圖為水稻超級(jí)泛基因組基因序列及變異。（圖片由受訪者提供）

將同一屬內(nèi)不同種遺傳變異的泛基因組整合在一起,，構(gòu)建的超級(jí)泛基因組可以更好地代表整個(gè)屬的遺傳變異,。

記者近日從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,，中國(guó)農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所組織攻關(guān),，與中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué),、南京農(nóng)業(yè)大學(xué),、中國(guó)水稻研究所,、中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所等單位合作,，組裝了251份高質(zhì)量的水稻基因組,，構(gòu)建了目前植物中群體規(guī)模最大的、基因組充分注釋的,、稻屬中最為系統(tǒng)的超級(jí)泛基因組,。

據(jù)了解，該圖譜的完成將極大促進(jìn)水稻功能基因挖掘和水稻種質(zhì)資源利用,。相關(guān)研究成果于近日在線發(fā)表在期刊《細(xì)胞研究》上,。

稻屬包括亞洲栽培稻和非洲栽培稻兩個(gè)栽培種，它們分別從普通野生稻和短舌野生稻馴化而來(lái),。該研究選擇了具有高度代表性的202份亞洲栽培稻核心種質(zhì)材料,，28份普通野生稻、11份非洲栽培稻和10份短舌野生稻。

該泛基因組圖譜可以幫助研究者充分挖掘與利用水稻功能基因遺傳變異,，為抗病基因功能和進(jìn)化研究提供了基礎(chǔ),，也給群體水平的復(fù)雜基因家族或者復(fù)雜的染色體區(qū)域研究提供了借鑒。

據(jù)悉,，研究人員利用構(gòu)建的泛基因組序列和對(duì)應(yīng)的群體表達(dá)數(shù)據(jù),，進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，快速確定了產(chǎn)量相關(guān)性狀的候選基因,，并通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了候選基因的功能,。該泛基因組圖譜為水稻比較基因組學(xué)和進(jìn)化基因組學(xué)研究提供了重要基礎(chǔ)。亞洲稻和非洲稻的比較基因組研究,，揭示了亞洲栽培稻和非洲栽培稻重要農(nóng)藝性狀馴化和環(huán)境適應(yīng)的遺傳基礎(chǔ),。（記者于文靜）

報(bào)道來(lái)源：超級(jí)泛基因組助力水稻種質(zhì)資源遺傳變異挖掘和利用