近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所李奎教授團隊聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、西北農(nóng)林科技大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、江西農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國科學(xué)院昆明動物研究所等單位，成功研制出75K“天鵬香芯—產(chǎn)量品質(zhì)協(xié)同改良版”液相基因芯片。該研發(fā)項目獲得了國家重點研發(fā)計劃項目“生豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高效性狀形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)”的資助。

天鵬香芯V2（75K液相基因芯片）在天鵬香芯V1（第一代豬基因組70K液相芯片）的基礎(chǔ)上，增添了項目研發(fā)驗證的豬產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵基因和功能突變位點，刪除了原芯片中存在捕獲特異性不足、分型準(zhǔn)確性偏低、檢出率不達標(biāo)及最小等位基因頻率過低等問題的位點，確保芯片設(shè)計科學(xué)、信息價值高，該芯片配置了新一代基因組選擇算法，適用于產(chǎn)量與品質(zhì)性狀協(xié)同改良，瘦肉型種豬的肉質(zhì)選育等。

目前，該芯片已在多家生豬育種企業(yè)推廣應(yīng)用，成功實現(xiàn)產(chǎn)量與品質(zhì)的協(xié)同提升。該芯片已在合作企業(yè)核心群體中開展持續(xù)選育，品質(zhì)和產(chǎn)量性狀持續(xù)提升。該芯片作為核心成果之一榮獲神農(nóng)中華農(nóng)業(yè)科技獎科學(xué)研究類一等獎等重要獎項。

國家重點研發(fā)計劃項目“生豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高效性狀形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)”利用研發(fā)團隊數(shù)萬頭獨特試驗群體，以及大量表型和環(huán)境因子數(shù)據(jù)，從遺傳變異、環(huán)境適應(yīng)性和分子網(wǎng)絡(luò)三個層面解析豬產(chǎn)肉量、肌內(nèi)脂肪含量、飼料轉(zhuǎn)化效率、產(chǎn)仔數(shù)等復(fù)雜性狀形成的分子調(diào)控機制，明確多種遺傳因子互作、環(huán)境和基因互作在性狀形成中的調(diào)控作用。項目共設(shè)豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高效性狀智能表型組解析及關(guān)鍵基因和變異篩選、豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高效性狀形成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及多基因互作機制、豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高效性狀形成的環(huán)境和基因互作機制、產(chǎn)量和品質(zhì)優(yōu)異基因聚合、創(chuàng)制及遺傳效應(yīng)驗證等4個課題。項目成功構(gòu)建了品質(zhì)產(chǎn)量性狀形成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，系統(tǒng)挖掘并鑒定了一批與豬高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)性狀密切相關(guān)的關(guān)鍵基因和功能突變位點。例如，在高產(chǎn)性狀方面，發(fā)現(xiàn)BMP2、H19等基因及其調(diào)控區(qū)的變異，明確其通過調(diào)控增強子活性影響眼肌面積和背膘厚等生長性狀。在品質(zhì)性狀方面，鑒定出與多不飽和脂肪酸組成相關(guān)的大效應(yīng)位點。鑒定出ZBED6等多個一因多效關(guān)鍵樞紐基因，能夠協(xié)同調(diào)控瘦肉率、剪切力及脂肪酸組成等多個性狀。一些基因和位點對部分品質(zhì)和產(chǎn)量性狀的貢獻超過10%。這些新基因和新位點的發(fā)掘和應(yīng)用，為豬復(fù)雜性狀的協(xié)同改良提供了重要分子基礎(chǔ)。

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