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研究中心

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陳綺翩課題組

陳綺翩課題組.png

姓名:

陳綺翩 

職稱:

副研究員

電話/傳真:


電子郵件:

[email protected]

實(shí)驗(yàn)室主頁:


研究方向:

主要從事群體遺傳學(xué),基因組學(xué)以及分子演化等研究方向上的研究


 簡歷介紹:


陳綺翩,現(xiàn)任中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所副研究員,。

2014年9月-2021年12月在中山大學(xué)攻讀植物學(xué)博士學(xué)位,。主要從事群體遺傳學(xué),,基因組學(xué)以及分子演化等研究方向上的研究,?;诙辔锓N的基因組數(shù)據(jù),,結(jié)合比較基因組學(xué),、群體遺傳學(xué),、計(jì)算生物學(xué)等方法,研究群體動態(tài)歷史和分子序列演化的適應(yīng)性信號,。目前已發(fā)表SCI論文7篇,,其中以第一作者(含共一)身份在National Science Review、Nature Ecology & Evolution和Nature Communications等期刊發(fā)表論文共3篇,。其他參與作者成果發(fā)表在National Science Review,、New Phytologist 、BMC Plant Biology等期刊上,。


工作經(jīng)歷:

2022/05 -至今          中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所     副研究員

2022/01-2022/04    中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院                             科研助理


教育經(jīng)歷:

2014/08-2021/12    中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院      植物學(xué)           博士研究生

2010/08-2014/06    中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院      生物技術(shù)        本科


 研究領(lǐng)域:


團(tuán)隊(duì)組成:

陳綺翩 (課題組長), 聯(lián)系方式:[email protected]

黃珠清 (科研助理), 聯(lián)系方式:huangzhuqing@caas.cn


研究方向:

檢測適應(yīng)性演化的方法學(xué),、人工選擇和自然選擇下種群的演化規(guī)律。


研究進(jìn)展:

如何在多物種的基因組序列上檢測適應(yīng)性演化是分子演化領(lǐng)域的一個(gè)重要科學(xué)問題,。蛋白編碼基因上的序列演化由遺傳漂變和自然選擇兩種力量同時(shí)驅(qū)動,,如何在考慮多種驅(qū)動力的作用因素下量化正選擇的相對貢獻(xiàn)是分子演化研究一個(gè)難點(diǎn)。我們致力于發(fā)展一個(gè)基于物種群體歷史對正負(fù)選擇強(qiáng)度做系統(tǒng)性檢測的新方法,。


 代表論著:


代表論文:

(1) Xiao Feng#, Qipian Chen#, Weihong Wu, Jiexin Wang, Guohong Li, Shaohua Xu, Shao Shao, Min Liu, Cairong Zhong, Chung-I Wu, Suhua Shi*, Ziwen He*. 2024. Genomic evidence for rediploidization and adaptive evolution following the whole-genome triplication. Nature Communications, 15: 1635(#co-first author).

(2Chen, Qipian, H. Yang, X. Feng, Qingjian Chen, S. Shi*, C-I. Wu*, Z. He*. 2022. Two decades of suspect evidence for adaptive molecular evolution — negative selection confounding positive selection signals. National Science Review, 9:nwab217.

(3) He, Z.#, X. Feng#, Q. Chen#, L. Li#, S. Li, K. Han, Z. Guo, J. Wang, M. Liu, C. Shi, S. Xu, S. Shao, X. Liu, X. Mao, W. Xie, X. Wang, R. Zhang, G. Li, W. Wu, Z. Zheng, C. Zhong, N. Duke, D. Boufford, G. Fan, C-I. Wu, R. Ricklef, S. Shi*. 2022. Evolution of coastal forests based on a full set of mangrove genomes. Nature Ecology & Evolution, 6:738–749 (#co-first author).

(4) Xinfeng Wang; Ziwen He; Zixiao Guo; Ming Yang; Shaohua Xu; Qipian Chen; Shao Shao; Sen Li; Cairong Zhong; Norman C Duke; Suhua Shi. 2022. Extensive gene flow in secondary sympatry after allopatric speciation. National Science Review, 9(12): nwac280.

(5) Xiao Feng; Guohong Li; Shaohua Xu; Weihong Wu; Qipian Chen; Shao Shao; Min Liu; Nan Wang; Cairong Zhong; Ziwen He; Suhua Shi. 2021. Genomic insights into molecular adaptation to intertidal environments in the mangrove Aegiceras corniculatum. New Phytologist, 231(6): 2346-2358.

(6) Feng Xiao; Xu Shaohua; Li Jianfang; Yang Yuchen; Chen Qipian; Lyu Haomin; Zhong Cairong; He Ziwen; Shi Suhua. 2020. Molecular adaptation to salinity fluctuation in tropical intertidal environments of a mangrove tree Sonneratia alba. BMC PLANT BIOLOGY, 20: 178.

(7) J. Li, Y. Yang, Q. Chen, L. Fang, Z. He, W. Guo, S. Qiao, Z. Wang, M. Guo, C. Zhong, R. Zhou*, S. Shi*. 2016. Pronounced genetic differentiation and recent secondary contact in the mangrove tree Lumnitzera racemosa revealed by population genomic analyses. Scientific Reports, 6: 29486.


陳綺翩課題組更新于2024年2月


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