近日，中國農業(yè)科學院農業(yè)基因組研究所李奎教授團隊聯(lián)合華中農業(yè)大學、西北農林科技大學、中國農業(yè)大學、江西農業(yè)大學、中國科學院昆明動物研究所等單位，成功研制出75K“天鵬香芯—產量品質協(xié)同改良版”液相基因芯片。該研發(fā)項目獲得了國家重點研發(fā)計劃項目“生豬高產優(yōu)質高效性狀形成的分子調控網(wǎng)絡”的資助。

天鵬香芯V2（75K液相基因芯片）在天鵬香芯V1（第一代豬基因組70K液相芯片）的基礎上，增添了項目研發(fā)驗證的豬產量和品質相關關鍵基因和功能突變位點，刪除了原芯片中存在捕獲特異性不足、分型準確性偏低、檢出率不達標及最小等位基因頻率過低等問題的位點，確保芯片設計科學、信息價值高，該芯片配置了新一代基因組選擇算法，適用于產量與品質性狀協(xié)同改良，瘦肉型種豬的肉質選育等。

目前，該芯片已在多家生豬育種企業(yè)推廣應用，成功實現(xiàn)產量與品質的協(xié)同提升。該芯片已在合作企業(yè)核心群體中開展持續(xù)選育，品質和產量性狀持續(xù)提升。該芯片作為核心成果之一榮獲神農中華農業(yè)科技獎科學研究類一等獎等重要獎項。

國家重點研發(fā)計劃項目“生豬高產優(yōu)質高效性狀形成的分子調控網(wǎng)絡”利用研發(fā)團隊數(shù)萬頭獨特試驗群體，以及大量表型和環(huán)境因子數(shù)據(jù)，從遺傳變異、環(huán)境適應性和分子網(wǎng)絡三個層面解析豬產肉量、肌內脂肪含量、飼料轉化效率、產仔數(shù)等復雜性狀形成的分子調控機制，明確多種遺傳因子互作、環(huán)境和基因互作在性狀形成中的調控作用。項目共設豬高產優(yōu)質高效性狀智能表型組解析及關鍵基因和變異篩選、豬高產優(yōu)質高效性狀形成的調控網(wǎng)絡及多基因互作機制、豬高產優(yōu)質高效性狀形成的環(huán)境和基因互作機制、產量和品質優(yōu)異基因聚合、創(chuàng)制及遺傳效應驗證等4個課題。項目成功構建了品質產量性狀形成的調控網(wǎng)絡，系統(tǒng)挖掘并鑒定了一批與豬高產優(yōu)質性狀密切相關的關鍵基因和功能突變位點。例如，在高產性狀方面，發(fā)現(xiàn)BMP2、H19等基因及其調控區(qū)的變異，明確其通過調控增強子活性影響眼肌面積和背膘厚等生長性狀。在品質性狀方面，鑒定出與多不飽和脂肪酸組成相關的大效應位點。鑒定出ZBED6等多個一因多效關鍵樞紐基因，能夠協(xié)同調控瘦肉率、剪切力及脂肪酸組成等多個性狀。一些基因和位點對部分品質和產量性狀的貢獻超過10%。這些新基因和新位點的發(fā)掘和應用，為豬復雜性狀的協(xié)同改良提供了重要分子基礎。

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