11月15日，基因組所豬基因組設計育種創(chuàng)新團隊在《公共科學圖書館：遺傳學(PLoS Genetics)》上在線發(fā)表了題為“The genome variation and developmental transcriptome maps reveal genetic differentiation of skeletal muscle in pigs”的研究論文，揭示了中國地方豬和西方瘦肉型豬在產肉性狀及骨骼肌生長發(fā)育中的差異分子調控機制,，為豬的分子設計育種提供了重要理論依據,。

生豬是我國農業(yè)支柱產業(yè)之一。我國養(yǎng)豬歷史悠久,，擁有豐富的豬遺傳資源，也是世界上最大的生豬養(yǎng)殖和豬肉消費國。西方瘦肉型豬和我國地方豬在產肉性狀（肉產量和品質）上差異巨大,，且具有互補性。我國地方豬具有肉細嫩多汁,、口感好等優(yōu)點,，但存在生長緩慢、瘦肉率低等不足,。西方瘦肉型豬雖然生長快,、瘦肉率高，但肉質不如我國地方豬品種,。因此,，揭示我國地方豬和西方瘦肉型豬產肉性狀差異的遺傳基礎，有助于我國地方豬的資源保護,、開發(fā)利用以及新品種（配套系）培育,。

圖| 通城豬和長白豬骨骼肌發(fā)育的轉錄調控比較

本研究采用比較發(fā)育遺傳學方法，分析了中國脂肪型-通城豬和西方瘦肉型-長白豬27個生長發(fā)育階段骨骼肌的轉錄組,，系統(tǒng)解析了豬骨骼肌生長發(fā)育過程中的轉錄調控事件,。研究發(fā)現中外豬種骨骼肌生長發(fā)育不同步，肌細胞增殖,、葡萄糖代謝和ATP酶活性等的差異是導致兩者產肉性狀差異的關鍵,。結合全基因組變異分析，鑒定得到多個調控豬產肉性狀的關鍵編碼基因（SATB2等）和非編碼基因（miR-24-3p,，XLOC_036765等）,。本研究為豬的分子育種提供了重要候選基因和位點，將對我國地方豬優(yōu)質種質資源的開發(fā)利用,，打贏種業(yè)翻身仗和培養(yǎng)擁有自主知識產權的豬新品種（系）具有重要價值,。

基因組所楊亞嵐副研究員、博士生閆君宇（已畢業(yè)）,、博士生范新浩以及香港城市大學陳佳星博士為論文共同第一作者,，基因組所唐中林研究員,、李奎教授和香港城市大學李帥成副教授為共同通訊作者。該研究得到國家自然科學基金重點項目,、中國農業(yè)科學院創(chuàng)新工程,、廣東省基礎與應用基礎研究重點項目等的資助。

原文鏈接：https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1009910