2020年3月4日,，《Nucleic Acids Research》雜志在線發(fā)表了基因組所動(dòng)物功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)的研究成果,，這篇題為“Exonuclease combinations reduce noises in 3D genomics technologies”的學(xué)術(shù)論文,，提出了一種利用外切酶組合降低三維基因組學(xué)系列技術(shù)（C-技術(shù)）噪音的新策略,。

　　近年來,，染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)(C-技術(shù))在三維基因組學(xué)中得到了非常廣泛的應(yīng)用。3C,、4C,、5C和Hi-C等一系列C-技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生，但普遍都存在較高的數(shù)據(jù)噪音,。本研究篩選了一系列高效的外切酶組合,，可以有效地消除線性DNA及后續(xù)測序結(jié)果中的噪音來源。在標(biāo)準(zhǔn)Hi-C中驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),，可以將鄰近連接后體系中的有效互作模板比例(Valid interaction pairs ratio)從~40%提高到~80%,。該策略可以在不同的C-技術(shù)中加以應(yīng)用，預(yù)期均會(huì)有效降低技術(shù)噪音,。

　　▲利用外切酶組合降低三維基因組學(xué)系列技術(shù)噪音的策略

　　該成果由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所動(dòng)物功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院秦寶明團(tuán)隊(duì)合作完成,。基因組所為第一完成單位,，基因組所Yubo Zhang研究員為通訊作者,，基因組所博士研究生孔思遠(yuǎn)、科研人員李清和張高林為并列第一作者,。該研究得到了國家青年特聘項(xiàng)目,、國家自然科學(xué)基金、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃,、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和大鵬新區(qū)等項(xiàng)目的資助,。

　　文章鏈接：https://academic.oup.com/nar/advance-article-abstract/doi/10.1093/nar/gkaa106/5780087