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學(xué)術(shù)活動| 美國冷泉港實驗室焦銀平博士來我所做學(xué)術(shù)報告

2018-04-16 08:47:00來源: 商連光

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 4月3日,,應(yīng)中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所所長黃三文的邀請,,美國冷泉港實驗室(Cold Spring Harbor Laboratory)焦銀平博士來所進行學(xué)術(shù)交流,,并做了題為“Decoding crop genomes for climate-smartagriculture”的報告,。

 焦銀平博士主要從事玉米和高粱基因組以及功能基因挖掘的研究,在此次學(xué)術(shù)報告中,焦博士向我們介紹了利用新一代PacBio長讀長測序技術(shù),,重新構(gòu)建了更詳細精確的B73玉米基因組圖譜,。相對于以前的玉米基因組參考序列,,本次得到的Contig長度增加了52倍,,并且基因間和端粒區(qū)的組裝效果明顯得到了改善。焦博士對新一代玉米參考基因組的基因重復(fù)區(qū)的深入分析發(fā)現(xiàn)了130,000多個轉(zhuǎn)座子元件,,其中111,000個全長轉(zhuǎn)錄本的SMRT測序進一步更新了玉米基因組的注釋信息,。另外,焦博士還建立了高粱EMS突變體庫,,已經(jīng)篩選到直立葉,、褐色中脈、持綠性,、大穗等許多有用的突變體,。并對256個高粱EMS突變體全基因組測序,結(jié)合大數(shù)據(jù)和表達譜等信息整合,,找到控制大穗性狀關(guān)鍵基因Msd1,。報告會后,我所相關(guān)領(lǐng)域科研人員與焦博士就復(fù)雜基因組組裝的問題進行了深入交流討論,,并就后續(xù)合作提出了意向,。

 焦銀平博士畢業(yè)于中國農(nóng)業(yè)大學(xué),之后在冷泉港實驗室開始博士后研究,,以第一作者身份在《自然》(Nature)《自然·遺傳》(Nature Genetics)《植物細胞》(The Plant Cell)《自然·通訊》(Nature Communications)等雜志上發(fā)表多篇高水平論文,。

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