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研究中心

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趙程課題組

趙程課題組

Cheng Zhao Lab

  課題組長

  趙程,,研究員,博士生導(dǎo)師,。2018年于美國德克薩斯農(nóng)工大學(xué)獲得博士學(xué)位,,2018-2021年于斯坦??▋?nèi)基科學(xué)研究所從事博士后研究,,2021年9月加入中國農(nóng)科院基因組所合成生物學(xué)研究中心,,致力于人工智能與代謝網(wǎng)絡(luò)建模研究,。以第一作者或通訊作者在Nature Communication,、Green Chemistry,、ACS Synthetic Biology等多個國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表高質(zhì)量論文數(shù)篇,并授權(quán)多項發(fā)明專利和軟件著作權(quán),。

 

  工作經(jīng)歷

  2021.9 - 至今       中國農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所      研究員

  2018.7 - 2021.7   美國卡內(nèi)基科學(xué)研究所                       博士后

 

  教育經(jīng)歷

  2013.8 - 2018.8      美國德克薩斯農(nóng)工大學(xué)    博士

  2009.9 - 2013.6      武漢大學(xué)                        學(xué)士

 

  研究方向

1. 利用基因組規(guī)模代謝網(wǎng)絡(luò)模型,,模擬植物代謝過程,預(yù)測限制目標(biāo)代謝物產(chǎn)量的關(guān)鍵反應(yīng),,設(shè)計天然產(chǎn)物的代謝途徑,。

2. 基于大語言模型框架,開發(fā)針對合成通路設(shè)計的人工智能大模型,。


本課題組常年招收博士后和其他科研崗位,,具體招聘信息請點擊http://baixile.com/rczp/zpxx/293732.htm 


Selected Publication

 *Co-first author, #Corresponding author

1. Peng, Q.*, Zhao, C.*, Wang, X., Cheng, K., Wang, C., Xu, X., & Lin, L. (2025). Modeling bacterial interactions uncovers the importance of outliers in the coastal lignin-degrading consortium. Nature Communications, 16(1), 639.

2. Lei, Li., & Zhao, C. (2025). Large language model applications in nucleic acid research. Genomics Communications 2: e003.

3. Gao, Y., & Zhao, C. (2024). Development and applications of metabolic models in plant multi-omics research. Frontiers in Plant Science, 15, 1361183.

4. Wang, Y., Jing, X., Gao, Y., Han, X., Zhao, C.#, & Pan, W.# (2024). Leaf rolling detection in maize under complex environments using an improved deep learning method. Plant Molecular Biology, 114(5), 92.

5. Li, C., Huang, W., Han, X., Zhao, G., Zhang, W., He, W., Nie, B., Chen, X., Zhang, T., Bai, W., Zhang, X., He, J., Zhao, C., Fernie, A., Tschaplinski, T., Yang, X., Yan, S., Wang, L. (2023). Diel dynamics of multi-omics in elkhorn fern provide new insights into weak CAM photosynthesis. Plant Communications, 4(5).

6. Zhao, C., Kim, Y., Zeng, Y., Li, M., Wang, X., Hu, C., ... & Yuan, J. S. (2018). Co-compartmentation of terpene biosynthesis and storage via synthetic droplet. ACS synthetic biology, 7(3), 774-781.

7. Zhao, C., Xie, S., Pu, Y., Zhang, R., Huang, F., Ragauskas, A. J., & Yuan, J. S. (2016). Synergistic enzymatic and microbial lignin conversion. Green chemistry, 18(5), 1306-1312.


Patent

1. Yuan JS, Zhao C. The Texas A&M University System. Increasing plant bioproduct yield. World Patent WO2019139616A1. 2019 July 18.


  趙程課題組更新于2025年3月

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