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Nature Commun. | 基因組所研究揭示蓖麻重要農(nóng)業(yè)性狀

2019-08-14 04:31:00來源:

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  近日,基因組所崔鵬課題組應用重測序方法揭示了蓖麻重要農(nóng)業(yè)性狀,,研究成果《Sequencing of Chinese castorlines reveals genetic signatures of selection and yield-associated loci》發(fā)表在《Nature Communication(自然通訊)》上,。崔鵬課題組通過對405份蓖麻材料重測序揭示了農(nóng)業(yè)性狀相關的候選基因以及蓖麻馴化和地理分化過程中的一些選擇位點,。

  

  目前,Next Generation Sequencing技術成本降低,,基于全基因組重測序的分析方法逐漸完善,,已有多種作物進行了基于全基因組重測序的馴化位點、農(nóng)業(yè)性狀關聯(lián)基因位點相關的研究,,驗證了基因組重測序是研究作物農(nóng)業(yè)性狀相關基因的有效手段,。

  蓖麻是一年或多年生大戟科雙子葉植物,蓖麻籽含油量可達40%-50%,,蓖麻油因其特殊的理化性質(zhì)是重要的工業(yè)用油,,經(jīng)過裂解,、氧化、硫化等處理后,,可以用于醫(yī)藥分散劑,,油漆涂料,工業(yè)航空潤滑油,、化妝品等,。目前工業(yè)缺口巨大。

  

  研究中利用變異數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析(GWAS),,發(fā)現(xiàn)了九個重要農(nóng)藝性狀的候選基組區(qū)域或基因,;通過群體遺傳研究,發(fā)現(xiàn)國內(nèi)的蓖麻品種分布具有區(qū)域性特點,,例如從中國南部到北部,,蓖麻表現(xiàn)出果穗從容易裂開到不容易裂開、穗高由高降低等顯著趨勢,。利用蓖麻的區(qū)域性特點,,找到了基因組區(qū)域上與蓖麻分布相關的受選擇區(qū)域,將這些受選擇區(qū)域與GWAS結(jié)果相結(jié)合后,,找到了受選擇性狀的在基因組上的具體受選擇位點,。在自然界野生狀態(tài)下,果穗在一定時期開裂,,種子跳出,,是有利于繁殖的性狀,大豆,,擬南芥都有關于這一性狀的深入研究,。但是這種性狀對較大規(guī)模種植,甚至是初步的人工種植的收獲過程,,都是不利的,。 研究中發(fā)現(xiàn)裂果相關基因在蓖麻南北地理分布中被選擇,這也暗示了北方蓖麻受到了更大的選擇壓力,。 

  

  文章鏈接:https://doi.org/10.1038/s41467-019-11228-3

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