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基因組所揭示食蚜蠅捕食和傳粉的特殊進(jìn)化機(jī)制

2022-07-14 11:58:01來源:

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7月6日,,基因組所與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所合作,,在國際知名生物學(xué)雜志《BMC生物學(xué)(BMC Biology)》上在線發(fā)表了題為“Genome of the hoverfly  Eupeodes corollae provides insights into the evolution of predation and pollination in insects”的研究論文。研究首次揭示了昆蟲捕食和傳粉雙重生物學(xué)行為的進(jìn)化機(jī)制,。


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捕食性食蚜蠅屬于雙翅目食蚜蠅科,,是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲。幼蟲是重要的蚜蟲天敵,,成蟲大多具有訪花習(xí)性,,是繼蜜蜂之外的第二大類傳粉昆蟲。研究團(tuán)隊利用Pacbio三代測序,、二代Illumina和Hi-C技術(shù),,對大灰食蚜蠅進(jìn)行了全基因組測序和組裝。大灰食蚜蠅基因組全長595 Mb,,含有23,374個蛋白質(zhì)編碼基因,,重復(fù)序列占51.47%,,其中570.8 Mb的基因組序列被定位到4條染色體上。


大灰食蚜蠅幼蟲和成蟲具有不同的取食習(xí)性,,是研究捕食和傳粉進(jìn)化機(jī)制的寶貴材料,。研究團(tuán)隊通過與一種捕食性食蚜蠅、蚜蟲捕食者瓢蟲,、傳粉者蜜蜂進(jìn)行比較基因組分析,,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn) takeout 基因參與調(diào)節(jié)大灰食蚜蠅幼蟲的取食行為,,胰蛋白酶(trypsin)參與幼蟲對蚜蟲等的消化活動,,糖類轉(zhuǎn)運(yùn)基因和與能量代謝有關(guān)的脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)基因在傳粉行為中發(fā)揮重要作用。另外,,與殺蟲劑代謝有關(guān)的CYP6亞家族的基因擴(kuò)張可能是大灰食蚜蠅維持種群穩(wěn)定的因素之一,。


圖 | 大灰食蚜蠅基因組(A)、比較基因組(B-C)及消化酶相關(guān)基因分析(D)


作為捕食性食蚜蠅的優(yōu)勢種,,大灰食蚜蠅的高質(zhì)量基因組為揭示昆蟲捕食和傳粉的進(jìn)化機(jī)制提供了寶貴的遺傳資源,,研究成果將推動食蚜蠅和其他天敵昆蟲的遺傳適應(yīng)和進(jìn)化機(jī)制的深入研究。


基因組所博士后苑鶴,、博士生高博嘉和助理研究員吳超為該論文的共同第一作者,,基因組所蕭玉濤研究員和植保所吳孔明研究員為共同通訊作者。該研究得到了深圳市基礎(chǔ)研究機(jī)構(gòu)項目,、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程,、國家自然科學(xué)基金等項目的資助。


原文鏈接:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01356-6


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