Yuwen Liu課題組簡介

Yuwen Liu,，研究員,、博士生導(dǎo)師,。入選國家重大人才工程（青年）,、廣東省高層次人才（青年）,、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類,、深圳市高層次人才B類,，深圳市“青年五四獎?wù)?/span>”獲得者,。2006年于清華大學(xué)本科畢業(yè),，2014年在芝加哥大學(xué)取得博士學(xué)位,。Yuwen Liu研究員在基因組和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域有著十多年的科學(xué)研究經(jīng)歷，在學(xué)術(shù)研究上擅長開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計算方法,，從非編碼調(diào)控區(qū)入手解析經(jīng)濟(jì)動物復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ),，以及基于細(xì)胞調(diào)控線路設(shè)計的合成生物學(xué)育種,。以第一作者（含并列第一）和通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Biology，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平雜志上共發(fā)表文章7篇,，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊發(fā)表十余篇文章,，Google Scholar總引用1000多次。開發(fā)了首次直接測量定位全基因組高通量增強(qiáng)子的WHG-STARR-Seq,、首次測定了上萬GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對增強(qiáng)子功能影響的allele-specific STARR-Seq和首次將增強(qiáng)子,、DNA變異整合分析拓展到新生突變的統(tǒng)計算法TADA-Annotation。在產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上,，開發(fā)了基于靶向二代測序的伴侶動物基因檢測液相芯片,，可以通過品系鑒定，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率,，獲批三項(xiàng)國家專利,，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬元進(jìn)行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化。開發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測序數(shù)據(jù)的基因型分型計算方法,，領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺,，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強(qiáng)，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名,，并以此平臺依托基因組所孵化中農(nóng)芯躍分子育種公司?，F(xiàn)主持十四五國家重點(diǎn)研發(fā)計劃課題、國家自然科學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目,、國家自然科學(xué)面上項(xiàng)目以及深圳科創(chuàng)委面上項(xiàng)目共4項(xiàng),，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研計劃共2項(xiàng),。

研究方向：

主要專注于開發(fā)新的實(shí)驗(yàn)和計算方法,，研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的增強(qiáng)子定位和功能，非編碼區(qū)DNA變異如何通過影響增強(qiáng)子功能而影響生物性狀,，以及如何通過人工設(shè)計調(diào)控增強(qiáng)子等調(diào)控元件改變生物性狀,，方法具有普遍適用性，同時在解析豬產(chǎn)肉性狀遺傳機(jī)制解析中進(jìn)行深入應(yīng)用,。具體研究方向包括：

1.結(jié)合基因型數(shù)據(jù),，表型數(shù)據(jù)和多組學(xué)功能注釋數(shù)據(jù)，解析GWAS信號和選擇進(jìn)化信號,，從而挖掘影響性狀的重要調(diào)控元件和基因,；

2.開發(fā)高通量實(shí)驗(yàn)和計算方法，在動物體內(nèi)和單細(xì)胞層面,，鑒定影響增強(qiáng)子功能的DNA變異，并以此為切入點(diǎn),，挖掘影響性狀的關(guān)鍵基因,；

3.開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計算方法,，結(jié)合高通量調(diào)控元件數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)控元件序列底層邏輯的解析，優(yōu)化和設(shè)計新一代調(diào)控元件和細(xì)胞線路,，通過合成生物學(xué)手段為性狀改良提供基因功能模塊,；

4.開發(fā)低成本高密度的新一代基因型檢測方法，開發(fā)結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)和深度學(xué)習(xí)的全基因組選育方法和精細(xì)定位方法,，協(xié)助推進(jìn)畜牧動物品種選育和性狀改良,。

課題組科研氣氛良好，指導(dǎo)老師會為每一個成員根據(jù)其自身興趣和特點(diǎn)設(shè)定培養(yǎng)方案,，因材施教,，并根據(jù)成員日后發(fā)展需求盡力提供各種資源。課題組成員團(tuán)結(jié)互助,，凝聚力強(qiáng),，為新人的融入提供了友好且有力的支撐環(huán)境。再此,，我們歡迎對國家民族發(fā)展有擔(dān)當(dāng),，對科技創(chuàng)新有熱情，愿意接受挑戰(zhàn)的志同道合之士加入我們,。讓我們共同努力,，立德立言，無問西東,。

一,、招聘崗位

根據(jù)團(tuán)隊(duì)工作需要，擬面向動物遺傳育種與繁殖,、生物信息學(xué),、功能基因組等方向招聘科研助理2-3名、實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員2-3名,。

二,、應(yīng)聘條件

科研助理（基因組選擇或生信品種鑒定）

1. 具有碩士研究生及以上學(xué)歷，有經(jīng)驗(yàn)本科亦可,，專業(yè)包含但不限于生物信息學(xué),、統(tǒng)計學(xué)、生物學(xué)等,，具有相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn)學(xué)歷可放寬條件,。

2.具有良好的理解能力，良好的編程能力,，認(rèn)同并熱愛基因組學(xué)研究或者算法開發(fā)工作,。

3.以主要參與人完成一款生物信息學(xué)（或其他學(xué)科）算法軟件者優(yōu)先；發(fā)表方法學(xué)學(xué)術(shù)論文者優(yōu)先。

4.基因組選擇方向：負(fù)責(zé)多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析,，負(fù)責(zé)基因組選擇方法開發(fā),；或生信品種鑒定方向：負(fù)責(zé)利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行品種鑒定，負(fù)責(zé)品種鑒定相關(guān)分析方法及流程研發(fā),。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作,。

實(shí)驗(yàn)室技術(shù)員

1.具有碩士研究生及以上學(xué)歷，有經(jīng)驗(yàn)者本科亦可,。

2.熟練掌握pcr分子實(shí)驗(yàn)技術(shù),，熟悉二代測序技術(shù)。

3.精通常見高通量建庫原理,，流程,，熟悉常規(guī)建庫方法。

4.負(fù)責(zé)二代測序項(xiàng)目的建立工作,；優(yōu)化開發(fā),，逐步建立高效低價的自動化建庫流程；負(fù)責(zé)相關(guān)設(shè)備的保養(yǎng)與維護(hù),；負(fù)責(zé)NGS相關(guān)檢測服務(wù)和產(chǎn)品研發(fā),。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作。

三,、薪資待遇

科研助理

1. 7000~15000元/月,，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險一金,。

3. 提供良好的科研環(huán)境,，有機(jī)會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學(xué)習(xí),。

實(shí)驗(yàn)室技術(shù)員

1. 7000~15000元/月,，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險一金,。

3. 提供良好的科研環(huán)境,，有機(jī)會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學(xué)習(xí),。

四,、申請方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷,、論文發(fā)表,、國內(nèi)外任職證明、個人最高學(xué)術(shù)水平成果,、項(xiàng)目,、專利證書和獎勵等）,、代表作、未來計劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected],，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+崗位”,。

應(yīng)聘者材料將嚴(yán)格保密，并在通過簡歷篩選者將安排面試,，未進(jìn)入面試者，不再另行告知,。

工作地點(diǎn)：深圳市大鵬新區(qū)布新路97號,。