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在我國測序市場發(fā)展十分迅速,，以華大基因，貝瑞和康,、諾和致源,、天津芯片等一批公司為代表的公司承接了國內(nèi)大部分科研測序任務(wù)。但是這些公司只能提供基本的,、標準化的測序服務(wù),，并不能滿足科學家們對于不同物種，不同實驗要求的個性化需求,。因此,，全國的科研機構(gòu)紛紛購進了測序儀，從事相關(guān)的測序工作任務(wù)，從而導致當前測序平臺技術(shù)覆蓋度比較低,，相關(guān)的測序人才缺乏,。為了改變這種局面，中國農(nóng)業(yè)科學院2014年決定在深圳成立農(nóng)業(yè)基因組研究所并創(chuàng)建了自己的測序平臺如圖1,。

圖1 測序平臺現(xiàn)有測序儀器

測序平臺以服務(wù)農(nóng)業(yè)基因組學技術(shù)創(chuàng)新體系為核心,，輻射作物、畜牧,、資源與環(huán)境3大學科集群的科研需求,，是“農(nóng)業(yè)生物組學基本算法、農(nóng)業(yè)生物大數(shù)據(jù)的云計算研究,、農(nóng)業(yè)動物全基因組設(shè)計育種方法與技術(shù),、動物功能基因組學、動物健康的基因組研究與監(jiān)控,、農(nóng)業(yè)生物安全宏基因組學”等多個前沿研究方向的基礎(chǔ),。

建設(shè)良好的測序平臺是惠及多方向多學科多領(lǐng)域的重要共享舉措。研究所測序平臺現(xiàn)有Illumina的Miseq,、Hiseq2500,、Hiseq3000和HYK-PSTAR測序儀，如圖2,、3,、4,、5,。測序量每周可以達到2.5T的數(shù)據(jù)，相當于830個人類基因組數(shù)據(jù),，基本滿足農(nóng)業(yè)基因組大規(guī)模測序的通量要求,。測序?qū)ο笾饕▌游铩⒅参锖臀⑸?。Illumina公司的新一代測序儀Hiseq 2000和Hiseq 2500具有高準確性,，高通量，高靈敏度,，和低運行成本等突出優(yōu)勢,，可以同時完成傳統(tǒng)基因組學研究(測序和注釋)以及功能基因組學(基因表達及調(diào)控，基因功能,，蛋白/核酸相互作用)研究,。

圖2 MiSeq

圖3 HiSeq 2500

圖3 HiSeq 3000

圖4 cBot

圖5 HYK-PSTAR

 

條件建設(shè)處更新于2020年4月