我參與了關(guān)于馬鈴薯有害突變的項(xiàng)目,并于2023年5月以共同第一作者在Cell雜志上發(fā)表了題為《Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding》的研究論文。在研究所的三年時間里,我結(jié)識了許多朋友,我們一起分享科研的樂趣和挑戰(zhàn),也一起玩游戲、聊天、放松身心。這讓我的生活充滿了樂趣和色彩。研究所提供了強(qiáng)大的導(dǎo)師團(tuán)隊(duì)、濃厚的學(xué)術(shù)氛圍和優(yōu)良的科研條件,這讓我決定留在研究所繼續(xù)攻讀博士學(xué)位。


我將一如既往地以解決問題為導(dǎo)向,繼續(xù)為科學(xué)研究做出貢獻(xiàn)。我相信在基因組所的學(xué)習(xí)和研究中,我會取得更多的成果,并為推動農(nóng)業(yè)科學(xué)的發(fā)展做出自己的貢獻(xiàn)。




張廣忠:"只要不放棄,終點(diǎn)總會到達(dá)"

姓名:張廣忠

研究方向:入侵植物的生物防控

導(dǎo)師:萬方浩、錢萬強(qiáng)課題組

發(fā)表論文情況:以第一作者在SCI一區(qū)Plant physiology發(fā)表論文一篇;以共同第一作者在SCI二區(qū)期刊Microorganisms發(fā)表論文一篇;專利一篇。

[1] Guangzhong Zhang?, Chenjiaozi Wang?, Xinghai Ren, Zaiyuan Li, Conghui Liu, Xi Qiao, Shicai Shen, Fudou Zhang, Fanghao Wan, Bo Liu*,Wanqiang Qian1* 2023, Inhibition of the rapid growth of invasive plant Mikania micrantha by host-specific rust (Puccinia spegazzinii). Plant physiology DOI: 10.1093/plphys/kiad186 (第一作者,SCI一區(qū))

[2]Xinghai Ren ?, Guangzhong Zhang ?, Mengjiao Jin, Fanghao Wan, Michael D. Day, Wanqiang Qian * and Bo Liu* 2023,Metabolomics and Transcriptomics Reveal the Response Mechanisms of Mikania micrantha to Puccinia spegazzinii infection. Microorganisms DOI:10.3390/microorganisms11030678 (共一第二作者,SCI二區(qū))

[3]一種抑制薇甘菊快速生長的生物方法 發(fā)明人:錢萬強(qiáng);劉博;張廣忠;喬曦;申時才;萬方浩(專利號:ZL 2022 1 0230108.4)

畢業(yè)去向:南開大學(xué)攻讀博士學(xué)位


我的研究方向是入侵生物學(xué),主要研究非本地物種對新環(huán)境的適應(yīng)和影響,生物入侵是一個全球性的挑戰(zhàn),了解生物入侵的機(jī)制和后果,對于制定有效的保護(hù)策略至關(guān)重要,能為保護(hù)本地生物多樣性提供解決方案,在學(xué)習(xí)入侵生物學(xué)的過程中,我獲得了許多寶貴的感悟和收獲,學(xué)習(xí)到了最新的研究方法和技術(shù),并得以參與到實(shí)際生物防治的項(xiàng)目中。三年的科研經(jīng)歷培養(yǎng)了我深入思考和分析問題的能力,它要求我不斷提出問題,以問題導(dǎo)向設(shè)計實(shí)驗(yàn)、收集數(shù)據(jù)和分析結(jié)果,有時,實(shí)驗(yàn)結(jié)果并不如預(yù)期,需要不斷調(diào)整實(shí)驗(yàn)方法,印象最深刻的是,我的論文從投稿到接收經(jīng)歷了漫長的修改和調(diào)整,歷程6個月的努力,終于得以成功發(fā)表,這個過程培養(yǎng)了我耐心和堅持的品質(zhì),我學(xué)會了從失敗中學(xué)習(xí),不斷改進(jìn)方法和實(shí)驗(yàn)設(shè)計。


作為一名研究生,我對未來充滿期待和憧憬。我深知研究生階段只是我科研生涯的起點(diǎn),我希望能夠在未來的道路上繼續(xù)努力并取得更大的成就。我想對未來自己說一句寄語:堅持不懈,追求卓越。在科研道路上,困難和挑戰(zhàn)是難以避免的,但只要我們保持激情和毅力,堅持自己的夢想,就一定能夠取得成功。




許亞蘋:"研究是對未知領(lǐng)域和未知世界的探索"

姓名:許亞蘋

專業(yè):農(nóng)藝與種業(yè)

中心:組學(xué)中心

導(dǎo)師:阮玨

獲獎情況:優(yōu)秀畢業(yè)生、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院社會活動優(yōu)秀獎、“深圳青年五四獎?wù)隆奔w成員

畢業(yè)去向:科研助理


在碩士期間,我的研究方向是DNA存儲的編解碼優(yōu)化設(shè)計,屬于BT(生物技術(shù))和IT(信息技術(shù))融合交叉的前沿研究,主要是根據(jù)堿基性質(zhì)來進(jìn)行信道轉(zhuǎn)移概率建模,簡單來說,我們是根據(jù)“簡并堿基”的存儲特性,提出具有“軟判決”思想的強(qiáng)糾錯算法,以期在更低的測序深度上實(shí)現(xiàn)信息的無錯讀取,來充分發(fā)揮簡并堿基的技術(shù)優(yōu)勢。


碩士期間的研究經(jīng)歷,也讓我更真實(shí)且充分地認(rèn)識到科學(xué)研究的復(fù)雜和嚴(yán)謹(jǐn)性。比如,充分的背景調(diào)研以及對所使用的工具建立完整的認(rèn)知,才會對錯誤產(chǎn)生的原因有充分的認(rèn)識,才能產(chǎn)生精細(xì)準(zhǔn)確的分析結(jié)果;而一些小的疏漏或者背景知識的欠缺可能會引起一系列的錯誤和失敗。而在實(shí)際科研過程中,我時常屢屢受挫。 面對這種情況,我也只能不斷地去調(diào)整和優(yōu)化自己做科研的態(tài)度和心態(tài)。盡可能減少失敗以及其負(fù)面情緒所帶來的內(nèi)耗,而是明確原因、總結(jié)規(guī)律、優(yōu)化調(diào)整再出發(fā)。


研究是對未知領(lǐng)域和未知世界的一種探索,會使人向往和激動。基因組所涵蓋多個研究中心和技術(shù)平臺,科研水平一流,實(shí)力強(qiáng)勁,且其中部分研究方向與生物信息學(xué)密切相關(guān)。因此,到基因組所讀研對我是一件很有吸引力的事情。在基因組所讀研期間,我充分感受到了大家對科研的熱情,比如我們課題組曾舉行過每周課題交流活動,全組人員都十分積極地響應(yīng)并參與其中,來介紹自己課題中背景知識和難點(diǎn)問題,或者講解近期讀到對課題有幫助地文獻(xiàn)。總的來說,基因組所全體人員共同打造出了所內(nèi)持續(xù)、開放、互助地科研氛圍,大家也十分樂意在互幫互助中共同進(jìn)步。


未來,我會不斷查漏補(bǔ)缺,注重知識積累,在生信的的道路上閃出些微自己的光火。我一直相信,前路漫漫,行則將至;行而不輟,未來可期。



新時代,農(nóng)村是充滿希望的田野,是干事創(chuàng)業(yè)的廣闊舞臺。基因組所深圳研究生院始終牢記習(xí)近平總書記的囑托和要求,繼續(xù)以立德樹人為根本,以強(qiáng)農(nóng)興農(nóng)為己任,建立“組學(xué)特色”課程體系,開設(shè)“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”、“表觀遺傳與基因組學(xué)”、“合成生物學(xué)”等優(yōu)勢課程,將研究生培養(yǎng)與研究所重大任務(wù)相結(jié)合。聯(lián)合巴馬院、鯤鵬院,努力辦好三個國家級科技小院,培養(yǎng)更多知農(nóng)愛農(nóng)新型人才,著力增強(qiáng)研究生發(fā)現(xiàn)問題、解決問題的能力和實(shí)踐創(chuàng)新能力,為全面推進(jìn)鄉(xiāng)村振興,加快農(nóng)業(yè)農(nóng)村現(xiàn)代化步伐,為加快建設(shè)農(nóng)業(yè)強(qiáng)國作出更大貢獻(xiàn)。