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科技創(chuàng)新

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研究平臺

  

基因所計算平臺,以實現(xiàn)大規(guī)模農(nóng)業(yè)生物信息學(xué)計算為中心任務(wù),推動形成農(nóng)業(yè)海量生物組學(xué)大數(shù)據(jù)儲存、整合與挖掘研究體系,為實現(xiàn)農(nóng)業(yè)生物大數(shù)據(jù)的深度挖掘奠定基礎(chǔ),以超算和大數(shù)據(jù)兩個中心推動學(xué)科建設(shè),目前平臺計算能力500TFLops,存儲能力16PB,以CPU計算為主,部署有Intel、國產(chǎn)arm架構(gòu),核心總數(shù)超過15000余顆。平臺正在籌建新一期超算集群,到2024年,平臺CPU計算能力將達到1500TFlops,存儲能力40PB。



建設(shè)歷程:


建設(shè)時間

CPU算力

GPU算力

存儲能力

資金來源

2014年5月

35T


1P

自籌經(jīng)費

2016年7月

15T


1.5P

深圳市農(nóng)業(yè)表型和利用重點實驗室

2019年4月

10T


3P

自籌經(jīng)費

2020年4月

90T


0.5P

自籌經(jīng)費

2021年9月

350T

150T

10P

深圳市基礎(chǔ)研究機構(gòu)


功能特點:

(1) 平臺計算資源呈梯子配置, 6T、3T、2T等大內(nèi)存節(jié)點分區(qū)可滿足復(fù)雜基因組組裝需求;普通節(jié)點分區(qū)可滿足基因數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)分析等諸多應(yīng)用。

(2) 平臺同步提供AI算力,提供了最主流的TensorFlow、Caffe、Pytorch等AI人工深度學(xué)習(xí)算法框架,可以應(yīng)對眾多復(fù)雜的人工智能挑戰(zhàn)。

(3) 平臺擁有國產(chǎn)CPU芯片(華為鯤鵬ARM架構(gòu))服務(wù)器40余臺,已實現(xiàn)遷移部署常用生物信息軟件50余款。

(4) 平臺擁有Sentieon和人和未來gtx基因數(shù)據(jù)分析軟件資源,針對BWA+GATK等分析流程加速效果顯著。

(5) 平臺擁有高性價比AMD、國產(chǎn)海光等CPU架構(gòu)的外部計算資源作為補充,可滿足上萬核的并發(fā)任務(wù)。


開放共享:

計算平臺實行開放式共享原則,實行獨立核算,建立成本核算和服務(wù)收費管理機制,為院所內(nèi)外各單位生物學(xué)研究提供集群建設(shè)和支持、數(shù)據(jù)分析、生物信息數(shù)據(jù)庫開發(fā)、高性能計算、計算加速和海量存儲服務(wù)。

聯(lián)系方式: [email protected]


計算平臺更新于2023年7月



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