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【中國科技網(wǎng)】我國科研人員解碼康乃馨高質(zhì)量參考基因組

2022-03-27 03:09:00來源: http://www.stdaily.com/index/kejixinwen/202203/644dfa5b179b40afa9a061b5098a2089.shtml

【字體:

  

近日,,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所武志強團隊,,聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學(xué)傅小鵬團隊對康乃馨栽培品種“斯嘉麗”進行了全基因組測序和組裝,,并鑒定到調(diào)控康乃馨花色和花香的關(guān)鍵基因,,為解析康乃馨重要觀賞性狀的遺傳機理提供了理論基礎(chǔ),。相關(guān)研究成果發(fā)表在《植物生物技術(shù)雜志》。


康乃馨因花色絢麗,、花型獨特,、香氣馥郁,深受人們的喜愛,。研究團隊利用第三代納米孔技術(shù),、Illumina二代測序和三維基因組測序技術(shù),對康乃馨栽培品種“斯嘉麗”進行了全基因組測序和組裝,??的塑暗幕蛉L為636.30兆,重復(fù)序列占70.62%,,共注釋到43925個基因,。研究發(fā)現(xiàn)康乃馨與藜科大約在6400萬年前發(fā)生了分化,并經(jīng)歷了一次近期的全基因組三倍化事件,,這次加倍事件促進了與康乃馨特殊香氣丁香酚合成相關(guān)基因的擴張,。


基于基因組數(shù)據(jù),研究團隊對康乃馨紅邊花瓣進行代謝組分析發(fā)現(xiàn),,天竺葵素的積累促使花瓣邊呈紅色,,葉黃素和多個類黃酮物質(zhì)的共同積累促使花瓣基部呈黃色,基于轉(zhuǎn)錄組分析,,篩選到MYBs,、bHLHs和WRKY44等基因,這些基因共同作用于花色素合成酶(ANS),,調(diào)控康乃馨復(fù)色的形成,。同時研究團隊對丁香酚在不同時期花瓣的積累過程進行解析,發(fā)現(xiàn)其EGS基因在外顯子上的結(jié)構(gòu)變異,,可能是康乃馨丁香酚丟失的原因,。該研究為開展康乃馨重要觀賞性狀的調(diào)控和遺傳改良提供了寶貴的數(shù)據(jù)信息和堅實的理論基礎(chǔ),將有效推動了康乃馨分子育種的進程,。


康乃馨基因組.png


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