程旭課題組

Cheng Xu’s Lab

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課題組長(zhǎng)

程旭，研究員，博士生導(dǎo)師，深圳市“海外高層次人才”，中國(guó)微生物學(xué)會(huì)會(huì)員，國(guó)家微生物種業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟成員。

2001年就讀于中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)，2003年底開始在荷蘭瓦赫寧根大學(xué)先后獲得了學(xué)士、碩士和博士學(xué)位。2014年-2020年在瓦赫寧根大學(xué)從事博士后研究，并組建根際微生物組研究團(tuán)隊(duì)。研究領(lǐng)域包括土壤和根系微生物組學(xué)、根系有益微生物保護(hù)植物健康、促進(jìn)植物生長(zhǎng)的作用機(jī)理，構(gòu)建復(fù)合微生物菌群并使其提高植物耐鹽能力和菌根真菌菌絲際微生物對(duì)植物生長(zhǎng)的影響等。目前，在The ISME Journal，Environmental Microbiology，New Phytologist和Nature Plant等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文20余篇，獲得授權(quán)國(guó)家專利5項(xiàng)。2021年12月，加入合成生物學(xué)研究中心經(jīng)濟(jì)作物的全基因組設(shè)計(jì)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，從事土壤和根系微生物組的研究，挖掘微生物組對(duì)馬鈴薯健康保護(hù)、生長(zhǎng)促進(jìn)的作用機(jī)理和應(yīng)用技術(shù)，結(jié)合微生物組結(jié)構(gòu)和功能研究，開發(fā)植物育種的新思路和新方法。

工作經(jīng)歷

2022/04 至今               中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所            研究員（PI）

2021/12 – 2022/03      中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所            Pre-PI

2020/06 – 2021/08      荷蘭瓦赫寧根大學(xué)                                          Guest Scientist

2014/06 – 2020/05      荷蘭瓦赫寧根大學(xué)                                          博士后

2013/10 – 2014/02      美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校                             訪問學(xué)者

2009/01 – 2009/07      美國(guó)康奈爾大學(xué)                                              研究助理

教育經(jīng)歷

2010/03 – 2016/09     荷蘭瓦赫寧根大學(xué) 博士研究生

2003/12 – 2009/08     荷蘭瓦赫寧根大學(xué) 學(xué)士和碩士研究生

2001/09 – 2003/08     中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 本科

研究方向

（一）作物栽培學(xué)。本課題組目前以馬鈴薯為主要材料，專注于促進(jìn)雜交二倍體馬鈴薯種子萌發(fā)和育苗壯苗技術(shù)的研發(fā)和創(chuàng)新；通過土壤改良、水-肥-藥一體化的栽培和管理技術(shù)研發(fā)和創(chuàng)新，從而提高雜交馬鈴薯產(chǎn)量和品質(zhì)。

（二）土壤和植物微生物組學(xué)。土壤和植物根系存在著成千上萬種微生物，具有豐富的多樣性，并與植物的生長(zhǎng)和健康息息相關(guān)。本課題組將通過宏擴(kuò)增子、宏基因組結(jié)合代謝組等多組學(xué)技術(shù)深入研究馬鈴薯根系微生物組組成結(jié)構(gòu)、豐度和功能；通過分析核心和基石類菌群等，構(gòu)建復(fù)合微生物群落，揭示其對(duì)馬鈴薯促生和提高逆境脅迫能力的作用機(jī)理。

研究進(jìn)展

成功完成雜交二倍體馬鈴薯的規(guī)模性田間試種；初步構(gòu)建了雜交馬鈴薯配套栽培技術(shù)體系；發(fā)掘微生物資源和技術(shù)對(duì)雜交馬鈴薯的有益功能，建立了種子、幼苗與有益微生物互作的研究體系，并獲得顯著性促進(jìn)種子萌發(fā)和幼苗根系生長(zhǎng)的菌株。

代表論文

1. Schmitz L, Yan Z., Schneijderberg M., de Roij M., Pijnenburg P., Zheng Q., Franken C., Dechesne A., Trindade L., van Velzen R., Bisseling T., Geurts R.?, and Cheng X.? (2022). Synthetic bacterial community derived from a desert rhizosphere confers salt stress resilience to tomato in the presence of a soil microbiome. The ISME J. 8:1907-1920. (*Co-corresponding authors).

2. Schneijderberg M, Cheng X.*, Franken C., de Hollander M., van Velzen B., Schmitz L., Geurts R, van der Putten W.H., Bezemer T.M. and Bisseling T.* (2020). Quantitative comparison between the rhizosphere effect of Arabidopsis thaliana and co-occurring plant species with a longer life history. ISME J. 14: 2433–2448. (*Co-corresponding authors).

3. Cheng X., Etalo DW, van de Mortel JE, et al. (2017). Genome-wide analysis of bacterial determinants of plant growth promotion and induced systemic resistance by Pseudomonas fluorescens. Environ Microbiol., 19(11):4638-4656.

4. Cheng X., Cordovez V, Etalo DW, van der Voort M, Raaijmakers JM. (2016). Role of the GacS Sensor Kinase in the Regulation of Volatile Production by Plant Growth-Promoting Pseudomonas fluorescens SBW25. Front Plant Sci., 7:1706.

5. Cheng, X., van der Voort, M. & Raaijmakers, J. M. (2015). Gac-mediated changes in pyrroloquinoline quinone biosynthesis enhance the antimicrobial activity of Pseudomonas fluorescens?SBW25. Environ Microbiol Rep., 7, 139–147.

6. Cheng X.Irene de Bruijn, Menno van der Voort, Joyce E. Loper and Jos M. Raaijmakers (2013). The Gac Regulon of Pseudomonas fluorescens SBW25. Environ Microbiol Rep., 4,608-19.

5. Zhong Y, Xun W, Wang X, Tian S, Zhang Y, Li D, Zhou Y, Qin Y, Zhang B, Zhao G, Cheng X, Liu Y, Chen H, Li L, Osbourn A, Lucas WJ, Huang S, Ma Y, Shang Y. Root-secreted bitter triterpene modulates the rhizosphere microbiota to improve plant fitness. Nat Plants. 2022 Aug;8(8):887-896. doi: 10.1038/s41477-022-01201-2. Epub 2022 Aug 1. PMID: 35915145.

6. Li Q, Li H, Yang Z, Cheng X, Zhao Y, Qin L, Bisseling T, Cao Q, Willemsen V. Plant growth-promoting rhizobacterium Pseudomonas sp. CM11 specifically induces lateral roots. New Phytol. 2022 Aug;235(4):1575-1588. doi: 10.1111/nph.18199. Epub 2022 May 27. PMID: 35510807; PMCID: PMC9546010.

代表專利

1. 程旭,秦嶺, 曹慶芹, 安東尼·比斯利, 一種桔黃假單胞菌CM-6及其應(yīng)用, 2021-05-25, 中國(guó), ZL202 010988747.8.

2. 程旭, 曹慶芹, 秦嶺, 安東尼·比斯利, 一種桔黃假單胞菌CM-7及其應(yīng)用, 2021-08-10, 中國(guó), ZL202 010988734.0.

3. 秦嶺,程旭,曹慶芹, 安東尼·比斯利, 一種桔黃假單胞菌CM-8及其應(yīng)用, 2021-04-23, 中國(guó), ZL202 010990368.2.

4. 曹慶芹, 程旭, 秦嶺, 安東尼·比斯利, 一種桔黃假單胞菌CM-9及其應(yīng)用, 2021-04-23, 中國(guó), ZL202 010990366.3.

5. 李茜, 程旭, 曹慶芹, 秦嶺, 安東尼·比斯利, 趙亞層, 一種假單胞菌CM-11及其應(yīng)用, 2021-11-23, 中國(guó), ZL202011555790.1.  

程旭課題組更新于2023年3月