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第三屆“大鵬灣”功能基因組學(xué)暑期夏令營火熱報名中!

2025-05-12 02:51:00來源:

【字體:

  



我們誠摯邀請您參加第三屆“大鵬灣”功能基因組學(xué)暑期夏令營,活動定于2025年6月23日至27日在深圳舉行。該項目致力于推動統(tǒng)計方法在人類疾病功能基因組學(xué)研究中的應(yīng)用,通過精密的統(tǒng)計框架建立遺傳變異與生物學(xué)功能的橋梁。

本強化課程歷時五天,將系統(tǒng)講解現(xiàn)代基因組學(xué)在復(fù)雜疾病分析全流程,從基礎(chǔ)統(tǒng)計遺傳學(xué)概念進階至前沿多組學(xué)技術(shù)。課程內(nèi)容涵蓋全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)、分子數(shù)量性狀基因座(QTL)定位與精細定位策略,延伸至單細胞分析、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)及GWAS-多組學(xué)數(shù)據(jù)整合。貝葉斯模型與機器學(xué)習(xí)方法將作為核心分析技術(shù)貫穿課程。學(xué)員將通過方法原創(chuàng)者的專題討論深化理論理解,并輔以實踐操作環(huán)節(jié)提升技術(shù)應(yīng)用能力。

課程主要面向從事醫(yī)學(xué)研究的初級科研人員、研究生、臨床工作者,以及動植物遺傳學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)和流行病學(xué)科研人員。學(xué)員需具備遺傳學(xué)與基因組學(xué)基本知識。基于往屆學(xué)員反饋,在提供完整代碼進行上機實操的基礎(chǔ)上,2025年課程特別增設(shè)為期一天的純統(tǒng)計學(xué)視角的基礎(chǔ)統(tǒng)計遺傳建模專題課程,旨在夯實方法論基礎(chǔ)以支持后續(xù)高階基因組學(xué)應(yīng)用。

本次邀請的授課老師均來自于國際著名高校,且在群體遺傳學(xué)和功能基因精細定位領(lǐng)域開發(fā)的軟件為業(yè)界的主流軟件,因此,本次授課也將為廣大相關(guān)科研工作者提供和他們建立聯(lián)系,以及近距離交流解惑相關(guān)科研問題的重要平臺。

中農(nóng)芯躍(深圳)生物科技有限公司

中國生物信息學(xué)學(xué)會青年工作委員會

2025年5月

 

  1. 一、課程概況

主辦單位:中農(nóng)芯躍(深圳)生物科技有限公司

協(xié)辦單位:中國生物信息學(xué)學(xué)會青年工作委員會

上課形式:線下(深圳、限定60名)

上課日期:2025年6月23日-6月27日

上課地點:廣東省深圳市大鵬新區(qū)鵬飛路7號D棟101

報名截止日期:2025年6月15日(滿員即止)

 

二、課程亮點

1、國際頂尖師資,零距離交流合作

授課專家來自哈佛大學(xué)、芝加哥大學(xué)、哥倫比亞大學(xué)、密歇根大學(xué)等全球頂尖學(xué)府,均為GWAS、貝葉斯模型、空間組學(xué)等領(lǐng)域的開拓者!課程中特設(shè)一對一答疑及研究問題探討環(huán)節(jié),學(xué)員可直接與專家對話,獲取個性化指導(dǎo),甚至孵化合作課題!

2、前沿技術(shù)全覆蓋,實戰(zhàn)賦能科研

從GWAS到單細胞/空間組學(xué),5天系統(tǒng)學(xué)習(xí)國際最前沿技術(shù):

(1)貝葉斯模型與機器學(xué)習(xí)核心應(yīng)用

(2)分子QTL定位、TWAS、孟德爾隨機化

(3)單細胞與空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)

課程提供完整代碼與云端計算環(huán)境,手把手助你打通理論與實操!

3、專屬學(xué)術(shù)社交圈,拓展科研人脈

與60位同領(lǐng)域青年學(xué)者共聚深圳,與頂尖專家面對面交流,搭建長期合作橋梁!

4、新增基礎(chǔ)強化課,夯實方法論根基

特設(shè)1天統(tǒng)計遺傳建模專題,從零梳理核心模型,助力后續(xù)高階研究!

5、在山海之間,探索基因奧秘

課程選址大鵬灣畔,親近金沙灣海浪,遠眺七娘山云霞。聚焦研討前沿技術(shù),閑暇漫步金色沙灘——在天然氧吧中激發(fā)科研靈感,讓海風(fēng)拂去思維壁壘、讓知識吸收更高效!



 三、學(xué)術(shù)協(xié)調(diào)

王告,博士,哥倫比亞大學(xué)神經(jīng)疾病科學(xué)助理教授

 

四、授課專家

賀信,博士,芝加哥大學(xué)人類遺傳學(xué)副教授

周翔,博士,密歇根大學(xué)生物統(tǒng)計學(xué)教授

葛天,博士,哈佛醫(yī)學(xué)院/麻省總醫(yī)院副教授,Broad研究所副研究員

王告,博士,哥倫比亞大學(xué)神經(jīng)疾病科學(xué)助理教授

董睿,博士,哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院講師

苑鍇,博士,哈佛醫(yī)學(xué)院/麻省總醫(yī)院講師

 

五、課程安排

2025年6月23日  星期一

時間

主講

主題

8:30-8:40

王告

課程概述

時間

主講

主題

8:40-12:00

董睿

頻率論統(tǒng)計學(xué)基礎(chǔ)

(1)統(tǒng)計遺傳學(xué)基本量:關(guān)鍵量的數(shù)學(xué)表述。包括基因型表示、次等位基因頻率(MAF)、哈迪-溫伯格平衡(HWE)、連鎖不平衡(LD)與LD評分、遺傳相關(guān)性/親緣關(guān)系的數(shù)學(xué)表達
(2)線性回歸基礎(chǔ):固定效應(yīng)與隨機效應(yīng)視角的線性回歸模型
(3)薈萃分析與統(tǒng)計量:關(guān)聯(lián)檢驗統(tǒng)計量、它們與LD結(jié)構(gòu)的關(guān)系、薈萃分析基礎(chǔ)模型
(4)邏輯回歸與混合模型:比值與比值比、簡單邏輯回歸模型及其與比值比的關(guān)系、線性混合模型原理
(5)回歸分析中的協(xié)變量:混雜因子、碰撞因子與中介因子的分類及其對回歸分析的影響

12:00-13:00  午餐

時間

主講

主題

13:00-16:50

董睿

貝葉斯統(tǒng)計學(xué)基礎(chǔ)

(1)似然比檢驗:遺傳模型假設(shè)檢驗中的應(yīng)用
(2)貝葉斯正態(tài)均值模型:貝葉斯建模基礎(chǔ)
(3)貝葉斯與頻率學(xué)派比較:遺傳學(xué)研究中的方法論比較
(4)貝葉斯多元正態(tài)模型:相關(guān)聯(lián)表型與遺傳效應(yīng)的多元建模
(5)貝葉斯模型比較:通過貝葉斯多元正態(tài)模型介紹混合模型與模型平均方法

時間

主講

主題

17:00 – 18:30

劉安京;董睿

實踐操作與計算環(huán)境配置(可選)

根據(jù)學(xué)員個人情況,本環(huán)節(jié)為可選參加內(nèi)容:
(1)在講師和助教指導(dǎo)下完成基礎(chǔ)統(tǒng)計學(xué)的上機課堂練習(xí);(2)配置后續(xù)課程的計算環(huán)境

 

2025年6月24日  星期二

時間

主講

主題

8:30-12:00

苑鍇

遺傳關(guān)聯(lián)研究基礎(chǔ)

(1)基因組學(xué)核心概念:二倍體人類基因組結(jié)構(gòu)、基因組織架構(gòu)、孟德爾與復(fù)雜性狀的遺傳變異機制,單體型與連鎖不平衡原理
(2)GWAS方法論概述:從早期混合遺傳理論到現(xiàn)代多基因模型的演進,高密度SNP分型技術(shù)、GWAS研究設(shè)計要點、單體型標(biāo)記、基因型填充、關(guān)聯(lián)分析方法及孟德爾隨機化框架

12:00-13:00  午餐

時間

主講

主題

13:00-16:30

苑鍇;王告

遺傳關(guān)聯(lián)精細定位

(1)精細定位策略:多基因區(qū)域連鎖不平衡的影響、頻率學(xué)派與貝葉斯可信集構(gòu)建方法、跨群體數(shù)據(jù)整合策略
(2)精細定位進階專題:基于匯總統(tǒng)計量的實踐要點、非GWAS場景下的拓展應(yīng)用、SuSiE與FINEMAP的局限性及替代方案

時間

主講

主題

16:40 – 17:20

劉安京

上機實踐指導(dǎo)

基因型數(shù)據(jù)質(zhì)控、親緣關(guān)系與群體結(jié)構(gòu)分析

17:20 – 17:50   講師晚餐

時間

主講

主題

17:30 – 19:00

劉安京;王告

實踐與答疑(可選)

可選內(nèi)容:(1)技術(shù)問題咨詢:劉安京;(2)研究問題探討:王告一對一交流

 

2025年6月25日  星期三

時間

主講

主題

8:30-12:00

葛天

遺傳力與復(fù)雜性狀預(yù)測

(1)遺傳力與遺傳相關(guān)性分析: 雙生子研究、家系研究、廣義和狹義遺傳力、SNP遺傳率、線性混合模型和遺傳力估計(GCTA)、LD評分回歸、病例對照研究的易患性閾值模型、遺傳相關(guān)性的量化方法
(2)多基因風(fēng)險評分: GWAS匯總統(tǒng)計量質(zhì)量控制、經(jīng)驗閾值法、貝葉斯方法、跨種族預(yù)測與臨床轉(zhuǎn)化

12:00-13:00  午餐

時間

主講

主題

13:00-16:30

葛天;苑鍇

現(xiàn)代GWAS應(yīng)用

(1)生物樣本庫進行基因組研究:生物庫的概念和各種類型、主要資源概述、表型組關(guān)聯(lián)分析(PheWAS)、電子健康檔案、生物標(biāo)記物與影像學(xué)數(shù)據(jù)整合
(2)案例研究:大型GWAS項目實例

時間

主講

主題

16:40 – 17:20

劉安京

上機實踐指導(dǎo)

分子QTL入門

17:20 – 17:50   講師晚餐

時間

主講

主題

17:30 – 19:00

劉安京;王告

實踐與答疑(可選)

可選內(nèi)容:(1)技術(shù)問題咨詢:劉安京;(2)研究問題探討:王告一對一交流

 

2025年6月26日  星期四

時間

主講

主題

8:30-12:00

賀信

分子QTL定位與GWAS整合

(1)分子QTL定位:分子性狀及定位的原理、RNA-seq數(shù)據(jù)表達量化、數(shù)據(jù)標(biāo)準化、顯性與隱性協(xié)變量校正、多重檢驗校正
(2)GWAS整合分析:轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)和GWAS整合分析概述、轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究(TWAS)、共定位分析、孟德爾隨機化與因果TWAS

12:00-13:00  午餐

時間

主講

主題

13:00-16:30

賀信;王告

利用功能基因組學(xué)進行GWAS后分析

(1)功能注釋:編碼影響和非編碼調(diào)控效應(yīng)的策略、深度學(xué)習(xí)注釋工具、功能類別遺傳率富集分析
(2)多基因分析:基因和通路水平整合和解釋GWAS發(fā)現(xiàn)的方法、基因水平關(guān)聯(lián)檢驗(VEGAS/MAGMA)
(3)其他分子QTL分析:多組織、多組學(xué)QTL(xQTL)數(shù)據(jù)概述、xQTL及GWASxQTL整合策略

時間

主講

主題

16:40 – 17:20

劉安京

上機實踐指導(dǎo)

分子QTL精細定位、TWAS與MR

17:20 – 17:50   講師晚餐

時間

主講

主題

17:50 – 19:00

劉安京;王告

實踐與答疑(可選)

可選內(nèi)容:(1)技術(shù)問題咨詢:劉安京;(2)研究問題探討:王告一對一交流

 

2025年6月27日  星期五

時間

主講

主題

8:30-12:00

周翔

貝葉斯模型與機器學(xué)習(xí)前沿

(1)貝葉斯方法:GIFT/FABIO因果基因識別、IMAGE甲基化QTL整合、跨祖先精細定位
(2)機器學(xué)習(xí):DBSLMM/mtPGS多基因評分、跨種群多基因評分、貝葉斯非參數(shù)預(yù)測、CoCoNet共表達網(wǎng)絡(luò)整合

12:00-13:00  午餐

時間

主講

主題

13:00-16:30

周翔

單細胞與空間組學(xué)分析

(1)單細胞分析: VIPER數(shù)據(jù)補全、VIPCCA多組學(xué)整合、FastCCC細胞通訊推斷
(2)空間組學(xué): SPARK空間變異基因檢測、CARD空間解卷積、SpatialPCA空間域識別

時間

主講

主題

16:40 – 17:20

王告

上機實踐指導(dǎo)

QTL與GWAS整合方法實踐

17:30 結(jié)課總結(jié)與反饋收集

 

六、培訓(xùn)費用及優(yōu)惠政策

培訓(xùn)費:4000元/人(此費用包含培訓(xùn)費及資料費,食宿需自理)

* 組團報名有優(yōu)惠:2人報名享9折,4人及以上報名享8折。

 

七、繳費方式

您可以采用“對公轉(zhuǎn)賬”或“支付寶”的方式繳納報名費,備注“單位,姓名,人數(shù)”(示例:某某大學(xué)張三李四2人),并將轉(zhuǎn)賬憑證上傳至問卷,后臺會有專人在3個工作日內(nèi)審核,審核通過后會郵件告知并提供開票指引。

(1)銀行轉(zhuǎn)賬收款賬戶信息:

賬戶名稱:中農(nóng)芯躍(深圳)生物科技有限公司

銀行賬戶:7640 7635 1724

開戶銀行:中國銀行深圳大鵬支行

(2)支付寶收款賬戶信息:[email protected]

 

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掃碼填寫報名問卷,開啟你的學(xué)術(shù)進階之旅!



八、注意事項

(1)課程實操:請參會學(xué)員自己攜帶筆記本電腦,實操部分將使用課程提供的計算環(huán)境配置,可以兼容個人MacOS,Windows及Linux操作系統(tǒng)。我們鼓勵學(xué)員們在個人電腦上配置及完成所有練習(xí),以便課后回顧及后續(xù)個人課題研究。

(2)有興趣在個人電腦上配置課程數(shù)據(jù)分析環(huán)境的學(xué)員,請在參加計劃之前訪問https://wanggroup.org/compbio_tutorial/course_setup,按照說明設(shè)置筆記本電腦。課程同時提供備用云端計算環(huán)境。

(3)所有課程以中文講授,教材資料均為英文版本。

(4)上課座位將按報名順序從前到后依次安排。

 

九、聯(lián)系方式

聯(lián)系人:蘇女士

聯(lián)系郵箱:[email protected]

聯(lián)系電話:18598019167(微信同號)

 

十、酒店住宿

深圳奧登國際酒店(大鵬金沙灣店)

距離培訓(xùn)地點:2.6公里

預(yù)定方式:預(yù)定請直接聯(lián)系歐陽經(jīng)理13434415878,報課程名字可享下方專屬協(xié)議價!


房型價格表

房型

價格(間/夜)

豪華大床房(含早)

350

豪華雙床房(含早)

350



 

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