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農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)

首席科學(xué)家：阮玨

團(tuán)隊(duì)構(gòu)成：阮玨課題組、常玉曉課題組、崔鵬課題組、徐煒課題組、張興坦課題組、邵浩靖課題組、紀(jì)宏超課題組、陳琦翩課題組、樊偉課題組、潘瑋華課題組

研究方向： 研發(fā)組學(xué)算法和測(cè)序方法，致力于解決基因組學(xué)及其他組學(xué)研究中核心方法學(xué)問題。

研究成績(jī)：團(tuán)隊(duì)開發(fā)了三代測(cè)序數(shù)據(jù)組裝的主流算法軟件 SMARTdenovo 和 WTDBG ；開發(fā)出最佳平衡準(zhǔn)確度的體細(xì)胞結(jié)構(gòu)變異檢測(cè)算法 NovoBreak ；在低頻突變檢測(cè)上，連續(xù)開發(fā)了 Droplet-CirSeq、O2N-seq、 微量DNA擴(kuò)增等技術(shù)，將二代測(cè)序錯(cuò)誤率從10-2-10-3水平降低至10-5-10?8水平的同時(shí)，數(shù)據(jù)有效率提高10-30倍；建立了 ribominusRNA-seq (rmRNA-seq) 實(shí)驗(yàn)和分析方法，并應(yīng)用到植物基因可變剪接和植物抗逆的研究；開發(fā)了 NSF-Mate Pair Library 技術(shù)加速大片段DNA文庫構(gòu)建。團(tuán)隊(duì)獨(dú)立研發(fā)的組學(xué)技術(shù)以及與相關(guān)科研院所高校開展的組學(xué)技術(shù)合作項(xiàng)目成果先后發(fā)表在 Nature、Nature Genetics、Nature Methods、Nature Communications 等國(guó)際期刊，在農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研究領(lǐng)域產(chǎn)生重要的影響。團(tuán)隊(duì)先后承擔(dān)了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家優(yōu)秀青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金面上及青年基金項(xiàng)目等國(guó)家級(jí)科研項(xiàng)目。

更新于2025年6月