8月18日，由全國畜牧總站主辦的2023畜禽種業(yè)發(fā)展論壇在太原盛大開幕。由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所及佛山鯤鵬現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院唐中林研究員團(tuán)隊主導(dǎo)的豬基因組組裝成果在論壇上發(fā)布,。

豬基因組組裝成果發(fā)布會現(xiàn)場

團(tuán)隊采用PacBio HiFi,、Hi-C、PacBio ISO-seq等最新測序方法和Hifiasm,、NextPolish,、Purge Haplotigs等最新組裝技術(shù)，組裝的藏豬和香豬（從江香豬）參考基因組具有連續(xù)性好,、完整性及準(zhǔn)確性高等優(yōu)點(diǎn),。

藏豬（CZ）、香豬（XP）和杜洛克（Duroc）基因組共線性圖

新組裝豬基因組與已發(fā)表豬基因組連續(xù)性對比

基因組組裝質(zhì)量評價

據(jù)悉,，2021年,，全國畜牧總站組織國內(nèi)的優(yōu)勢科研隊伍，開展豬,、牛,、羊、雞,、鴨,、鵝等我國特有品種的參考基因組構(gòu)建專題工作，日前經(jīng)國內(nèi)權(quán)威專家論證,，已經(jīng)完成藏豬,、香豬參考基因組的構(gòu)建。

實(shí)施畜禽精準(zhǔn)鑒定項(xiàng)目中參考基因組組裝專題,，是實(shí)現(xiàn)畜禽種業(yè)振興行動目標(biāo)的重要舉措之一,。藏豬、香豬參考基因組的建立,，不僅為獲取本品種更多的遺傳信息,，深入解析其獨(dú)特優(yōu)勢，挖掘特色優(yōu)質(zhì)基因,，助推本品種開發(fā)利用奠定基礎(chǔ),，也為研究我國地方豬優(yōu)異的遺傳特性，提供了具有自主知識產(chǎn)權(quán)的中國坐標(biāo),、中國標(biāo)準(zhǔn),，對開展畜禽基因組研究、特有經(jīng)濟(jì)性狀解析,、分子遺傳改良實(shí)施和種質(zhì)資源創(chuàng)制具有重要意義,。

畜禽分子坐標(biāo)項(xiàng)目專題工作推進(jìn)會

唐中林研究員團(tuán)隊合照