近日，

2022年“深圳青年五四獎章”評選結果公布,，

基因組所組學技術研究中心榮獲深圳青年五四獎章,。

（部分獲獎名單截圖）

“深圳青年五四獎章”是共青團深圳市委員會和深圳市青年聯(lián)合會聯(lián)合設立的授予深圳市優(yōu)秀青年個人及先進青年集體的最高榮譽，旨在樹立政治進步,、品德優(yōu)秀、貢獻突出的青年典型,，反映當代青年的精神品格和價值追求,。

本次獲獎的基因組所組學中心，團隊平均年齡僅有33歲,，現(xiàn)有博士28人,，碩士10人，本科7人,，黨員比例達46%,，多項研究成果發(fā)表在Nature、Cell,、Nature Genetics,、Nature Methods、Nature Plants,、Nature Communications等國際頂級期刊,，是一支涵蓋“國家優(yōu)秀青年基金”、農科院“領軍人才”“青年英才”“深圳市高層次人才”,，并獲得“國家優(yōu)秀青年基金”的優(yōu)秀集體,。

一、扎根深圳,，聚集人才

自2014年以來,，基因組所迎來一批從事基因組學前沿技術研究的優(yōu)秀青年科學家，樊偉,、阮玨等研究員先后從北京大學,、中國科學院、清華大學,、美國加州大學,、澳大利亞昆士蘭大學等國內外知名高校和科研院所來到深圳，組學技術研究中心自此成立,。2016年,，國際水稻所（IRRI）資深科學家葉國友加入團隊并成立課題組。

（阮玨 團隊合影）

（葉國友 團隊合影）

目前組學中心已從國內外引進45名科研人員，其中博士28人,，碩士10人,，本科7人，具有正高級職稱人員8名,。人才引進工作獲得深圳市認可,，2人獲得深圳市國家級領軍人才，1人獲得深圳鵬程孔雀特聘崗位B類,，7人獲得深圳市海外高層次人才,，8人獲得深圳市后備級人才，另有1人獲得農業(yè)農村部“杰出青年農業(yè)科學家”,，1人獲得農科院“領軍人才”,，5人獲得農科院“青年英才”，1人獲得廣東省青年五四獎章,，1人獲得深圳市優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才優(yōu)秀青年基礎研究,，1人獲得深圳市優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才博士基礎研究啟動，1人獲得2020年度深圳市優(yōu)秀共青團員,。團隊成員先后承擔國家重點研發(fā)計劃項目課題（1項）,、國家自然基金委優(yōu)秀青年項目（1項）、面上項目（6項）,、青年基金（5項）,、廣東省基礎與應用基礎研究青年基金（1項）等支持。中心人才主體支撐了農業(yè)農村部農業(yè)基因數(shù)據分析重點實驗室,、農業(yè)基因組表型分析與利用深圳市重點實驗室,、中國農業(yè)科學院分子生物學專業(yè)公共實驗室的建設與運行，成果先后入選中國農業(yè)科學院2018,、2020年度十大科技進展,，中國農業(yè)科學院2021年度十大重大發(fā)現(xiàn)。

二,、探索前沿,，技術突出

共性前沿技術缺失或落后是制約我國農業(yè)發(fā)展的一大障礙。組學技術研究中心圍繞農業(yè)組學技術發(fā)展中的關鍵方向與問題,，聚集國內外優(yōu)秀青年人才,，開發(fā)完善基因組學、轉錄組學,、代謝組學,、宏基因組學、表型組學等測序及分析技術體系,，建設以農業(yè)生物組學數(shù)據為核心的大數(shù)據云計算平臺,。

針對三代長序列組裝,，在理論上提出了適合高噪音長序列的模糊布魯因組裝圖，開發(fā)出SMARTdenovo和wtdbg算法,，其中wtdbg突破了組裝速度落后于測序速度的領域焦點難題,，成為三代測序組裝的主流算法，還被用來評測最新測序技術 （HiFi-reads）的組裝優(yōu)勢,。

（wtdbg2發(fā)表文章截圖）

針對植物基因組組裝中的高重復,、高雜合和多倍型等技術難題，開發(fā)出ALLHiC算法,，解決了高重復的性染色體,、高雜合二倍體和同源多倍體染色體分型，實現(xiàn)了多倍體分型組裝從0到1的突破,，為動植復雜基因組項目提供了有效的算法工具和解決方案,。

（ALLHiC算法流程和功能模塊）

針對DNA/RNA復合結構R-loop的檢測難題，開發(fā)了具備高分辨率和鏈特異的R-loop測序技術,，首次繪制了擬南芥全基因組 R-loop 動態(tài)變化圖譜，并揭示了R-loop在細胞重編程過程中的變化規(guī)律及調控功能,。

上述技術創(chuàng)新成果獲得了學術領域的廣泛認可,。以方法學為主的學術論文發(fā)表在Nature Methods、Genome Biology,、Nature Plants,、Bioinformatics等國內外知名期刊。其中wtdbg的方法學論文（Nature Methods）獲評“2020年中國百篇最具影響國際學術論文”,、“Springer Nature出版社 2020 年度生物醫(yī)學領域中國科研高影響力論文”,、“2020年度中國生物信息學十大進展”。

三,、服務農業(yè),，成果顯著

良種繁育是農業(yè)發(fā)展的重要環(huán)節(jié)，其核心便是種質資源的創(chuàng)新與利用,。因此,，種質資源基因組的深入解析是加速育種進程的重要基礎與支撐。團隊利用自主研發(fā)算法完成多個重要農林作物的基因組學研究,，對3000份水稻重測序分析闡述優(yōu)良性狀相關的基因,；完成重要林木植物榕樹基因組并揭示其性別決定和演化；構建高質量龍井43和鐵觀音茶樹基因組揭示茶樹演化和馴化歷史,；完成首個同源多倍體甘蔗染色體水平組裝,；完成入侵物種薇甘菊高染色體水平的參考基因組的構建并揭示了薇甘菊在全球入侵過程中的環(huán)境適應性進化和快速生長的分子機制；為“優(yōu)薯計劃”提供技術指導,。相關學術成果發(fā)表在Nature,、Cell、Nature Genetics、Nature Communications等國際期刊發(fā)表論文數(shù)十篇,，多項研究成果先后入選“2019年度中國農業(yè)科學重大進展”“2020年度中國生物信息學十大進展”“2020年中國植物科學若干領域重要研究進展”“中國農業(yè)科學院2021年度十大重大科學發(fā)現(xiàn)”“2021年度中國生命科學十大進展”,。

作為研究所重要的技術支撐，承擔基因組所超算平臺的運行,，目前超算平臺計算能力500TFLops,，存儲能力17PB。與中國科學院遺傳發(fā)育研究所,、華南農業(yè)大學等數(shù)家單位組建國家農業(yè)基因組科技創(chuàng)新聯(lián)盟單位,，協(xié)同進行農業(yè)基因組核心關鍵技術攻關，在獨腳金內酯調控機制,、茶樹基因組,、薇甘菊基因組、優(yōu)薯計劃等研究中取得了重大進展,。

四,、不忘初心，圓夢組學

中心45名科研人員,，平均年齡33周歲,，黨員比例46%。支部建在中心上,，2019年4月中心成立科研黨支部,，組織學習習近平新時代中國特色社會主義思想，開展“不忘初心,、牢記使命”主題教育,，以組學技術研究為本、以國家“糧食安全"重大需求為導向,，持續(xù)開展具有自主知識產權的技術研發(fā)工作,。其中阮玨研究員榮獲第二十一屆“廣東青年五四獎章”，劉海琳博士榮獲“2020年深圳市優(yōu)秀共青團員”,。