商連光課題組誠聘博士后

商連光課題組介紹

課題組組長商連光研究員,，廣東省杰出青年基金獲得者,，深圳市高層次人才，人社部首批“博士后創(chuàng)新人才支持計劃”入選者,。目前課題組主要從事水稻群體泛基因組,、表觀組、轉(zhuǎn)錄組,、表型組等多組學(xué)大數(shù)據(jù)整合挖掘,，數(shù)據(jù)庫構(gòu)建，解析水稻耐鹽堿等抗逆性狀,、產(chǎn)量等復(fù)雜農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ),，及大數(shù)據(jù)驅(qū)動的設(shè)計育種研究。迄今已在Science等國際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文50余篇,。代表性成果以第一或通訊作者在Cell Research（封面文章）,、Molecular Plant（3篇）、Nucleic Acids Research,、New Phytologist,、Trends in Plant Science、Plant Biotechnology Journal,、JIPB等高水平雜志上共發(fā)表30余篇SCI論文,。獲軟件著作權(quán)2項，審定新品種5個,。擔(dān)任多個高水平SCI期刊審稿人,。

團(tuán)隊前期研究中與多個國內(nèi)外頂尖研究機構(gòu)和大學(xué)建立了良好的合作關(guān)系，積累了豐富的包含野生稻和栽培稻的稻屬核心種質(zhì)資源,、3000余份不同野生稻和栽培稻不同遺傳背景的大規(guī)模遺傳滲入系群體、構(gòu)建了重要通路和家族的突變體庫,、并結(jié)合三代基因組測序繪制了群體規(guī)模最大的超級泛基因組圖譜和多組學(xué)圖譜,。利用超級泛基因組和群體多組學(xué)圖譜挖掘到了大量有育種價值的候選基因位點，具有良好的材料,、大數(shù)據(jù)和功能基因組研究基礎(chǔ),。

一、招聘崗位

招聘需求：博士后2-3名,。將從事水稻大群體基因組學(xué)數(shù)據(jù)的挖掘,、利用野生稻滲入系開展優(yōu)異基因挖掘，或?qū)φn題組已經(jīng)得到的抗逆境脅迫,、產(chǎn)量等性狀的優(yōu)異位點進(jìn)行基因編輯或功能基因組研究,，也可以對自己感興趣的課題結(jié)合本課題組已有材料和研究基礎(chǔ)開展相關(guān)研究。

二,、應(yīng)聘條件

1.已獲得或即將獲得作物遺傳育種學(xué),，基因組學(xué),、生物信息學(xué)、植物營養(yǎng)學(xué),、進(jìn)化生物學(xué)等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位,。如有強烈興趣，其它學(xué)科的博士也可聯(lián)系,。課題組不拘泥于專業(yè)限制,，旨在為博士后創(chuàng)造條件，施展特長,。

2.對課題組研究方向感興趣,，能獨立開展研究。

3.具有良好的中英文閱讀及寫作能力,，能獨立撰寫英文論文,，能熟練掌握相關(guān)領(lǐng)域國際前沿的研究動態(tài)。

4.具有良好的中英文口頭和書面溝通技巧,，以及參與和組織團(tuán)隊工作所必需的技能,。

三、申請方式

請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷,、發(fā)表論文）和代表作以電子郵件形式發(fā)送到 [email protected]，郵件主題請命名為“應(yīng)聘+崗位名稱（例如博士后）+ 姓名”,，若包含附件材料請壓縮成一個命名為上述郵件主題的zip文件發(fā)送,。

對所有應(yīng)聘材料，我們會嚴(yán)格保密,。課題組在收到申請材料一個月內(nèi)會與初審合格者E-mail或電話聯(lián)系,，安排面試，資格審查未通過者,，不再另行告知,。

胡冠菁課題組誠聘博士后

胡冠菁課題組以棉屬植物重要農(nóng)藝性狀的遺傳解析與育種應(yīng)用為主要研究方向，采用進(jìn)化系統(tǒng)生物學(xué)方法整合多維度與多組學(xué)研究手段,，致力于解析復(fù)雜性狀的遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)與干預(yù)機制,，為高效精準(zhǔn)育種提供理論依據(jù)。圍繞棉屬植物進(jìn)化基因組學(xué)和育種,，主要開展以下研究工作：（1）棉屬野生種質(zhì)資源的發(fā)掘創(chuàng)新,；（2）重大棉花品種形成及關(guān)鍵農(nóng)藝性狀的遺傳解析。通過對多倍體基因組的細(xì)胞遺傳學(xué)特性,、序列變異,、染色體結(jié)構(gòu)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,、以及動態(tài)表達(dá)譜進(jìn)行系統(tǒng)生物學(xué)分析,，我們將深入探索棉花纖維發(fā)育,、棉籽油份合成、脅迫響應(yīng)等重要生理機制在馴化改良過程中的演化機制以及全基因組網(wǎng)絡(luò)調(diào)控基礎(chǔ),。

課題組長胡冠菁,， 研究員，博士生導(dǎo)師,。2006年本科畢業(yè)于北京大學(xué),，2013年博士畢業(yè)于美國愛荷華州立大學(xué)。2013至2020年繼續(xù)在美國愛荷華州立大學(xué)生態(tài),、進(jìn)化及有機生物學(xué)系Jonathan F. Wendel教授實驗室從事棉屬植物的進(jìn)化遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究,。迄今已發(fā)表SCI期刊論文34篇；以第一或通訊作者（含共同）發(fā)表SCI論文13篇,，單篇最高影響因子14.919,，累計影響因子超過70。近五年來,，發(fā)表SCI期刊論文15篇（第一作者4篇）,，主持國家自然基金面上項目1項；受邀在國際學(xué)術(shù)會議進(jìn)行專題報告4次,，擔(dān)任組織者1次,；兼職擔(dān)任國際期刊編委2項。

胡冠菁博士2020年9月加入中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所植物基因組研究中心,，其課題組同時隸屬于 “棉花生物學(xué)國家重點實驗室深圳基因組研究中心”,，該中心是基因組所和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所（簡稱“中棉所”）于2018年共建的聯(lián)合研究中心，兼具基因組所在基因組學(xué)與分子育種領(lǐng)域的技術(shù)優(yōu)勢,，以及中棉所“國家重點實驗室,、國家工程實驗室”的平臺優(yōu)勢。

胡冠菁代表性論著：（第一作者#,，通訊作者*）

Co-first author(s) indicated with pound “#”, and corresponding author(s) indicated with asterisks “*”

1. Dong, Y., *G. Hu, C.E. Grover, E. R. Miller, *S. Zhu, & *J.F. Wendel. 2022. Parental legacy versus regulatory innovation in salt stress responsiveness of allopolyploid cotton (Gossypium) species. The Plant Journal 111 (3): 872–87.

2. Hu, G., C.E. Grover, D. Yuan, J. Jareczek, Y. Dong, E. Miller, J.L. Conover, *J.F. Wendel. 2021. "Evolution and diversity of the cotton genome" in Cotton Precision Breeding, edited by M.U. Rahman, Y. Zafar and T.Z. Zhang. Springer International Publishing. 2021 June 09. [Invited Book Chapter]

3. Hu, G., C. E. Grover, M. A. I. I. Arick, M. Liu, D. G. Peterson et al., 2020 Homoeologous gene expression and co-expression network analyses and evolutionary inference in allopolyploids. Brief. Bioinform. bbaa35.

4. #Bao, Y., #G. Hu, C. E. Grover, J. Conover, D. Yuan et al., 2019 Unraveling cis and trans regulatory evolution during cotton domestication. Nat. Commun. 10: 5399.

5. Hu, G., and J. F. Wendel, 2018 Cis-trans controls and regulatory novelty accompanying allopolyploidization. New Phytologist 221: 1691–1700.

6. Dong, Y., G. Hu, J. Yu, S. W. Thu, C. E. Grover et al., 2019 Salt‐tolerance diversity in diploid and polyploid cotton (Gossypium) species. Plant J. 101: 1135-1151.

7. #Zhao, B., #J. F. Cao, #G. Hu, Z. W. Chen, L. Y. Wang, X. X. Shangguan, Ling-Jian Wang, Y. B. Mao, T. Z. Zhang, J. F. Wendel, X. Y. Chen. 2018. Core cis-element variation confers subgenome-biased expression of a transcription factor that functions in cotton fiber elongation. New Phytologist 218(3):1061-1075.

一,、招聘崗位

博士后招收方向

在植物進(jìn)化基因組、功能基因組學(xué)和遺傳育種研究方向,，招收博士后2名,。研究工作以生物信息學(xué)分析為主,，包括（1）綜合運用基因組,、表觀組和轉(zhuǎn)錄組等多組學(xué)技術(shù)，開發(fā)生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和多組學(xué)整合分析方法,；（2）植物基因組功能性元件的鑒定,、調(diào)控解析和進(jìn)化動態(tài)分析；（3）群體遺傳學(xué)單倍型,、結(jié)構(gòu)變異,、表觀變異多樣性挖掘,；（4）馴化與適應(yīng)性進(jìn)化。

二,、研究背景要求

1. 已獲得或即將獲得基因組學(xué)與生物信息學(xué),、進(jìn)化生物學(xué)、群體遺傳學(xué),、作物遺傳育種等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位,；如有強烈興趣，其它學(xué)科的博士也可聯(lián)系,。

2. 分析背景的申請者需有生物信息學(xué),、基因組測序分析或其它組學(xué)(DNA, RNA, ChIP sequencing)分析研究的背景之一；熟悉命令行,、R語言代碼的使用,；能獨立編寫代碼者優(yōu)先；

3. 實驗背景的申請者要有的分子生物學(xué),、高通量測序RNA/DNA提取,、測序文庫制備等相關(guān)經(jīng)驗之一；

4. 計算和實驗背景都具備的申請者優(yōu)先考慮,，兩者具備其一即可申請,；

三、崗位要求

1. 以科學(xué)問題為導(dǎo)向和動力,，既勇于鉆研創(chuàng)新亦能腳踏實地勤勞奮勉,。

2. 具有良好的中英文閱讀及寫作能力。能獨立撰寫英文論文,，能夠熟練跟蹤專業(yè)文獻(xiàn)和掌握相關(guān)領(lǐng)域的國際前沿研究動態(tài),。

3. 具有良好的口頭和書面溝通技巧，以及參與和組織團(tuán)隊工作所必需的技能,。

4. 具備管理和督促完成研究項目的能力,，并能夠根據(jù)研究進(jìn)展發(fā)起與設(shè)計新的研究項目。

四,、申請方式

請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）,、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送到：[email protected],，郵件主題請注明應(yīng)聘“姓名+應(yīng)聘崗位”，應(yīng)聘材料請壓縮成一個以您姓名命名的zip文件以附件發(fā)送,。

所有應(yīng)聘材料我們會仔細(xì)分析并保密,，承諾在收到申請材料的一周內(nèi)回復(fù)，并及時安排面試,。

武志強課題組誠聘博士后

課題組組長武志強,，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員,，博士生導(dǎo)師。2012年博士畢業(yè)于中國科學(xué)院植物研究所,，2012-2019期間先后在瑞典于默奧大學(xué),，美國德州理工大學(xué)，美國愛荷華州立大學(xué)和美國科羅拉多州立大學(xué)從事基因組變異,，細(xì)胞器突變機理和細(xì)胞核質(zhì)互作的研究,，目前同時開展嶺南花卉基因組學(xué)與分子育種研究，在Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A,、Molecular Biology and Evolution,、Plant Biotechnology Journal、Briefings in Bioinformatics,、Horticulture Research,、The Plant Journal、aBiotech等國際期刊發(fā)表論文50余篇,，獲廣東省珠江人才青年項目,、深圳市優(yōu)青項目，農(nóng)科院青年英才稱號等,。

武志強代表性論著：（第一作者#,，通訊作者*）

Co-first author(s) indicated with pound “#”, and corresponding author(s) indicated with asterisks “*”

1. Wenchuang He, Kunli Xiang, Caijin Chen, Jie Wang, Zhiqiang Wu*. Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based on a graph-based framework. Briefings in Bioinformatics. 2023. 24(1): bbac522.

2. Yi Zou, Weidong Zhu, Daniel B. Sloan, Zhiqiang Wu*. Long-read sequencing characterizes detailed patterns of mitochondrial and plastid genome variants in Arabidopsis msh1 mutants. The Plant Journal. 2022. 112(3):738-755.

3. Zhiqiang Wu#, Gus Waneka#, Amanda K Broz#, Connor R King, Daniel B Sloan*. MSH1 is required for maintenance of the low mutation rates in plant mitochondrial and plastid genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 2020. 117(28):16448-16455.

4. Zhiqiang Wu, Daniel B Sloan, Colin W Brown, Mónica Rosenblueth, Jeffrey D Palmer, Han Chuan Ong*. Mitochondrial retroprocessing promoted functional transfers of rpl5 to the nucleus in grasses. Molecular Biology and Evolution. 2017. 34 (9):2340–2354.

5.      Zhqiang Wu, Cuthbert JM, Taylor DR, Sloan DB. The massive mitochondrial genome of the angiosperm Silene noctiflora is evolving by gain or loss of entire chromosomes. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 2015.112 (30): 10185–10191. (Science雜志對本文進(jìn)行了報道).

1. Zhiqiang Wu*, Xuezhu Liao, Xiaoni Zhang, Luke R. Tembrock, Amanda Broz. Genomic architectural variation of plant mitochondria—A review of multichromosomal structuring. Journal of Systematics and Evolution.2022. 60(1):160–168.

2. Xiaoni Zhang, Shengnan Lin, Dan Peng, Quanshu Wu, Xuezhu Liao, Kunli Xiang, Zehao Wang, Luke R. Tembrock, Mohammed Bendahmane, Manzhu. Bao, Zhiqiang Wu*, Xiaopeng Fu*. Integrated multi-omic data and analyses reveal the pathways underlying key ornamental traits in carnation flowers. Plant Biotechnology Journal. 2022. 20:1182–1196.

3. Lan Lan, Huiqi Zhao, Suxia Xu, Shenglong Kan, Xiaoni Zhang, Weichao Liu, Xuezhu Liao, Luke R Tembrock, Yonglin Ren, Wayne Reeve, Jun Yang, Zhiqiang Wu*. A high-quality Bougainvillea genome provides new insights into the evolutionary history and pigment biosynthetic pathways in the Caryophyllales. Horticulture Research. 2023. uhad124, https://doi.org/10.1093/hr/uhad124

4. Xuezhu Liao#, Yuanjun Ye#, Xiaoni Zhang#, Dan Peng, Mengmeng Hou, Gaofei Fu, Jianjun Tan, Jianli Zhao, Rihong Jiang, Yechun Xu, Jinmei Liu, Jinliang Yang, Wusheng Liu, Luke R. Tembrock, Genfa Zhu*, Zhiqiang Wu*. The genomic and bulked segregant analysis of Curcuma alismatifolia revealed its diverse bract pigmentation. aBIOTECH. 2022. 3(3):178-196.

5. Zhou Hong, Dan Peng, Luke R. Tembrock, Xuezhu Liao, Daping Xu, Xiaojin Liu, Zhiqiang Wu*. Chromosome-level genome assemblies from two sandalwood species provide insights into the evolution of the Santalales. Communications Biology. 2023. 6:587.

一、招聘崗位

根據(jù)團(tuán)隊工作需求,，擬面向基因組學(xué),、功能基因組、園藝學(xué),、遺傳育種,、分子生物學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)等方向招收博士后3-6名,。

二,、申請方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷,、論文發(fā)表等）以電子郵件方式發(fā)送至：[email protected],。

郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請博士后”。

所有應(yīng)聘材料我們將會嚴(yán)格保密,，課題組會在收到申請的兩周內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系,，安排面試。

陶永富課題組誠聘博士后

課題組組長陶永富博士,，2009年本科畢業(yè)于吉林大學(xué),，2014年獲得中國農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳育種博士學(xué)位,。2014至2022在澳大利亞昆士蘭大學(xué)從事高粱遺傳育種工作,、先后任職博士后和研究員,。2023年入職中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳基因組學(xué)研究所，獲得國家級青年人才支持,。迄今已在國際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文20余篇,，其中近五年以第一作者或共同第一作者在Nature Plants、Nature Communications,、Molecular Plant,、Trends in Plant Science、Plant Biotechnology Journal,、Plant Journal等期刊上發(fā)表論文十多篇,。

課題組以高粱遺傳育種為主要研究方向。高粱抗干旱,、耐高溫,，耐鹽堿和土壤瘠薄，是邊際土地的優(yōu)良“拓荒者”,。挖掘高粱抗逆境脅迫基因,，探究其分子作用機理對于抗逆境脅迫育種 保障糧食安全至關(guān)重要。課題組前期收集了一個野生高粱NAM群體和一個上千份材料的自然群體,，旨在利用這些種質(zhì)資源,，通過多組學(xué)手段解析高粱適應(yīng)逆境脅迫的遺傳基礎(chǔ)，挖掘高粱高產(chǎn)和抗逆性的優(yōu)良基因,，探究高粱高產(chǎn)和逆境脅迫響應(yīng)的分子調(diào)控機理,。課題組前期研究中積累了良好的研究基礎(chǔ)和廣泛的國內(nèi)與國際合作關(guān)系。期待你的加入共同探索高粱高產(chǎn)抗逆的奧秘,。

代表性論文：

1. Tao Yongfu*, Hong Luo*, Jiabao Xu*, Alan Cruickshank, Xianrong Zhao, Fei Teng, Adrian Hathorn, Xiaoyuan Wu, Yuanming Liu, Tracey Shatte, David Jordan#, Haichun Jing#, Emma Mace# (2021). Extensive variation within the pan-genome of cultivated and wild sorghum. Nature Plants. 7 6, 766-773.

2. Tao Yongfu, Trusov Yuri, Zhao Xianrong, Wang Xuemin, Cruickshank Alan, Hunt Colleen, van Oosterom Erik, Hathorn Adrian, Liu Guoquan, Ian Godwin, Botella Jose, Mace Emma and Jordan David. Manipulating assimilate availability provides insight into the genes controlling grain size in sorghum. Plant Journal. 108 (1).

3. Tao, Yongfu, Zhao, Xianrong, Wang, Xuemin, Hathorn, Adrian, Hunt, Colleen, Cruickshank, Alan, van Oosterom, Erik, Godwin, Ian, Mace, Emma and Jordan, David. (2020) Large-scale GWAS in sorghum reveals common genetic control of grain size among cereals. Plant Biotechnology Journal, 18 4: 1093-1105

4. Tao, Yongfu, Zhao, Xianrong, Mace, Emma, Henry, Robert and Jordan, David (2019) Exploring and exploiting pan-genomics for crop improvement. Molecular Plant, 12 2: 156-169.

5. Tao, Yongfu, Jordan, David and Mace, Emma. (2019) Crop genomics goes beyond a single reference genome. Trends in Plant Science, 24 12.

6. Liu Qingcai*, Deng Suining*, Liu Baoshen*, Tao Yongfu*, Ai Haiyue, Liu Jianju, Zhang Yongzhong, Zhao Yan, and Xu Mingliang (2020) A helitron-induced RabGDIα variant causes quantitative recessive resistance to maize rough dwarf disease. Nature Communications, 11 495.

一,、招聘崗位

招聘需求：博士后1-2名。將借助課題組積累的遺傳材料,，利用宏基因組分析手段解析高粱非生物逆境脅迫響應(yīng),，挖掘參與根際微生物調(diào)控逆境響應(yīng)的重要基因，探究遺傳機制和作物遺傳改良,。

二,、應(yīng)聘條件

1. 已獲得或即將獲得微生物學(xué)，生物信息學(xué)方向的博士學(xué)位,。如有強烈興趣,，其它學(xué)科的博士也可聯(lián)系。課題組不拘泥與專業(yè)限制,，旨在為博士后創(chuàng)造條件,，施展特長。

2. 對課題組研究方向感興趣，能獨立開展研究,。

3. 具有良好的中英文閱讀及寫作能力,，能獨立撰寫英文論文，能熟練掌握相關(guān)領(lǐng)域國際前沿的研究動態(tài),。

4. 具有良好的中英文口頭和書面溝通技巧,，以及參與和組織團(tuán)隊工作所必需的技能。

三,、申請方式

請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷、發(fā)表論文）和代表作以電子郵件形式發(fā)送到 [email protected],，郵件主題請命名為“應(yīng)聘+崗位名稱（例如博士后）+ 姓名”,，若包含附件材料請壓縮成一個命名為上述郵件主題的zip文件發(fā)送。

對所有應(yīng)聘材料,，我們會嚴(yán)格保密,。課題組在收到申請材料一個月內(nèi)會與初審合格者E-mail或電話聯(lián)系，安排面試,，資格審查未通過者,，不再另行告知。

周永鋒課題組誠聘博士后

課題組長簡介

周永鋒,，研究員,，博士生導(dǎo)師，國家海外優(yōu)青,，中國農(nóng)科院領(lǐng)軍人才,，深圳市海外高層次人才。主要利用多組學(xué)大數(shù)據(jù)整合分析,、群體遺傳學(xué),、數(shù)量遺傳學(xué)、機器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)算法等,，解析重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的有益變異,、有害變異與結(jié)構(gòu)變異的群體遺傳動態(tài)特征，在葡萄中實踐全基因組人工智能設(shè)計育種,。主持國家自然科學(xué)基金海外優(yōu)青項目和面上項目等,。迄今已在國際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文50余篇，近五年以第一作者或通訊作者在Nature Plants,、PNAS,、MBE等雜志發(fā)表SCI論文20余篇，擔(dān)任PNAS,、Nature Plants,、Nature Communications,、MBE等期刊審稿人，歐盟科學(xué)研究基金（ERC）評委,，Horticulture Research副主編,，Journal of Integrative Agriculture、Agriculture communications,、《果樹學(xué)報》等期刊編委成員，SMBE,、GSA,、ISHS、ESEB等學(xué)會會員,。

我國農(nóng)業(yè)未來將面臨重大挑戰(zhàn),，一方面，人口急劇增長而耕地面積逐年減少,，另一方面,，全球正在以驚人的速度變暖。種質(zhì)創(chuàng)新是推動我國農(nóng)業(yè)發(fā)展的核心動力,，而全基因組設(shè)計育種是實現(xiàn)種質(zhì)創(chuàng)新的重要手段,。本課題組通過結(jié)合多組學(xué)大數(shù)據(jù)、群體遺傳學(xué),、數(shù)量遺傳學(xué)以及氣候環(huán)境等大數(shù)據(jù),，應(yīng)用機器學(xué)習(xí)與人工智能算法，檢測關(guān)鍵農(nóng)藝性狀相關(guān)的適應(yīng)性變異,、有害變異與結(jié)構(gòu)變異,。更進(jìn)一步，實踐葡萄全基因組人工智能設(shè)計育種,。圍繞作物群體遺傳學(xué)與葡萄智能設(shè)計育種,，主要開展以下工作：

（1）葡萄等作物的群體遺傳學(xué)和數(shù)量遺傳學(xué)；

（2）葡萄及其野生近緣種的種質(zhì)資源收集,、保存,、評價與創(chuàng)新；

（3）解析葡萄重要農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)與調(diào)控網(wǎng)絡(luò),；

（4）機器學(xué)習(xí)與葡萄全基因組設(shè)計育種,。

研究進(jìn)展

團(tuán)隊擬通過利用群體基因組學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué),，以及多組學(xué)整合分析等方法,，實現(xiàn)篩選重要農(nóng)藝性狀、指導(dǎo)未來育種的目的,。針對上述問題,，我們開展了一系列的研究：

（1）基于群體遺傳學(xué)研究,，揭示了葡萄、水稻等作物的“馴化成本”,，首次闡釋了有害變異和結(jié)構(gòu)變異在葡萄中的凈化選擇作用,；

（2）全球范圍內(nèi)收集并評價了葡萄栽培和野生種質(zhì)資源10,000多份，創(chuàng)建葡萄種質(zhì)資源圃,，應(yīng)用群體遺傳學(xué)研究葡萄馴化,、氣候適應(yīng)性，以及瀕危種群的保護(hù),；

（3）利用多組學(xué)整合的手段,，闡釋了葡萄重要農(nóng)藝性狀的相關(guān)機理，如果性別決定,、種子敗育,、果實大小、果皮顏色,、糖酸以及可溶性固形物含量,、風(fēng)味物質(zhì)形成，以及抗蟲抗病調(diào)控,；

（4）構(gòu)建了首個葡萄完整參考基因組（PN_T2T）,；應(yīng)用機器學(xué)習(xí)和群體遺傳學(xué)方法，挖掘了葡萄基因組中的有害變異和結(jié)構(gòu)變異,；初步建立了基于機器學(xué)習(xí)的葡萄多性狀全基因組選擇平臺,。

代表性成果

1. Xiao H, Liu ZJ, Wang N, Long QM, Cao S, Huang GZ, Liu WW, Peng YL, Riaz S, Walker AM, Gaut BS#, & Zhou YF# 2023. Adaptive and maladaptive introgression in grapevine domestication. PNAS. 10.1073/pnas.2222041120.

2. Wang N, Cao S, Liu Z, Xiao H, Hu J, Xu X, Chen P, Ma Z, Ye J, Chai L, et al. Zhou YF# &  Deng XX#2023. Genomic conservation of crop wild relatives: A case study of citrus. PLoS Genetics19:e1010811.

3. Shi X, Cao S, Wang X, Huang S, Wang Y, Liu Z, Liu W, Leng X, Peng Y, Wang N ... & Zhou YF# 2023.The complete reference genome for grapevine (Vitis vinifera L.) genetics and breeding。 Horticulture Research (Cover). uhad061.

4. Kou Y, Liao Y, Toivainen T, Lv Y, Tian X, Emerson JJ, Gaut BS*, Zhou YF*. 2020. Evolutionary genomics of structural variation in Asian rice (Oryza sativa) domestication. Molecular Biology and Evolution 37:3507–3524.

5. Zhou YF*, Gaut BS*. 2020. Large chromosomal variants drive adaptation in sunflowers. Nature Plants 6:734–735.

6. Zhou YF, Minio A, Solares E, Lyu Y, Cantu D#& Gaut BS# (2019) Population genetics of structural variation in grapevine domestication. Nature Plants, 5, 965–979.

7. Gaut BS, Seymour D, Liu QP, & Zhou YF# (2018) Demography and its effects on genomic variation in crop domestication. Nature Plants. 4: 512–520.

8. Zhou YF, Massonnet M, Sanjak J, Cantu D, & Gaut BS# (2017) Evolutionary genomics of grape (Vitis vinifera ssp. vinifera) domestication. PNAS 114: 11715-11720.

9. Zhou YF, Zhang LR, Liu JQ, Wu GL, Savolainen O* (2014) Climatic adaptation and ecological divergence between two closely related pines species in Southeast China. Molecular Ecology 23: 3504–3522.

10. Zhou YF (2014) Demographic history and climatic adaptation in ecological divergence between two closely related parapatric pine species. Acta Universitatis Ouluensis. A, Scientiae rerum naturalium, ISSN: 0355-3191.

11. Zhou YF, Abbott RJ, Jiang ZY, Du, FK, Milne RI, Liu JQ (2010) Gene flow and species delimitation: a case study of two pine species with overlapping distributions in southeast China. Evolution 64: 2342- 2352.

一,、招聘崗位

在遺傳學(xué),、數(shù)量遺傳學(xué)、群體遺傳學(xué),，植物學(xué),、作物學(xué)、園藝學(xué),，統(tǒng)計學(xué),、計算生物學(xué)等相關(guān)研究方向，擬招聘博士后3-5名,。將從事分子生物學(xué)實驗和生物信息學(xué)分析,，聯(lián)合分析基因組和表觀組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，為深入解析關(guān)鍵農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)提供理論依據(jù)并開發(fā)相關(guān)分析方法,，并開展葡萄育種研究,。

二、應(yīng)聘條件

1. 熱愛科研,，有理想,，并樂于為理想而腳踏實地的奮斗,；

2. 具有良好的中英文閱讀及寫作能力。能獨立撰寫英文論文,，能熟練掌握相關(guān)領(lǐng)域國際前沿的研究動態(tài),；

3. 具有良好的中英文口頭和書面溝通技巧，以及參與和組織團(tuán)隊工作所必需的技能,；

4. 具備管理和督促完成研究項目的能力,，并能夠根據(jù)研究進(jìn)展發(fā)起與設(shè)計新的研究項目；

5. 已獲得或即將獲得遺傳學(xué),、生物信息學(xué),、數(shù)量遺傳學(xué)、植物學(xué),、作物遺傳育種,、統(tǒng)計學(xué)等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位,；如有強烈興趣,，其它學(xué)科的博士也可聯(lián)系。

三,、應(yīng)聘方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）,、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected],，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請職位名稱”。研究所會仔細(xì)分析并保密所有申請資料,，并在收到申請的一個月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系,，安排面試；資格審查未通過者,，不再另行告知,。

汪鴻儒課題組誠聘博士后

汪鴻儒團(tuán)隊長期關(guān)注進(jìn)化遺傳學(xué)理論和方法，并基于水稻等多種生物模式,，開展了實證性研究,。主要研究興趣是解析基因組自然變異模式，結(jié)合群體遺傳學(xué)和分子生物學(xué)手段,，解析重要性狀自然變異的遺傳基礎(chǔ),，并揭示其演化規(guī)律。近五年以第一作者或共同第一作者在Nature,、Genome Research,、Science Advances、Plant Cell等高水平期刊發(fā)表多篇論文,。研究詳見ResearchGate 或Google Scholar個人主頁,。

全球氣候變化是未來農(nóng)業(yè)的重大挑戰(zhàn),，課題組目前以稻屬為模式，深入挖掘和利用時空適應(yīng)性自然變異,，旨在培育氣候適應(yīng)型品種,。并通過克服雜種不親和，拓展育種上可用自然變異的邊界,。研究方向包括：（1）基于泛基因組圖譜和古DNA技術(shù)手段,，解析稻屬時空基因組自然變異；（2）雜種不親和的遺傳和演化機制,。

代表性成果

1.Wang, H. *, Yang, M. *, Wangdui, S., Lu, H. *, et al. (2023). Human genetic history on the Tibetan Plateau in the last 5,100 years. Science Advances, in press.

2.Zhang, W. *, Wang, H. *, Brandt, D.Y.C., et al.(2022). The genetic architecture of phenotypic diversity in the Betta fish (Betta splendens). Science Advances 8, eabm4955.

3.Niu, M. *, Wang, H. *, Yin, W., et al. (2022). Rice DWARF AND LOW-TILLERING and the homeodomain protein OSH15 interact to regulate internode elongation via orchestrating brassinosteroid signaling and metabolism. Plant Cell 34, 3754-3772.

4.Liu, Y.*, Wang, H.*, Jiang, Z., et al. (2021). Genomic basis of geographical adaptation to soil nitrogen in rice. Nature 590, 600-605.

5.Wang, H*., Vieira, F.G*., Crawford, J.E., Chu, C., and Nielsen, R. (2017). Asian wild rice is a hybrid swarm with extensive gene flow from domesticated rice. Genome Research 27, 1029-1038. (封面文章)

6.Wang, H.*, Xu, X.*, Vieira, F.G., Xiao, Y., Li, Z., Wang, J., Nielsen, R., and Chu, C. (2016). The power of inbreeding: NGS based GWAS of rice reveals convergent evolution during rice domestication. Molecular Plant 9, 975-985. (封面文章)

（同等貢獻(xiàn)第一作者）

一,、招聘崗位

在基因組學(xué)、進(jìn)化生物學(xué),，群體遺傳學(xué),、計算生物學(xué)、分子生物學(xué)等相關(guān)研究方向,，招聘博士后2名,。

將從事組學(xué)數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析，新方法的開發(fā)或應(yīng)用,。鑒定適應(yīng)性自然變異,，為育種提供靶點?；谌后w變異模式,，研究植物物種系統(tǒng)演化規(guī)律，重構(gòu)作物的馴化和傳播,?；蛘哧P(guān)注某一重要適應(yīng)性表型，通過組學(xué)數(shù)據(jù)驅(qū)動,，開展分子生物學(xué)和遺傳學(xué)實驗,，進(jìn)行適應(yīng)性基因和變異的精準(zhǔn)鑒定和功能研究。

二,、崗位要求

1. 對課題組研究方向感興趣,，有很強的自我驅(qū)動能力，能獨立開展研究,。

2. 具有良好的中英文閱讀及寫作能力,。能獨立撰寫英文論文，能熟練掌握相關(guān)領(lǐng)域國際前沿的研究動態(tài),。以第一作者發(fā)表過SCI論文,。

3. 具有良好的中英文口頭和書面溝通技巧，以及參與和組織團(tuán)隊工作所必需的技能,。

4. 已獲得或即將獲得遺傳學(xué),、生物信息學(xué),、數(shù)量遺傳學(xué)、作物遺傳育種,、統(tǒng)計學(xué)等相關(guān)專業(yè)的博士學(xué)位,。

三、申請方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷,、論文發(fā)表）、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected],，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請職位名稱”,。

課題組會仔細(xì)分析并保密所有申請資料，并在收到申請的一個月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系,，安排面試,；資格審查未通過者，不再另行告知,。

博士后薪資待遇

1. 按照深圳市相關(guān)規(guī)定,，博士后在站期間享受在站博士后生活補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn),。

2. 根據(jù)深圳市大鵬新區(qū)政策,，博士后可申請新區(qū)“鵬程計劃”科技人才評聘,，優(yōu)秀博士后可參評D類崗位,；特別優(yōu)秀的，可參評C類崗位,。

3. 按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的工資,、五險一金和績效待遇。

4. 符合條件的,，可申請"博士后創(chuàng)新人才支持計劃",、"博士后國際交流計劃派出項目、引進(jìn)項目",、廣東省海外博士后人才支持項目,、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士后"優(yōu)農(nóng)計劃"，在站期間可申報"中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院優(yōu)秀博士后"評審,，入選者給予獎金獎勵,。

5. 博士后人員進(jìn)站后，可選擇落戶深圳市,，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶,。

6. 符合條件的博士后可申請評定專業(yè)技術(shù)資格。

7. 深圳市對出站博士后留深工作,、簽訂3年勞動合同的,，給予30萬元資助,，用于科研投入或創(chuàng)業(yè)前期費用。

8. 提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費,，配備研究需要的設(shè)備和儀器,，科研方向給予較高自由度。