團(tuán)隊(duì)介紹 

　　中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡(jiǎn)稱“基因組所”）程時(shí)鋒團(tuán)隊(duì)主要從事植物比較進(jìn)化基因組學(xué)、作物群體遺傳學(xué),、及關(guān)鍵性狀遺傳解析等研究工作,。發(fā)起和主持全球“谷-豆”基因組國(guó)際聯(lián)盟協(xié)助組（http://www.g3rp.com/）,，并建立以“小麥”和“豌豆”為標(biāo)桿的禾本科及豆科模式研究對(duì)象。在圍繞“植物是如何獲得新性狀及其遺傳演化分子機(jī)制解析”這一科學(xué)問(wèn)題中,，從物種水平(Phylogenomics),、群體水平(Population Genetics)、以及關(guān)鍵表型性狀的泛組學(xué)等不同時(shí)空維度的策略中展開(kāi)研究工作,，建立起了植物trait-based的進(jìn)化基因組學(xué)研究方法,、作物群體gene-trait關(guān)聯(lián)和連鎖基因發(fā)現(xiàn)和解析體系。

　　主要課題包括：（1）“谷-豆”國(guó)際基因組聯(lián)盟計(jì)劃（http://www.g3rp.com/）下的禾本科作物和豆科豆類比較基因組和群體基因組,；（2）結(jié)瘤生物固氮分支N2-fixing Root Nodule Symbiosis祖先新性狀起源與多樣性演化的基因表達(dá)表觀調(diào)控機(jī)制,；（3）C4高光合大規(guī)模比較進(jìn)化基因組學(xué)，及其起源和平行演化的分子機(jī)制,。并陸續(xù)開(kāi)展基因組大數(shù)據(jù)指導(dǎo)下的,、圍繞地方適應(yīng)性、氮/碳藕聯(lián)和高效等方面的作物新品種選育,、培育等分子育種及應(yīng)用工作,。團(tuán)隊(duì)先后參與完成了多個(gè)重大項(xiàng)目，相關(guān)研究成果以第一或通訊作者(含共同)發(fā)表在Science（2篇）,、CELL,、Nature Biotechnology、Plant Cell等雜志10篇,，共發(fā)表SCI論文40余篇,，他引10000余次。多篇文章被F1000重點(diǎn)推薦,，多次主持國(guó)際學(xué)術(shù)研討會(huì)并作報(bào)告,。目前擁有團(tuán)隊(duì)成員15名，主要來(lái)自計(jì)算機(jī)科學(xué),、基因組學(xué),、生物信息學(xué)、植物分子生物學(xué),、進(jìn)化與群體遺傳學(xué)等多個(gè)學(xué)科,。

 

　　招聘需求 

　　1. 植物進(jìn)化基因組、多組學(xué)和群體遺傳信息大數(shù)據(jù)分析科研助理3名,；

　　2. 生物信息學(xué)算法開(kāi)發(fā)博士后1名；

　　3. 生物信息學(xué)算法開(kāi)發(fā)工程師1名,；

　　4．田間育種專員2名,。

　　

　　研究工作包括：

　　1．生信分析或算法/工具開(kāi)發(fā)

　　（1）基因組功能元件,、序列模型預(yù)測(cè)深度學(xué)習(xí)算法,、流程開(kāi)發(fā),；

　　（2）植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進(jìn)化基因組學(xué)方法構(gòu)建,；

　?。?）開(kāi)發(fā)群體遺傳學(xué)單倍型多樣性挖掘及基因發(fā)現(xiàn)新方法；

　?。?）開(kāi)發(fā)群體基因組大的結(jié)構(gòu)性變異(pan-sv),、泛基因(pan-genome)、以及基于變異矩陣的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）方法,；

　?。?）利用深度學(xué)習(xí)等算法整合基因大數(shù)據(jù)，開(kāi)發(fā)表征量化可視化方法,，開(kāi)發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù),，建設(shè)網(wǎng)站在線分析工具。

　　

　　2. 田間育種專員 （1）作物田間實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),、規(guī)劃和管理,；

　　（2）作物表型鑒定,、組織/核酸/材料提取等樣本文庫(kù)制備,。

　　

　　申請(qǐng)條件 

　　1. 科研助理

　　（1）985/211本科畢業(yè),，生物信息學(xué)或計(jì)算機(jī)專業(yè),；

　　熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl,、Python,、R、C/C++,、JAVA等語(yǔ)言中的兩種,；

　　有相關(guān)計(jì)算機(jī)、生物信息工作經(jīng)驗(yàn)或以第一作者發(fā)表文章者優(yōu)先,。

　　

　　2. 博士后

　?。?）博士學(xué)位，數(shù)學(xué),、計(jì)算機(jī)科學(xué),、數(shù)理統(tǒng)計(jì)、生物信息學(xué),、物理學(xué),、基因組學(xué)等相關(guān)專業(yè)；熟練使用Linux系統(tǒng),，至少熟練掌握Perl,、Python,、R、C/C++,、JAVA等語(yǔ)言中的兩種,；

　　（2）勤于思考,，能獨(dú)立開(kāi)展課題研究,，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團(tuán)隊(duì)合作,；

　?。?）良好的溝通能力和中英文科技寫作能力；

　?。?）不超過(guò)35周歲,，近3年在國(guó)際學(xué)術(shù)刊物以第一作者發(fā)表過(guò)或即將發(fā)表SCI論文。

　　

　　3. 田間育種專員

　?。?）碩士及以上學(xué)歷,，育種相關(guān)專業(yè)，具有作物（小麥優(yōu)先）育種相關(guān)的理論知識(shí),；

　?。?）1年以上從事作物育種的工作經(jīng)驗(yàn)，如作物品種的選育,；

　?。?）具有一定的計(jì)算機(jī)運(yùn)用能力，能獨(dú)立完成相關(guān)數(shù)據(jù)收集,、錄入和分析,；

　　（4）工作認(rèn)真,，有責(zé)任感,，執(zhí)行力強(qiáng)，工作效率高,；良好的溝通能力和團(tuán)隊(duì)協(xié)作能力,；

　　（5）英語(yǔ)寫作和口語(yǔ)優(yōu)秀者,，優(yōu)先考慮,。

 

　　申請(qǐng)方式 

　　申請(qǐng)者請(qǐng)將個(gè)人簡(jiǎn)歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷,、論文發(fā)表）,、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected]，郵件主題和材料壓縮文件請(qǐng)注明“姓名+申請(qǐng)職位名稱”,。我們會(huì)仔細(xì)分析并保密所有申請(qǐng)資料,，并在收到申請(qǐng)的一個(gè)月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系，安排面試,；資格審查未通過(guò)者,，不再另行告知。

　　

　　相關(guān)待遇 

　　1.博士后

　?。?）按照深圳市,、大鵬新區(qū)相關(guān)規(guī)定，博士后在站期間享受在站博士后生活補(bǔ)貼,，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn),，目前為稅后60萬(wàn)元（分兩年發(fā)放）。

　?。?）按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的工資,、五險(xiǎn)一金和績(jī)效待遇。

　?。?）博士后人員進(jìn)站后,，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶,，并且享受深圳市和大鵬新區(qū)的新引進(jìn)人才生活補(bǔ)貼,，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)，目前為稅后共計(jì)6萬(wàn)元（分兩年發(fā)放）,。

　?。?）博士后出站后留深工作且符合條件的，可被認(rèn)定為深圳市后備級(jí)高層次人才,，獲得人才獎(jiǎng)勵(lì),，認(rèn)定標(biāo)準(zhǔn)和獎(jiǎng)勵(lì)金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

　　

　　2.科研助理,、田間育種專員

　　薪資待遇面議,，相關(guān)社會(huì)保險(xiǎn)及公積金按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

 

　　程時(shí)鋒代表論文

　　1. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.

　　2. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S?. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.

　　3. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

　　4. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.

　　5. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

　　6. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into repro