Yuwen Liu課題組簡介

Yuwen Liu,，研究員,、博士生導(dǎo)師,。入選國家重大人才工程（青年）,、廣東省高層次人才（青年）,、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類,、深圳市高層次人才B類,，深圳市“青年五四獎(jiǎng)?wù)?/span>”獲得者,。2006年于清華大學(xué)本科畢業(yè),，2014年在芝加哥大學(xué)取得博士學(xué)位。Yuwen Liu研究員在基因組和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域有著十多年的科學(xué)研究經(jīng)歷,，在學(xué)術(shù)研究上擅長開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法,，從非編碼調(diào)控區(qū)入手解析經(jīng)濟(jì)動(dòng)物復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)，以及基于細(xì)胞調(diào)控線路設(shè)計(jì)的合成生物學(xué)育種,。以第一作者（含并列第一）和通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Biology,，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平雜志上共發(fā)表文章7篇，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊發(fā)表十余篇文章,，Google Scholar總引用1000多次,。開發(fā)了首次直接測量定位全基因組高通量增強(qiáng)子的WHG-STARR-Seq、首次測定了上萬GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對增強(qiáng)子功能影響的allele-specific STARR-Seq和首次將增強(qiáng)子,、DNA變異整合分析拓展到新生突變的統(tǒng)計(jì)算法TADA-Annotation,。在產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上，開發(fā)了基于靶向二代測序的伴侶動(dòng)物基因檢測液相芯片,，可以通過品系鑒定,，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率，獲批三項(xiàng)國家專利,，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬元進(jìn)行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化,。開發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測序數(shù)據(jù)的基因型分型計(jì)算方法,，領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動(dòng)物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺(tái)，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強(qiáng),，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名,，并以此平臺(tái)依托基因組所孵化中農(nóng)芯躍分子育種公司。現(xiàn)主持十四五國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題,、國家自然科學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目,、國家自然科學(xué)面上項(xiàng)目以及深圳科創(chuàng)委面上項(xiàng)目共4項(xiàng)，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目,、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研計(jì)劃共2項(xiàng),。

研究方向：

主要專注于開發(fā)新的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的增強(qiáng)子定位和功能,，非編碼區(qū)DNA變異如何通過影響增強(qiáng)子功能而影響生物性狀,，以及如何通過人工設(shè)計(jì)調(diào)控增強(qiáng)子等調(diào)控元件改變生物性狀，方法具有普遍適用性,，同時(shí)在解析豬產(chǎn)肉性狀遺傳機(jī)制解析中進(jìn)行深入應(yīng)用,。具體研究方向包括：

1.結(jié)合基因型數(shù)據(jù)，表型數(shù)據(jù)和多組學(xué)功能注釋數(shù)據(jù),，解析GWAS信號和選擇進(jìn)化信號,，從而挖掘影響性狀的重要調(diào)控元件和基因；

2.開發(fā)高通量實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法,，在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面,，鑒定影響增強(qiáng)子功能的DNA變異，并以此為切入點(diǎn),，挖掘影響性狀的關(guān)鍵基因,；

3.開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，結(jié)合高通量調(diào)控元件數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)控元件序列底層邏輯的解析,，優(yōu)化和設(shè)計(jì)新一代調(diào)控元件和細(xì)胞線路,，通過合成生物學(xué)手段為性狀改良提供基因功能模塊；

4.開發(fā)低成本高密度的新一代基因型檢測方法,，開發(fā)結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)和深度學(xué)習(xí)的全基因組選育方法和精細(xì)定位方法,，協(xié)助推進(jìn)畜牧動(dòng)物品種選育和性狀改良。

課題組科研氣氛良好,，指導(dǎo)老師會(huì)為每一個(gè)成員根據(jù)其自身興趣和特點(diǎn)設(shè)定培養(yǎng)方案,，因材施教，并根據(jù)成員日后發(fā)展需求盡力提供各種資源,。課題組成員團(tuán)結(jié)互助,，凝聚力強(qiáng)，為新人的融入提供了友好且有力的支撐環(huán)境。再此,，我們歡迎對國家民族發(fā)展有擔(dān)當(dāng),，對科技創(chuàng)新有熱情，愿意接受挑戰(zhàn)的志同道合之士加入我們,。讓我們共同努力,，立德立言，無問西東,。

一,、招聘崗位

根據(jù)團(tuán)隊(duì)工作需要,，擬面向動(dòng)物遺傳育種與繁殖,、生物信息學(xué)、功能基因組等方向招聘副研究員1名,。

二,、應(yīng)聘條件

1.近三年以第一作者或共同第一作者（排名第一位）發(fā)表中科院一區(qū)及以上的SCI論文至少2篇。

2.對設(shè)計(jì)課題和申請項(xiàng)目有充足的經(jīng)驗(yàn),。

3.對科研有濃厚的興趣,，具有科研創(chuàng)新能力，勤于思考,，能獨(dú)立開展課題研究,，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團(tuán)隊(duì)合作,。有良好的溝通能力和中英文科技寫作能力,。

4.可選擇方向包括：（1）產(chǎn)生多組學(xué)數(shù)據(jù)解析生豬經(jīng)濟(jì)性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（2）開發(fā)和利用高通量方法定量海量調(diào)控元件活性,，探索調(diào)控元件的時(shí)空特異性以及和環(huán)境的互作,，并與生信分析人員合作通過人工智能手段設(shè)計(jì)符合需求的調(diào)控元件和細(xì)胞調(diào)控線路。（3）在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面,，開發(fā)高通量調(diào)控元件活性定量方法,，與生信分析人員合作結(jié)合群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)解析復(fù)雜性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（4）開發(fā)方法高通量定量植物調(diào)控元件活性,，通過優(yōu)化表達(dá)載體,，優(yōu)化植物底盤生產(chǎn)高附加值蛋白的效率。

三,、薪資待遇

1.出站博士后后優(yōu)先考慮,，待遇為年薪稅前30-50萬元/年，同時(shí)可享受研究所其他非薪資類績效和獎(jiǎng)勵(lì),。

2.符合相關(guān)人才條件,，可依托基因組所申請廣東省、深圳市人才生活補(bǔ)貼。

3.遴選入職后可選擇落戶深圳市,，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶,。

4.遴選入職后，符合條件可依托掛靠研究中心開展科研工作,。符合條件可申請中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃培育項(xiàng)目,，享受中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃待遇。

四,、申請方式

申請者請將個(gè)人簡歷（包含教育經(jīng)歷,、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表,、國內(nèi)外任職證明,、個(gè)人最高學(xué)術(shù)水平成果、項(xiàng)目,、專利證書和獎(jiǎng)勵(lì)等）,、代表作、未來計(jì)劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected],，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+崗位”,。

應(yīng)聘者材料將嚴(yán)格保密，并在通過簡歷篩選者將安排面試,，未進(jìn)入面試者,，不再另行告知。

工作地點(diǎn)：深圳市大鵬新區(qū)布新路97號,。