5月24日，國際知名學(xué)術(shù)期刊《植物-方法（Plant Methods）》在線發(fā)表基因組所常玉曉課題組最新研究成果,，題為“All-in-one sequencing: an improved library preparation method for cost-effective and high-throughput next-generation sequencing”的論文報(bào)道了新的重測序文庫制備方法,。這種名為“AIO-seq”的新方法簡化了文庫制備的流程，極大地降低了文庫制備的成本,，為NGS在育種中應(yīng)用掃除了高成本障礙,。

　　全基因組基因型鑒定在育種中具有重要的作用。雖然目前基于二代測序的全基因組基因型鑒定在技術(shù)層面已經(jīng)非常成熟,，但是其高昂的價(jià)格限制了在育種中的廣泛應(yīng)用,。育種家普遍期望單個(gè)樣本的全基因組基因型鑒定的價(jià)格能夠降低至10美元左右。

　　圍繞這一技術(shù)難題,，常玉曉課題組優(yōu)化了常規(guī)的重測序文庫制備方法,，將傳統(tǒng)方法文庫擴(kuò)增后的文庫分選和定量這兩個(gè)步驟，從“每個(gè)樣品單獨(dú)操作”的繁瑣流程,，優(yōu)化為“多個(gè)樣品混合操作”的簡化流程,。通過簡化，可以實(shí)現(xiàn)一百多份樣品混在一起只進(jìn)行一次文庫的分選和定量,，大大降低了重測序文庫的建庫時(shí)間成本和試劑成本,。此外，該方法還結(jié)合質(zhì)量越來越好的國產(chǎn)建庫試劑,，進(jìn)一步降低了試劑成本,。最終應(yīng)用新方法AIO-seq，可以將全基因組基因型鑒定的成本降低到育種家期望的10美元,，為NGS在育種中的廣泛應(yīng)用掃除了障礙,。

　　All-in-One sequencing (AIO-seq) 方法的基本流程

　　文章審稿人高度評(píng)價(jià)該研究成果，表示AIO-seq方法可以加快科研項(xiàng)目進(jìn)度,，將成為重測序的標(biāo)準(zhǔn)方法,，在育種研究特別是植物育種中，有重要的應(yīng)用價(jià)值,。

　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所是文章第一單位,，基因組所博士生趙勝和廣西大學(xué)張翠翠副教授為并列第一作者,，基因組所常玉曉研究員和河南農(nóng)業(yè)大學(xué)丁俊強(qiáng)副教授為共同通訊作者。該研究得到中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi),、中國農(nóng)科院創(chuàng)新工程和深圳市科創(chuàng)委基金,，以及廣西自然科學(xué)基金的資助。

　　文章鏈接：https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-020-00615-3