12月9日,，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所阮玨團(tuán)隊(duì)在國(guó)際期刊《自然·方法學(xué)》上發(fā)表第三代測(cè)序數(shù)據(jù)組裝算法wtdbg,，該算法極大地提高了三代基因測(cè)序數(shù)據(jù)的分析效率,。實(shí)驗(yàn)證實(shí),，與2019年4月1日發(fā)表在《自然·生物技術(shù)》上的Flye算法相比,，該算法分析速度提升了5倍,，并首次將測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)間降低到少于測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出時(shí)間,。

　　阮玨團(tuán)隊(duì)介紹,，基因組學(xué)技術(shù)飛速進(jìn)步既源于測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,，也依賴于數(shù)據(jù)分析技術(shù)的提高,。以三代測(cè)序?yàn)槔?，完成一個(gè)人的全基因組測(cè)序僅需1天時(shí)間、費(fèi)用低于5萬(wàn)元,。但是,，完成這樣數(shù)據(jù)規(guī)模的全基因組組裝分析在2014年需要消耗50萬(wàn)個(gè)CPU小時(shí)，只能在超大計(jì)算機(jī)集群上進(jìn)行,。這種情況下,，同時(shí)對(duì)大量個(gè)體進(jìn)行組裝分析是難以想象的。

　　近年來(lái),，生物信息學(xué)領(lǐng)域的科學(xué)家們致力于改變這種數(shù)據(jù)產(chǎn)出速度遠(yuǎn)高于數(shù)據(jù)分析速度的尷尬狀況,，不斷開(kāi)發(fā)出更高效的組裝分析算法。中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所在成立之初就布局成立組學(xué)技術(shù)研究中心,，致力于將前沿測(cè)序技術(shù)引入農(nóng)業(yè)科學(xué)研究中,，阮玨團(tuán)隊(duì)多年來(lái)始終專注于測(cè)序數(shù)據(jù)分析方法（如組裝算法）的開(kāi)發(fā)，力求推動(dòng)測(cè)序數(shù)據(jù)的分析速度更快,、分析質(zhì)量更高,。

　　本次發(fā)表的這項(xiàng)研究始于2013年，系阮玨研究員與美國(guó)哈弗醫(yī)學(xué)院的李恒博士合作完成,。研究成果自2016年起對(duì)所有人免費(fèi)開(kāi)放使用,，不僅被幾十篇學(xué)術(shù)論文引用，近年來(lái)更被國(guó)內(nèi)多家基因測(cè)序分析公司作為主要組裝分析工具投入應(yīng)用,，并在2019年世界大學(xué)生超算競(jìng)賽中做為性能測(cè)試賽題,。（光明日?qǐng)?bào)全媒體記者楊舒 通訊員謝欣、趙華）