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科技創(chuàng)新

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研究平臺

  

在我國測序市場發(fā)展十分迅速,以華大基因,貝瑞和康、諾和致源、天津芯片等一批公司為代表的公司承接了國內(nèi)大部分科研測序任務。但是這些公司只能提供基本的、標準化的測序服務,并不能滿足科學家們對于不同物種,不同實驗要求的個性化需求。因此,全國的科研機構(gòu)紛紛購進了測序儀,從事相關的測序工作任務,從而導致當前測序平臺技術(shù)覆蓋度比較低,相關的測序人才缺乏。為了改變這種局面,中國農(nóng)業(yè)科學院2014年決定在深圳成立農(nóng)業(yè)基因組研究所并創(chuàng)建了自己的測序平臺如圖1。


圖1 測序平臺現(xiàn)有測序儀器


測序平臺以服務農(nóng)業(yè)基因組學技術(shù)創(chuàng)新體系為核心,輻射作物、畜牧、資源與環(huán)境3大學科集群的科研需求,是“農(nóng)業(yè)生物組學基本算法、農(nóng)業(yè)生物大數(shù)據(jù)的云計算研究、農(nóng)業(yè)動物全基因組設計育種方法與技術(shù)、動物功能基因組學、動物健康的基因組研究與監(jiān)控、農(nóng)業(yè)生物安全宏基因組學”等多個前沿研究方向的基礎。


建設良好的測序平臺是惠及多方向多學科多領域的重要共享舉措。研究所測序平臺現(xiàn)有Illumina的Miseq、Hiseq2500、Hiseq3000和HYK-PSTAR測序儀,如圖2、3、4、5。測序量每周可以達到2.5T的數(shù)據(jù),相當于830個人類基因組數(shù)據(jù),基本滿足農(nóng)業(yè)基因組大規(guī)模測序的通量要求。測序?qū)ο笾饕▌游铩⒅参锖臀⑸铩llumina公司的新一代測序儀Hiseq 2000和Hiseq 2500具有高準確性,高通量,高靈敏度,和低運行成本等突出優(yōu)勢,可以同時完成傳統(tǒng)基因組學研究(測序和注釋)以及功能基因組學(基因表達及調(diào)控,基因功能,蛋白/核酸相互作用)研究。


圖2 MiSeq

圖3 HiSeq 2500

圖3 HiSeq 3000

圖4 cBot

圖5 HYK-PSTAR

 

條件建設處更新于2020年4月

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