科技創(chuàng)新
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基因所計算平臺,，以實現(xiàn)大規(guī)模農(nóng)業(yè)生物信息學計算為中心任務(wù),，推動形成農(nóng)業(yè)海量生物組學大數(shù)據(jù)儲存、整合與挖掘研究體系,，為實現(xiàn)農(nóng)業(yè)生物大數(shù)據(jù)的深度挖掘奠定基礎(chǔ),，以超算和大數(shù)據(jù)兩個中心推動學科建設(shè),，目前平臺計算能力500TFLops,，存儲能力16PB,，以CPU計算為主，部署有Intel,、國產(chǎn)arm架構(gòu),，核心總數(shù)超過15000余顆。平臺正在籌建新一期超算集群,，到2024年,，平臺CPU計算能力將達到1500TFlops,，存儲能力40PB,。
建設(shè)歷程：
建設(shè)時間 |
CPU算力 |
GPU算力 |
存儲能力 |
資金來源 |
2014年5月 |
35T |
1P |
自籌經(jīng)費 |
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2016年7月 |
15T |
1.5P |
深圳市農(nóng)業(yè)表型和利用重點實驗室 |
|
2019年4月 |
10T |
3P |
自籌經(jīng)費 |
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2020年4月 |
90T |
0.5P |
自籌經(jīng)費 |
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2021年9月 |
350T |
150T |
10P |
深圳市基礎(chǔ)研究機構(gòu) |
功能特點：
（1） 平臺計算資源呈梯子配置， 6T,、3T,、2T等大內(nèi)存節(jié)點分區(qū)可滿足復雜基因組組裝需求；普通節(jié)點分區(qū)可滿足基因數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)分析等諸多應用,。
（2） 平臺同步提供AI算力,，提供了最主流的TensorFlow、Caffe,、Pytorch等AI人工深度學習算法框架,，可以應對眾多復雜的人工智能挑戰(zhàn)。
（3） 平臺擁有國產(chǎn)CPU芯片（華為鯤鵬ARM架構(gòu)）服務(wù)器40余臺,，已實現(xiàn)遷移部署常用生物信息軟件50余款,。
（4） 平臺擁有Sentieon和人和未來gtx基因數(shù)據(jù)分析軟件資源，針對BWA+GATK等分析流程加速效果顯著,。
（5） 平臺擁有高性價比AMD,、國產(chǎn)海光等CPU架構(gòu)的外部計算資源作為補充，可滿足上萬核的并發(fā)任務(wù),。
開放共享：
計算平臺實行開放式共享原則,，實行獨立核算,，建立成本核算和服務(wù)收費管理機制，為院所內(nèi)外各單位生物學研究提供集群建設(shè)和支持,、數(shù)據(jù)分析,、生物信息數(shù)據(jù)庫開發(fā)、高性能計算,、計算加速和海量存儲服務(wù),。
聯(lián)系方式： liyongyao@caas.cn
計算平臺更新于2023年7月
