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【南方工報(bào)】廣東科學(xué)家編寫出水稻基因類型“字典

2023-02-20 04:32:13來源:

【字體:

  

2月15日,,南方工報(bào)刊登了基因組所在水稻研究方面取得的重要成果,。

以下是報(bào)道全文:


保障國家糧食安全的第一步就是擁有自主產(chǎn)權(quán)的種子,如何更加高質(zhì)高效地創(chuàng)造出新的種質(zhì),?廣東深圳有一群科研人員給出了答案一“水稻超級(jí)泛基因組圖譜”創(chuàng)新研究成果,。2月8日,,記者來到了位于深圳市大鵬新區(qū)的中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所(以下簡(jiǎn)稱“基因組所”),探尋該研究成果的創(chuàng)新之路。為了更好地研究稻屬的遺傳變異,,收集到足夠有代表性的材料,,團(tuán)隊(duì)科研人員從2016年就啟動(dòng)了這項(xiàng)研究,并完成了材料收集工作,,同時(shí)開始解碼它們的基因組,,構(gòu)建超級(jí)泛基因組?!皥D譜本身的繪制就耗費(fèi)了4年多的時(shí)間,,直到2021年7月才最終完成?!痹谡n題組實(shí)驗(yàn)室內(nèi),,該研究項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、基因組所研究員商連光對(duì)記者說道,。


科學(xué)研究并非一蹴而就,。項(xiàng)目啟動(dòng)以來,每年臨近水稻豐收的季節(jié),,正值深圳最炎熱的8,、9月份,此時(shí)也是研究人員最忙碌的時(shí)候,,在位于深圳大鵬新區(qū)的中國農(nóng)科院深圳綜合試驗(yàn)基地的農(nóng)田里,,總能看到他們勞作的身影?!爱?dāng)時(shí)我們每天都會(huì)藏著草帽,、穿著白大褂去稻田里觀察水稻的生長(zhǎng)狀態(tài),進(jìn)行水稻雜交等相關(guān)研究工作,,一待就是一整天,。還常常被前來參加科普學(xué)習(xí)的小朋友誤認(rèn)為是農(nóng)民伯伯?!被蚪M所助理研究員賀慧英回憶道,。


記者了解到,近些年水稻培育更側(cè)重于高產(chǎn),,導(dǎo)致其“多樣性”持續(xù)減少,,丟失了很多重要的基因,比抗病,、抗蟲,、抗旱、營(yíng)養(yǎng)高效等,。為了找回丟失的基因,,該研究項(xiàng)目選取的樣本材料多達(dá)251份,,為此,研究人員還需要到全國,、甚至全球多地進(jìn)行樣本的種植與采集,常年出差對(duì)于他們來說已是家常便飯,,正常休假更是一種奢求,。


讓商連光印象深刻的是,2021年春節(jié),,恰逢第一版本泛基因組完成的前夕,,平均年齡不到30歲的團(tuán)隊(duì)成員,為了早日完成該圖譜,,都主動(dòng)選擇堅(jiān)守崗位,。“水稻是在勞動(dòng)節(jié)期間播種,,國慶節(jié)期間收獲,,所以,基本上休長(zhǎng)假都與我無緣,?!鄙踢B光說道。


據(jù)了解,,在水稻基因組學(xué)研究上,,我國一直走在世界前列。2002年中國科學(xué)家獨(dú)立繪制完成了水稻基因組序列,,這也是人類第一次解碼水稻基因組序列,。5年間我國科學(xué)家已完成構(gòu)建了4個(gè)水稻泛基因組。賀慧英介紹,,泛基因組是一個(gè)物種內(nèi)所有基因組信息的總和,,相比單一參考基因組包含了更多的遺傳多樣性。超級(jí)泛基因組圖譜可以理解為是一本基因類型的“字典”,,利用這本“字典”,,可以很清楚地看到哪個(gè)品種里面帶著什么基因,從而快速地聚合育種,。


商連光表示,,接下來,團(tuán)隊(duì)將在超級(jí)泛基因組的基礎(chǔ)上,,系統(tǒng)評(píng)價(jià)水稻表型數(shù)據(jù),,快速系統(tǒng)挖掘影響水稻重要性狀的基因,通過分子設(shè)計(jì)育種,,培育出新的水稻品種,,進(jìn)一步為廣東農(nóng)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展貢獻(xiàn)力量,。


創(chuàng)新成效

商連光課題組從全球44個(gè)國家精心選擇了251份水稻材料,并對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,,同時(shí)利用自主研發(fā)的全基因組組裝軟件(WTDBG),,幫助快遞高效地組裝基因組,最終繪制出了迄今為止植物研究中群體規(guī)模最大的,、基因信息解碼最充分的,、稻屬中最為系統(tǒng)的超級(jí)泛基因組圖譜。有了超級(jí)泛基因組,,就可以快速克隆基因并聚合,,創(chuàng)造出新的種質(zhì),對(duì)于保障我國的糧食安全具有重要意義,。2022年10月,,該研究成果以封面文章的形式登上國際頂級(jí)期刊《細(xì)胞研究(Cell Research)》。


研究者說

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員商連光:“下一步,,我將繼續(xù)致力于水稻基因組學(xué)與設(shè)計(jì)育種方向的研究工作,,為加速完成將更多優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn),、廣適,、綠色水稻的良種材料把握在自已手中的使命貢獻(xiàn)力量。同時(shí),,希望利用超級(jí)泛基因組設(shè)計(jì)的新水稻品種能夠早日和大家見面,。”



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