Yuwen Liu課題組簡(jiǎn)介

Yuwen Liu，研究員、博士生導(dǎo)師。入選國(guó)家重大人才工程（青年）、廣東省高層次人才（青年）、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類(lèi)、深圳市高層次人才B類(lèi)，深圳市“青年五四獎(jiǎng)?wù)隆鲍@得者。2006年于清華大學(xué)本科畢業(yè)，2014年在芝加哥大學(xué)取得博士學(xué)位。Yuwen Liu研究員在基因組和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域有著十多年的科學(xué)研究經(jīng)歷，在學(xué)術(shù)研究上擅長(zhǎng)開(kāi)發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，從非編碼調(diào)控區(qū)入手解析經(jīng)濟(jì)動(dòng)物復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)，以及基于細(xì)胞調(diào)控線(xiàn)路設(shè)計(jì)的合成生物學(xué)育種。以第一作者（含并列第一）和通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Biology，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平雜志上共發(fā)表文章7篇，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊發(fā)表十余篇文章，Google Scholar總引用1000多次。開(kāi)發(fā)了首次直接測(cè)量定位全基因組高通量增強(qiáng)子的WHG-STARR-Seq、首次測(cè)定了上萬(wàn)GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對(duì)增強(qiáng)子功能影響的allele-specific STARR-Seq和首次將增強(qiáng)子、DNA變異整合分析拓展到新生突變的統(tǒng)計(jì)算法TADA-Annotation。在產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上，開(kāi)發(fā)了基于靶向二代測(cè)序的伴侶動(dòng)物基因檢測(cè)液相芯片，可以通過(guò)品系鑒定，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率，獲批三項(xiàng)國(guó)家專(zhuān)利，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬(wàn)元進(jìn)行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化。開(kāi)發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的基因型分型計(jì)算方法，領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動(dòng)物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺(tái)，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強(qiáng)，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名，并以此平臺(tái)依托基因組所孵化中農(nóng)芯躍分子育種公司。現(xiàn)主持十四五國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題、國(guó)家自然科學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)面上項(xiàng)目以及深圳科創(chuàng)委面上項(xiàng)目共4項(xiàng)，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研計(jì)劃共2項(xiàng)。

研究方向：

主要專(zhuān)注于開(kāi)發(fā)新的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的增強(qiáng)子定位和功能，非編碼區(qū)DNA變異如何通過(guò)影響增強(qiáng)子功能而影響生物性狀，以及如何通過(guò)人工設(shè)計(jì)調(diào)控增強(qiáng)子等調(diào)控元件改變生物性狀，方法具有普遍適用性，同時(shí)在解析豬產(chǎn)肉性狀遺傳機(jī)制解析中進(jìn)行深入應(yīng)用。本次招聘生信科研助理從事生物信息學(xué)分析，不一定需要算法開(kāi)發(fā)能力。具體研究方向包括：

1.結(jié)合基因型數(shù)據(jù)，表型數(shù)據(jù)和多組學(xué)功能注釋數(shù)據(jù)，解析GWAS信號(hào)和選擇進(jìn)化信號(hào)，從而挖掘影響性狀的重要調(diào)控元件和基因；

2.開(kāi)發(fā)高通量實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面，鑒定影響增強(qiáng)子功能的DNA變異，并以此為切入點(diǎn)，挖掘影響性狀的關(guān)鍵基因（本次招聘生信科研助理從事相關(guān)方向的生物信息學(xué)分析，不一定需要算法開(kāi)發(fā)能力）；

3.開(kāi)發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，結(jié)合高通量調(diào)控元件數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)控元件序列底層邏輯的解析，優(yōu)化和設(shè)計(jì)新一代調(diào)控元件和細(xì)胞線(xiàn)路，通過(guò)合成生物學(xué)手段為性狀改良提供基因功能模塊（本次招聘生信科研助理從事相關(guān)方向的生物信息學(xué)分析，不一定需要算法開(kāi)發(fā)能力）；；

4.開(kāi)發(fā)低成本高密度的新一代基因型檢測(cè)方法，開(kāi)發(fā)結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)和深度學(xué)習(xí)的全基因組選育方法和精細(xì)定位方法，協(xié)助推進(jìn)畜牧動(dòng)物品種選育和性狀改良（本次招聘生信科研助理從事相關(guān)方向的生物信息學(xué)分析，不一定需要算法開(kāi)發(fā)能力）。

課題組科研氣氛良好，指導(dǎo)老師會(huì)為每一個(gè)成員根據(jù)其自身興趣和特點(diǎn)設(shè)定培養(yǎng)方案，因材施教，并根據(jù)成員日后發(fā)展需求盡力提供各種資源。課題組成員團(tuán)結(jié)互助，凝聚力強(qiáng)，為新人的融入提供了友好且有力的支撐環(huán)境。再此，我們歡迎對(duì)國(guó)家民族發(fā)展有擔(dān)當(dāng)，對(duì)科技創(chuàng)新有熱情，愿意接受挑戰(zhàn)的志同道合之士加入我們。讓我們共同努力，立德立言，無(wú)問(wèn)西東。

一、招聘崗位

根據(jù)團(tuán)隊(duì)工作需要，擬招聘科研助理1名。

二、崗位需求

1.獲得碩士研究生及以上學(xué)歷，專(zhuān)業(yè)包含但不限于分子生物學(xué)、生物化學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)等，具有相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn)本科亦可。

2.負(fù)責(zé)環(huán)狀RNA相關(guān)探究，具有較強(qiáng)的分子實(shí)驗(yàn)?zāi)芰Α⒘己玫睦斫饽芰ΓJ(rèn)同并熱愛(ài)基因組學(xué)研究工作。

3.以主要參與人完成環(huán)狀RNA相關(guān)探究?jī)?yōu)先；發(fā)表方法學(xué)學(xué)術(shù)論文者優(yōu)先。

4.完成上級(jí)交付的其它相關(guān)工作。

三、薪資待遇

1. 月薪為7000元-13000元，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個(gè)人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險(xiǎn)一金。符合條件的可選擇落戶(hù)深圳市，并且享受深圳市人才生活和租房補(bǔ)貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

3. 本團(tuán)隊(duì)在多組學(xué)整合分析，基因組選擇算法開(kāi)發(fā)和應(yīng)用，深度學(xué)習(xí)算法和開(kāi)發(fā)有多名博后和博士組成的團(tuán)隊(duì)，科研助理可以在團(tuán)隊(duì)的幫助下迅速得到提高和成長(zhǎng)。

4. 提供良好的科研環(huán)境，有機(jī)會(huì)發(fā)表文章、推薦到國(guó)內(nèi)外知名高校和科研單位深造學(xué)習(xí)（目前課題組培養(yǎng)出了3名科研助理，都拿到了海內(nèi)外著名高校科研機(jī)構(gòu)的博士offer）。

四、申請(qǐng)方式

申請(qǐng)者請(qǐng)將個(gè)人簡(jiǎn)歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表、國(guó)內(nèi)外任職證明、個(gè)人最高學(xué)術(shù)水平成果、項(xiàng)目、專(zhuān)利證書(shū)和獎(jiǎng)勵(lì)等）、代表作、未來(lái)計(jì)劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected]，郵件主題和材料壓縮文件請(qǐng)注明“姓名+科研助理”。

應(yīng)聘者材料將嚴(yán)格保密，并在通過(guò)簡(jiǎn)歷篩選者將安排面試，未進(jìn)入面試者，不再另行告知。

工作地點(diǎn)：深圳市大鵬新區(qū)布新路97號(hào)。