胡冠菁課題組

　　Hu, Guanjing Lab

　　

　　課題組長

胡冠菁， 研究員,，博士生導(dǎo)師,。2006年本科畢業(yè)于北京大學(xué)，2013年博士畢業(yè)于美國愛荷華州立大學(xué)。2013至2020年繼續(xù)在美國愛荷華州立大學(xué)生態(tài),、進(jìn)化及有機(jī)生物學(xué)系Jonathan F. Wendel教授實驗室從事棉屬植物的進(jìn)化遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究,。迄今已發(fā)表SCI期刊論文34篇；以第一或通訊作者（含共同）發(fā)表SCI論文13篇,，單篇最高影響因子14.919,，累計影響因子超過70。近五年來,，發(fā)表SCI期刊論文15篇（第一作者4篇）,，主持國家自然基金面上項目1項；受邀在國際學(xué)術(shù)會議進(jìn)行專題報告4次,，擔(dān)任組織者1次,；兼職擔(dān)任國際期刊編委2項。

　　

　　工作經(jīng)歷

　　2020/09-至今            中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所及（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所,，研究員

　　2018/09-2020/08     美國愛荷華州立大學(xué), 助理科學(xué)家

　　2013/08-2018/08     美國愛荷華州立大學(xué), 博士后

　　

　　學(xué)習(xí)經(jīng)歷

　　2006/09-2013/08       美國愛荷華州立大學(xué)      遺傳學(xué)           博士

　　2002/09-2006/06       北京大學(xué)                       生物技術(shù)       本科

　　

　　研究方向

胡冠菁課題組以棉屬植物重要農(nóng)藝性狀的遺傳解析與育種應(yīng)用為主要研究方向,，采用進(jìn)化系統(tǒng)生物學(xué)方法整合多維度與多組學(xué)研究手段，致力于解析復(fù)雜性狀的遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)與干預(yù)機(jī)制,，為高效精準(zhǔn)育種提供理論依據(jù),。

圍繞棉屬植物進(jìn)化基因組學(xué)和育種，主要開展以下研究工作：（1）棉屬野生種質(zhì)資源的發(fā)掘創(chuàng)新,；（2）重大棉花品種形成及關(guān)鍵農(nóng)藝性狀的遺傳解析。通過對多倍體基因組的細(xì)胞遺傳學(xué)特性,、序列變異,、染色體結(jié)構(gòu)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,、以及動態(tài)表達(dá)譜進(jìn)行系統(tǒng)生物學(xué)分析,，我們將深入探索棉花纖維發(fā)育、棉籽油份合成,、脅迫響應(yīng)等重要生理機(jī)制在馴化改良過程中的演化機(jī)制以及全基因組網(wǎng)絡(luò)調(diào)控基礎(chǔ),。　　

　　

　　Selected Publication

Co-first author(s) indicated with pound “#”, and corresponding author(s) indicated with asterisks “*”

1. Dong, Y., *G. Hu, C.E. Grover, E. R. Miller, *S. Zhu, & *J.F. Wendel. 2022. Parental legacy versus regulatory innovation in salt stress responsiveness of allopolyploid cotton (Gossypium) species. The Plant Journal 111 (3): 872–87.

2. Hu, G., C.E. Grover, D. Yuan, J. Jareczek, Y. Dong, E. Miller, J.L. Conover, *J.F. Wendel. 2021. "Evolution and diversity of the cotton genome" in Cotton Precision Breeding, edited by M.U. Rahman, Y. Zafar and T.Z. Zhang. Springer International Publishing. 2021 June 09. [Invited Book Chapter]

3. Hu, G., C. E. Grover, M. A. I. I. Arick, M. Liu, D. G. Peterson et al., 2020 Homoeologous gene expression and co-expression network analyses and evolutionary inference in allopolyploids. Brief. Bioinform. bbaa35.

4. #Bao, Y., #G. Hu, C. E. Grover, J. Conover, D. Yuan et al., 2019 Unraveling cis and trans regulatory evolution during cotton domestication. Nat. Commun. 10: 5399.

5. Hu, G., and J. F. Wendel, 2018 Cis-trans controls and regulatory novelty accompanying allopolyploidization. New Phytologist 221: 1691–1700.

6. Dong, Y., G. Hu, J. Yu, S. W. Thu, C. E. Grover et al., 2019 Salt‐tolerance diversity in diploid and polyploid cotton (Gossypium) species. Plant J. 101: 1135-1151.

7. #Zhao, B., #J. F. Cao, #G. Hu, Z. W. Chen, L. Y. Wang, X. X. Shangguan, Ling-Jian Wang, Y. B. Mao, T. Z. Zhang, J. F. Wendel, X. Y. Chen. 2018. Core cis-element variation confers subgenome-biased expression of a transcription factor that functions in cotton fiber elongation. New Phytologist 218(3):1061-1075.

8. Hu, G., R. Hovav, C. E. Grover, A. Faigenboim-Doron, N. Kadmon et al., 2016 Evolutionary conservation and divergence of gene co-expression networks in Gossypium (cotton) seeds. Genome Biol. Evol. 8: 3765–3783.

9. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, S. Chen, and J. F. Wendel, 2015 Gene-expression novelty in allopolyploid cotton: a proteomic perspective. Genetics 200: 91–104.

10. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, D. Pathak, S. Chen et al., 2014 Proteomics profiling of fiber development and domestication in upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Planta 240: 1237–1251.

11. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, K. Grupp, S. Chen et al., 2013 Proteomic profiling of developing cotton fibers from wild and domesticated Gossypium barbadense. New Phytol. 200: 570–582.

12. Hu, G., N. L. Houston, D. Pathak, L. Schmidt, J. J. Thelen et al., 2011 Genomically biased accumulation of seed storage proteins in allopolyploid cotton. Genetics 189: 1103–1115.

胡冠菁課題組更新于2023年8月