Yuwen Liu課題組簡介

Yuwen Liu，研究員、博士生導(dǎo)師。入選國家重大人才工程（青年）、廣東省高層次人才（青年）、中國農(nóng)業(yè)科學院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類、深圳市高層次人才B類，深圳市“青年五四獎?wù)?/span>”獲得者。2006年于清華大學本科畢業(yè)，2014年在芝加哥大學取得博士學位。Yuwen Liu研究員在基因組和表觀遺傳學領(lǐng)域有著十多年的科學研究經(jīng)歷，在學術(shù)研究上擅長開發(fā)實驗和計算方法，從非編碼調(diào)控區(qū)入手解析經(jīng)濟動物復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)，以及基于細胞調(diào)控線路設(shè)計的合成生物學育種。以第一作者（含并列第一）和通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Biology，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平雜志上共發(fā)表文章7篇，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊發(fā)表十余篇文章，Google Scholar總引用1000多次。開發(fā)了首次直接測量定位全基因組高通量增強子的WHG-STARR-Seq、首次測定了上萬GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對增強子功能影響的allele-specific STARR-Seq和首次將增強子、DNA變異整合分析拓展到新生突變的統(tǒng)計算法TADA-Annotation。在產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上，開發(fā)了基于靶向二代測序的伴侶動物基因檢測液相芯片，可以通過品系鑒定，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率，獲批三項國家專利，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬元進行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化。開發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測序數(shù)據(jù)的基因型分型計算方法，領(lǐng)導(dǎo)團隊開發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名，并以此平臺依托基因組所孵化中農(nóng)芯躍分子育種公司。現(xiàn)主持十四五國家重點研發(fā)計劃課題、國家自然科學青年科學基金項目、國家自然科學面上項目以及深圳科創(chuàng)委面上項目共4項，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項目、中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程重大科研計劃共2項。

研究方向：

主要專注于開發(fā)新的實驗和計算方法，研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的增強子定位和功能，非編碼區(qū)DNA變異如何通過影響增強子功能而影響生物性狀，以及如何通過人工設(shè)計調(diào)控增強子等調(diào)控元件改變生物性狀，方法具有普遍適用性，同時在解析豬產(chǎn)肉性狀遺傳機制解析中進行深入應(yīng)用。具體研究方向包括：

1.結(jié)合基因型數(shù)據(jù)，表型數(shù)據(jù)和多組學功能注釋數(shù)據(jù)，解析GWAS信號和選擇進化信號，從而挖掘影響性狀的重要調(diào)控元件和基因；

2.開發(fā)高通量實驗和計算方法，在動物體內(nèi)和單細胞層面，鑒定影響增強子功能的DNA變異，并以此為切入點，挖掘影響性狀的關(guān)鍵基因；

3.開發(fā)實驗和計算方法，結(jié)合高通量調(diào)控元件數(shù)據(jù)進行調(diào)控元件序列底層邏輯的解析，優(yōu)化和設(shè)計新一代調(diào)控元件和細胞線路，通過合成生物學手段為性狀改良提供基因功能模塊；

4.開發(fā)低成本高密度的新一代基因型檢測方法，開發(fā)結(jié)合多組學數(shù)據(jù)和深度學習的全基因組選育方法和精細定位方法，協(xié)助推進畜牧動物品種選育和性狀改良。

課題組科研氣氛良好，指導(dǎo)老師會為每一個成員根據(jù)其自身興趣和特點設(shè)定培養(yǎng)方案，因材施教，并根據(jù)成員日后發(fā)展需求盡力提供各種資源。課題組成員團結(jié)互助，凝聚力強，為新人的融入提供了友好且有力的支撐環(huán)境。再此，我們歡迎對國家民族發(fā)展有擔當，對科技創(chuàng)新有熱情，愿意接受挑戰(zhàn)的志同道合之士加入我們。讓我們共同努力，立德立言，無問西東。

一、招聘崗位

根據(jù)團隊工作需要，擬面向動物遺傳育種與繁殖、生物信息學、功能基因組等方向招聘科研助理2-3名、實驗室技術(shù)人員2-3名。

二、應(yīng)聘條件

科研助理（基因組選擇或生信品種鑒定）

1. 具有碩士研究生及以上學歷，有經(jīng)驗本科亦可，專業(yè)包含但不限于生物信息學、統(tǒng)計學、生物學等，具有相關(guān)工作經(jīng)驗學歷可放寬條件。

2.具有良好的理解能力，良好的編程能力，認同并熱愛基因組學研究或者算法開發(fā)工作。

3.以主要參與人完成一款生物信息學（或其他學科）算法軟件者優(yōu)先；發(fā)表方法學學術(shù)論文者優(yōu)先。

4.基因組選擇方向：負責多組學數(shù)據(jù)整合分析，負責基因組選擇方法開發(fā)；或生信品種鑒定方向：負責利用生物信息學方法進行品種鑒定，負責品種鑒定相關(guān)分析方法及流程研發(fā)。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作。

實驗室技術(shù)員

1.具有碩士研究生及以上學歷，有經(jīng)驗者本科亦可。

2.熟練掌握pcr分子實驗技術(shù)，熟悉二代測序技術(shù)。

3.精通常見高通量建庫原理，流程，熟悉常規(guī)建庫方法。

4.負責二代測序項目的建立工作；優(yōu)化開發(fā)，逐步建立高效低價的自動化建庫流程；負責相關(guān)設(shè)備的保養(yǎng)與維護；負責NGS相關(guān)檢測服務(wù)和產(chǎn)品研發(fā)。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作。

三、薪資待遇

科研助理

1. 7000~15000元/月，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險一金。

3. 提供良好的科研環(huán)境，有機會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學習。

實驗室技術(shù)員

1. 7000~15000元/月，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險一金。

3. 提供良好的科研環(huán)境，有機會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學習。

四、申請方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表、國內(nèi)外任職證明、個人最高學術(shù)水平成果、項目、專利證書和獎勵等）、代表作、未來計劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：[email protected]，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+崗位”。

應(yīng)聘者材料將嚴格保密，并在通過簡歷篩選者將安排面試，未進入面試者，不再另行告知。

工作地點：深圳市大鵬新區(qū)布新路97號。