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基因組所李奎團隊成果入選2024年度畜禽遺傳學(xué)領(lǐng)域高影響力論文

2025-01-13 02:30:00來源:

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近日,中國遺傳學(xué)動物遺傳學(xué)專業(yè)委員會和中國高等教育文獻(xiàn)保障系統(tǒng)全國農(nóng)學(xué)文獻(xiàn)信息中心評選出2024年度畜禽遺傳學(xué)領(lǐng)域高影響力論文,,基因組所李奎教授團隊與國內(nèi)優(yōu)勢單位合作發(fā)表的《A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues》和《Mapping and functional characterization of structural variation in 1060 pig genomes》兩篇論文入選2024年度畜禽遺傳學(xué)領(lǐng)域高影響力論文,。


研究發(fā)布豬多組織遺傳調(diào)控效應(yīng)圖譜

《A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues》匯集了來自公共數(shù)據(jù)庫和聯(lián)盟成員的測序數(shù)據(jù),涵蓋了34個豬組織的5,457個RNA-seq數(shù)據(jù)和1,602個全基因組重測序數(shù)據(jù),。通過跨組織比較,分析了遺傳調(diào)控的組織特異性,并結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)揭示了其分子機制,。研究還定位了207個復(fù)雜表型的QTL,為豬的基因組選擇和基因編輯育種提供了關(guān)鍵依據(jù),。與人類的比較分析表明,,豬與人類在復(fù)雜表型的遺傳調(diào)控上具有相似性,證明了豬作為人類生物模型的重要性,。研究成果發(fā)表在《自然·遺傳學(xué)(Nature Genetics)》上,。基因組所李奎教授為論文共同通訊作者,,尹洪偉博士后為論文共同第一作者,,白立景副研究員和楊柳博士后(已出站)為論文共同作者。

論文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41588-023-01585-7

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研究發(fā)布最全面的豬基因組結(jié)構(gòu)變異圖譜

《Mapping and functional characterization of structural variation in 1060 pig genomes》收集了來自全球101個品種,、1,060頭豬的全基因組重測序數(shù)據(jù),,構(gòu)建了迄今為止最全面的豬基因組結(jié)構(gòu)變異圖譜。研究鑒定了42,487個缺失,、37,913個移動元素插入,、3,308個復(fù)制、1,664個倒置和45,184個斷裂端,,為豬的經(jīng)濟性狀解析奠定了基礎(chǔ),。研究成果發(fā)表在《基因組生物學(xué)(Genome Biology)》上?;蚪M所李奎教授為論文通訊作者,,楊柳博士后(已出站)、尹洪偉博士后和白立景副研究員為論文共同第一作者,。

論文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41588-023-01585-7

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李奎,,教授,博士生導(dǎo)師,。主要研究方向為動物的遺傳改良和種質(zhì)創(chuàng)新,。多年來一直研究豬基因組、豬基因工程,、實驗用小型豬及醫(yī)學(xué)模型等方面進(jìn)行理論和技術(shù)創(chuàng)新,。針對我國生豬產(chǎn)業(yè)中的關(guān)鍵核心問題開展原創(chuàng)性基礎(chǔ)研究和技術(shù)攻關(guān),開發(fā)了豬分子標(biāo)記和基因組輔助育種技術(shù)體系,,并開展產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用,,主持和參與培育了多個豬新品種和配套系,,以及農(nóng)用基因編輯豬育種新材料和醫(yī)學(xué)模型豬。

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